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Estudo da origem celular do câncer de ovário usando dados genômicos e epigenômicos em larga escala.

Processo: 17/08211-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de junho de 2017
Vigência (Término): 31 de maio de 2018
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Houtan Noushmehr
Beneficiário:Marcos Abraão de Souza Fonseca
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:15/07925-5 - Softwares de código aberto contendo ferramentas estatísticas para análise e integração de conjuntos de dados epigenômicos produzidos em alta escala, a fim de decifrar e entender redes reguladoras de câncer, AP.JP
Assunto(s):Epigenômica   Biologia computacional   Sequenciamento de nova geração   Neoplasias ovarianas

Resumo

Esta vaga requer candidato para realizar análises de dados moleculares em larga escala oriundos de diferentes níveis celulares e produzidos por sequenciamento de nova geração o candidato também auxiliará na manutenção de computadores (backups), no armazenamento e no pré-processamento de dados. O candidato deverá ainda apoiar os pesquisadores em seus projetos. O aplicante deve ser capaz de compreender, falar e escrever na língua inglesa.

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
LAWRENSON, KATE; FONSECA, MARCOS A. S.; LIU, ANNIE Y.; DEZEM, FELIPE SEGATO; LEE, JANET M.; LIN, XIANZHI; CORONA, ROSARIO I.; ABBASI, FOROUGH; VAVRA, KEVIN C.; DINH, HUY Q.; et al. A Study of High-Grade Serous Ovarian Cancer Origins Implicates the SOX18 Transcription Factor in Tumor Development. CELL REPORTS, v. 29, n. 11, p. 3726+, . (17/08211-1)
GUSEV, ALEXANDER; LAWRENSON, KATE; LIN, XIANZHI; LYRA, JR., PAULO C.; KAR, SIDDHARTHA; VAVRA, KEVIN C.; SEGATO, FELIPE; FONSECA, MARCOS A. S.; LEE, JANET M.; PEJOVIC, TANYA; et al. A transcriptome-wide association study of high-grade serous epithelial ovarian cancer identifies new susceptibility genes and splice variants. Nature Genetics, v. 51, n. 5, p. 815+, . (17/08211-1, 15/07925-5)
LAWRENSON, KATE; SONG, FENGJU; HAZELETT, DENNIS J.; KAR, SIDDHARTHA P.; TYRER, JONATHAN; PHELAN, CATHERINE M.; CORONA, ROSARIO I.; RODRIGUEZ-MALAVE, NORMA I.; SEO, JI-HEI; ADLER, EMILY; et al. Genome-wide association studies identify susceptibility loci for epithelial ovarian cancer in east Asian women. GYNECOLOGIC ONCOLOGY, v. 153, n. 2, p. 343-355, . (15/07925-5, 17/08211-1)
PRENDERGAST, EMILY N.; DE SOUZA FONSECA, MARCOS ABRAAO; DEZEM, FELIPE SEGATO; LESTER, JENNY; KARLAN, BETH Y.; NOUSHMEHR, HOUTAN; LIN, XIANZHI; LAWRENSON, KATE. Optimizing exosomal RNA isolation for RNA-Seq analyses of archival sera specimens. PLoS One, v. 13, n. 5, . (17/08211-1, 16/06413-3)

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