Busca avançada
Ano de início
Entree

Integrando engenharia de proteínas e biologia sintética para desenvolver novos sistemas de high-throughput selection

Processo: 16/18827-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de junho de 2017
Vigência (Término): 29 de fevereiro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Convênio/Acordo: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:María Eugenia Guazzaroni
Beneficiário:Lucas Ferreira Ribeiro
Instituição-sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:15/04309-1 - Novas abordagens para melhorar a prospecção funcional de biocatalizadores em bibliotecas metagenômicas, AP.JP
Assunto(s):Biologia sintética   Engenharia de proteínas

Resumo

A evolução de áreas como a engenharia de proteínas e a metagenômica, depende do desenvolvimento de ferramentas que permitam explorar, com eficiência, a imensa diversidade natural na qual as enzimas alvo estão inseridas. Assim, para explorar esse astronômico espaço amostral é necessário criar sistemas de triagem (screening) ou seleção cada vez mais eficientes e de alto rendimento, conhecidos como sistemas de high throughput screening or selection (HTS). No entanto, apesar do avanço na construção de novas estratégias de HTS, muitas dessas estratégias normalmente têm baixas taxas de identificação das enzimas alvo. Grande parte das limitações encontradas durante o desenvolvimento de novos sistemas HTS podem ser contornadas pela utilização de abordagens de biologia sintética. Neste projeto, portanto, nós estamos propondo o desenvolvimento de novas tecnologias de HTS para se obter enzimas de degradação de biomassa. Essas tecnologias serão desenvolvidas a partir de uma ponte entre a biologia sintética e a engenharia de proteínas, visando criar circuitos gênicos capazes de reconhecer o produto da atividade enzimática e transformar este sinal em uma mudança fenotípica. Assim, a tecnologia de HTS aqui denominada de Biomass Activated Switch System (BASS) poderá funcionar como um sistema de seleção mais eficiente ajudando a aliviar as limitações encontradas durante o processo de prospecção de novas enzimas em bibliotecas oriundas de metagenomas ou de evolução dirigida. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (0 total):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
RIBEIRO, LUCAS FERREIRA; LOPES, ERICA M.; KISHI, LUCIANO T.; COSTA RIBEIRO, LILIANE FRAGA; MENEGUETI, MAYRA GONCALVES; GASPAR, GILBERTO GAMBERO; SILVA-ROCHA, RAFAEL; GUAZZARONI, MARIA-EUGENIA. Microbial Community Profiling in Intensive Care Units Expose Limitations in Current Sanitary Standards. FRONTIERS IN PUBLIC HEALTH, v. 7, AUG 28 2019. Citações Web of Science: 0.
RIBEIRO, LUCAS FERREIRA; AMARELLE, VANESA; ALVES, LUANA DE FATIMA; VIANA DE SIQUEIRA, GUILHERME MARCELINO; LOVATE, GABRIEL LENCIONI; BORELLI, TIAGO CABRAL; GUAZZARONI, MARIA-EUGENIA. Genetically Engineered Proteins to Improve Biomass Conversion: New Advances and Challenges for Tailoring Biocatalysts. Molecules, v. 24, n. 16 AUG 2019. Citações Web of Science: 0.
RIBEIRO, LUCAS F.; AMARELLE, VANESA; RIBEIRO, LILIANE F. C.; GUAZZARONI, MARIA-EUGENIA. Converting a Periplasmic Binding Protein into a Synthetic Biosensing Switch through Domain Insertion. BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL, 2019. Citações Web of Science: 2.
RIBEIRO, LUCAS F.; RIBEIRO, LILIANE F. C.; BARRETO, MATHEUS Q.; WARD, RICHARD J. Protein Engineering Strategies to Expand CRISPR-Cas9 Applications. INTERNATIONAL JOURNAL OF GENOMICS, 2018. Citações Web of Science: 4.

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.