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Análise sistêmica do papel da proteína quinase A (PKA) no fungo Trichoderma reesei através de fosfoproteômica

Processo: 16/20358-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de julho de 2017
Vigência (Término): 29 de fevereiro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Roberto do Nascimento Silva
Beneficiário:Liliane Fraga Costa Ribeiro
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia sistêmica   Transdução de sinais   Trichoderma reesei

Resumo

A produção de enzimas lignocelulolíticas por fungos filamentosos tem sido um constante objeto de estudo, principalmente porque tais enzimas são de fundamental importância em processos de geração de biocombustíveis a partir de biomassa vegetal. Entretanto, ainda não se conseguiu um microrganismo considerado altamente eficaz para a hidrólise da biomassa. Isso se deve muito a falta de um conhecimento sólido na regulação da produção dessas enzimas. Um dos principais mecanismos de regulação da síntese de proteínas se dá pela ativação de cascatas de fosforilação que acarretam na ativação de fatores de transcrição. Dessa forma, a compreensão das vias de sinalização ativadas em determinadas condições pode fornecer conhecimento que permita engenheirar o microrganismo de forma que este se torne um melhor produtor de enzimas lignocelulolíticas, mesmo em condições com altas concentrações de glicose em que ocorreria a repressão catabólica. Este projeto, portanto, propõe o estudo sistêmico da ação da proteína quinase dependente de cAMP (PKA) e o seu envolvimento na regulação da produção e secreção de enzimas lignocelulolíticas no fungo celulolítico Trichoderma reesei. Duas cepas deste microrganismo (selvagem e knockout para o gene codificante de PKA) serão cultivados em duas fontes de carbono (glicose e bagaço de cana de açúcar). Uma análise fosfoproteômica das proteínas intracelulares do fungo cultivado nessas condições permitirá a identificação dos peptídeos fosforilados diferencialmente em cada condição. Assim, será possível identificar alvos de PKA (diretos ou indiretos) nas condições testadas. O cruzamento dos resultados obtidos com fosfoproteômica e as atividades enzimáticas permitirão identificar alvos de PKA que são importantes para a produção dessas enzimas lignocelulolíticas. As informações geradas neste trabalho, além de contribuir para a compreensão do mecanismo de repressão catabólica, poderão ser utilizadas para engenheirar o fungo T. reesei a fim de aumentar a produção dessas enzimas, mesmo em condições de repressão catabólica. Além disso, servirão como fonte de informação para posteriores pesquisas, como estudos de alvos individuais de PKA (identificados nesse trabalho) e seus efeitos específicos na célula.

Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (5 total):
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LabNetwork: Mapeamento genético indica que bactérias sobrevivem à limpeza diária em UTI (06/Set/2019)
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Jornal da USP online: Mapeamento genético indica quais bactérias sobrevivem à limpeza diária em UTI (04/Set/2019)

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
RIBEIRO, LUCAS FERREIRA; LOPES, ERICA M.; KISHI, LUCIANO T.; COSTA RIBEIRO, LILIANE FRAGA; MENEGUETI, MAYRA GONCALVES; GASPAR, GILBERTO GAMBERO; SILVA-ROCHA, RAFAEL; GUAZZARONI, MARIA-EUGENIA. Microbial Community Profiling in Intensive Care Units Expose Limitations in Current Sanitary Standards. FRONTIERS IN PUBLIC HEALTH, v. 7, AUG 28 2019. Citações Web of Science: 0.
RIBEIRO, LUCAS F.; AMARELLE, VANESA; RIBEIRO, LILIANE F. C.; GUAZZARONI, MARIA-EUGENIA. Converting a Periplasmic Binding Protein into a Synthetic Biosensing Switch through Domain Insertion. BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL, 2019. Citações Web of Science: 2.
DE PAULA, RENATO GRACIANO; CAMPOS ANTONIETO, AMANDA CRISTINA; COSTA RIBEIRO, LILIANE FRAGA; CARRARO, CLAUDIA BATISTA; VIEIRA NOGUEIRA, KAROLINE MARIA; BORGES LOPES, DOUGLAS CHRISTIAN; SILVA, ALINNE COSTA; ZERBINI, MARIANA TAISE; PEDERSOLI, WELLINGTON RAMOS; COSTA, MARIANA DO NASCIMENTO; SILVA, ROBERTO NASCIMENTO. New Genomic Approaches to Enhance Biomass Degradation by the Industrial Fungus Trichoderma reesei. INTERNATIONAL JOURNAL OF GENOMICS, 2018. Citações Web of Science: 6.
RIBEIRO, LUCAS F.; RIBEIRO, LILIANE F. C.; BARRETO, MATHEUS Q.; WARD, RICHARD J. Protein Engineering Strategies to Expand CRISPR-Cas9 Applications. INTERNATIONAL JOURNAL OF GENOMICS, 2018. Citações Web of Science: 4.

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