Análise e desenvolvimento de ferramentas de bioinformática aplicadas a estudos de genômica, transcriptômica e proteômica

• Processo: 17/13681-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2017
• Data de Término da vigência: 14 de janeiro de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação
• Pesquisador responsável: Hugo Aguirre Armelin
• Beneficiário: Francisco Ivanio Arruda Alves
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/07467-1 - CeTICS - Centro de Toxinas, Imuno-Resposta e Sinalização Celular, AP.CEPID
• Assunto(s): Análise de dados Transcriptômica Proteômica Desenvolvimento de software Biologia computacional Genética molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Análise de Dados | Desenvolvimento de Software | Genética Molecular | proteômica | Transcritômica | Bioinformática

Resumo

O Centro de Toxinas, Resposta-Imune e Sinalização Celular (CeTICS) desenvolve estudos sobre os mecanismos bioquímicos, moleculares e celulares, de toxinas com potenciais terapêuticos. Um dos elementos mais importantes para estes estudos são os dados obtidos em larga escala. Neste contexto, o sequenciamento de transcritos (transcriptoma) através da técnica RNA-seq, além da proteômica, tornam-se estratégias robustas para tais estudos. Uma vez que o CeTICS já possui uma enorme quantidade de dados gerados por experimentos anteriormente realizados, além de novos futuros experimentos. Estes poderão ser processados e integrados a dados públicos em busca de novos entendimentos moleculares e funcionais. Portanto, é objetivo deste projeto, aplicar novas metodologias e ferramentas computacionais para análise e integração dos dados, identificação de genes, vias e redes de interesse. Deste modo, o bolsista ficará responsável pelo desenvolvimento de ferramentas para análise de dados dos respectivos estudos e administração dos recursos computacionais. Além disso, faz parte de suas tarefas, juntamente com seu supervisor técnico, a criação e disseminação de ferramentas de visualização e análise de resultados. (AU)