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Estudo da origem celular do câncer de ovário usando dados genômicos e epigenômicos em larga escala

Processo: 17/08211-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de junho de 2017
Vigência (Término): 31 de maio de 2018
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Houtan Noushmehr
Beneficiário:Marcos Abraão de Souza Fonseca
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:15/07925-5 - Softwares de código aberto contendo ferramentas estatísticas para análise e integração de conjuntos de dados epigenômicos produzidos em alta escala, a fim de decifrar e entender redes reguladoras de câncer, AP.JP
Assunto(s):Epigenômica   Biologia computacional   Sequenciamento de nova geração   Neoplasias ovarianas

Resumo

Esta vaga requer candidato para realizar análises de dados moleculares em larga escala oriundos de diferentes níveis celulares e produzidos por sequenciamento de nova geração o candidato também auxiliará na manutenção de computadores (backups), no armazenamento e no pré-processamento de dados. O candidato deverá ainda apoiar os pesquisadores em seus projetos. O aplicante deve ser capaz de compreender, falar e escrever na língua inglesa.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GUSEV, ALEXANDER; LAWRENSON, KATE; LIN, XIANZHI; LYRA, JR., PAULO C.; KAR, SIDDHARTHA; VAVRA, KEVIN C.; SEGATO, FELIPE; FONSECA, MARCOS A. S.; LEE, JANET M.; PEJOVIC, TANYA; LIU, GANG; KARLAN, BETH Y.; FREEDMAN, MATTHEW L.; NOUSHMEHR, HOUTAN; MONTEIRO, ALVARO N.; PHAROAH, PAUL D. P.; PASANIUC, BOGDAN; GAYTHER, SIMON A.; CONSORTIUM, OVARIAN CAN ASSOC. A transcriptome-wide association study of high-grade serous epithelial ovarian cancer identifies new susceptibility genes and splice variants. Nature Genetics, v. 51, n. 5, p. 815+, MAY 2019. Citações Web of Science: 0.
LAWRENSON, KATE; SONG, FENGJU; HAZELETT, DENNIS J.; KAR, SIDDHARTHA P.; TYRER, JONATHAN; PHELAN, CATHERINE M.; CORONA, ROSARIO I.; RODRIGUEZ-MALAVE, NORMA I.; SEO, JI-HEI; ADLER, EMILY; COETZEE, SIMON G.; SEGATO, FELIPE; FONSECA, MARCOS A. S.; AMOS, CHRISTOPHER I.; CARNEY, MICHAEL E.; CHENEVIX-TRENCH, GEORGIA; CHOI, JIYEOB; DOHERTY, JENNIFER A.; JIA, WEIHUA; JIN, GANG J.; KIM, BYOUNG-GIE; LE, NHU D.; LEE, JUYEON; LI, LIAN; LIM, BOON K.; ADENAN, NOOR A.; MIZUNO, MIKA; PARK, BOYOUNG; PEARCE, CELESTE L.; SHAN, KANG; SHI, YONGYONG; SHU, XIAO-OU; SIEH, WEIVA; THOMPSON, PAMELA J.; WILKENS, LYNNE R.; WEI, QINGYI; WOO, YIN L.; YAN, LI; KARLAN, BETH Y.; FREEDMAN, MATTHEW L.; NOUSHMEHR, HOUTAN; GOODE, ELLEN L.; BERCHUCK, ANDREW; SELLERS, THOMAS A.; TEO, SOO-HWANG; ZHENG, WEI; MATSUO, KEITARO; PARK, SUE; CHEN, KEXIN; PHAROAH, PAUL D. P.; GAYTHER, SIMON A.; GOODMAN, MARC T.; GRP, AUSTRALIAN OVARIAN CANC STUDY. Genome-wide association studies identify susceptibility loci for epithelial ovarian cancer in east Asian women. GYNECOLOGIC ONCOLOGY, v. 153, n. 2, p. 343-355, MAY 2019. Citações Web of Science: 0.
PRENDERGAST, EMILY N.; DE SOUZA FONSECA, MARCOS ABRAAO; DEZEM, FELIPE SEGATO; LESTER, JENNY; KARLAN, BETH Y.; NOUSHMEHR, HOUTAN; LIN, XIANZHI; LAWRENSON, KATE. Optimizing exosomal RNA isolation for RNA-Seq analyses of archival sera specimens. PLoS One, v. 13, n. 5 MAY 8 2018. Citações Web of Science: 1.

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