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Análise e desenvolvimento de ferramentas de bioinformática aplicadas a estudos de genômica, transcriptômica e proteômica

Processo: 17/13681-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de agosto de 2017
Vigência (Término): 14 de janeiro de 2018
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação
Pesquisador responsável:Hugo Aguirre Armelin
Beneficiário:Francisco Ivanio Arruda Alves
Instituição-sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:13/07467-1 - CeTICS - Centro de Toxinas, Imuno-Resposta e Sinalização Celular, AP.CEPID
Assunto(s):Análise de dados   Transcriptômica   Proteômica   Desenvolvimento de software   Biologia computacional   Genética molecular

Resumo

O Centro de Toxinas, Resposta-Imune e Sinalização Celular (CeTICS) desenvolve estudos sobre os mecanismos bioquímicos, moleculares e celulares, de toxinas com potenciais terapêuticos. Um dos elementos mais importantes para estes estudos são os dados obtidos em larga escala. Neste contexto, o sequenciamento de transcritos (transcriptoma) através da técnica RNA-seq, além da proteômica, tornam-se estratégias robustas para tais estudos. Uma vez que o CeTICS já possui uma enorme quantidade de dados gerados por experimentos anteriormente realizados, além de novos futuros experimentos. Estes poderão ser processados e integrados a dados públicos em busca de novos entendimentos moleculares e funcionais. Portanto, é objetivo deste projeto, aplicar novas metodologias e ferramentas computacionais para análise e integração dos dados, identificação de genes, vias e redes de interesse. Deste modo, o bolsista ficará responsável pelo desenvolvimento de ferramentas para análise de dados dos respectivos estudos e administração dos recursos computacionais. Além disso, faz parte de suas tarefas, juntamente com seu supervisor técnico, a criação e disseminação de ferramentas de visualização e análise de resultados. (AU)

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