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Leishmaniose visceral: abordagens genômicas para análise molecular integrada do hospedeiro e do parasito

Processo: 17/16328-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Apoio a Jovens Pesquisadores
Vigência (Início): 01 de julho de 2017
Vigência (Término): 31 de outubro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Parasitologia
Pesquisador responsável:Sandra Regina Costa Maruyama
Beneficiário:Sandra Regina Costa Maruyama
Instituição-sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:16/20258-0 - Leishmaniose visceral: abordagens genômicas para análise molecular integrada do hospedeiro e do parasito, AP.JP
Assunto(s):Análise de sequência de RNA

Resumo

A leishmaniose visceral (LV) no Brasil é causada pelo protozoário Leishmania infantum, cuja patologia apresenta-se de modo disseminado, crônico e potencialmente fatal. Entretanto, um fato interessante na LV é que a maioria dos indivíduos infectados permanecem assintomáticos. Sabe-se que fatores inerentes ao hospedeiro e ao parasito contribuem para o desenvolvimento da doença, mas quais e como esses fatores controlam a evolução da infecção para formas assintomáticas, brandas ou graves permanecem pouco elucidados. Diante disso, acreditamos que uma análise molecular comparativa de leucócitos de pacientes com a doença ativa, tratados (curados), assintomáticos e indivíduos saudáveis, bem como do genoma do parasito isolado de pacientes com formas brandas ou graves, refratários ou não ao tratamento convencional fornecerá dados e insights para elucidar os mecanismos da interação parasito/hospedeiro que permeiam as diferentes consequências da infecção. Assim, esse projeto tem por objetivo desenvolver uma análise molecular integrada da LV por meio da genômica funcional (RNA-seq) do hospedeiro e da genômica estrutural do parasito (WGS, whole-genome sequencing), ambas confluindo para integração de dados que sejam úteis como novos alvos terapêuticos e de drogas. Nossos resultados preliminares de RNA-seq de leucócitos de pacientes com LV e de WGS de isolados clínicos de L. infantum mostram que esta proposta além de inovadora é altamente promissora. Por meio de análise de RNA-seq de leucócitos do sangue de pacientes com a LV antes e após o tratamento, indivíduos assintomáticos e indivíduos saudáveis identificaremos assinaturas transcricionais (genes e RNAs não codificantes) relacionadas à imunopatogênese da LV. O dual RNA-seq permitirá identificar transcritos de Leishmania a partir do transcriptoma desses pacientes. Para complementar esse perfil de assinaturas transcricionais do hospedeiro, também pretendemos desenvolver uma metodologia de estimulação antigênica de sangue total para análise de RNA-seq. A genômica estrutural de mais isolados clínicos por WGS identificará a ploidia e somia cromossômica, bem como as variantes genéticas (CNVs e SNPs). Na análise de genômica comparativa identificaremos genes e/ou regiões genômicas de L. infantum associadas à gravidade da doença e à resistência aos quimioterápicos convencionais. Essa análise também fornecerá grande contribuição para a biologia das linhagens brasileiras do parasito. Por fim, esta proposta visa o estabelecimento de uma nova linha de pesquisa na área de estudo da interação parasito/hospedeiro em doenças tropicais neglicenciadas.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MARUYAMA, SANDRA R.; DE SANTANA, ALYNNE K. M.; TAKAMIYA, NAYORE T.; TAKAHASHI, TALITA Y.; ROGERIO, LUANA A.; OLIVEIRA, CAIO A. B.; MILANEZI, CRISTIANE M.; TROMBELA, VIVIANE A.; CRUZ, ANGELA K.; JESUS, AMELIA R.; BARRETO, ALINE S.; DA SILVA, ANGELA M.; ALMEIDA, ROQUE P.; RIBEIRO, JOSE M.; SILVA, JOAO S. Non-Leishmania Parasite in Fatal Visceral Leishmaniasis Like Disease, Brazil. Emerging Infectious Diseases, v. 25, n. 11, p. 2088-2092, NOV 2019. Citações Web of Science: 0.
DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; RAB, PETR; EZAZ, TARIQ; YANO, CASSIA FERNANDA; HATANAKA, TERUMI; JEGEDE, OLADELE ILESANMI; TANOMTONG, ALONGKLOD; LIEHR, THOMAS; SEMBER, ALEXANDR; MARUYAMA, SANDRA REGINA; FELDBERG, ELIANA; VIANA, PATRIK FERREIRA; CIOFFIID, MARCELO DE BELLO. Cytogenetics, genomics and biodiversity of the South American and African Arapaimidae fish family (Teleostei, Osteoglossiformes). PLoS One, v. 14, n. 3 MAR 25 2019. Citações Web of Science: 1.
BARBY, FELIPE FAIX; RAB, PETR; LAVOUE, SEBASTIEN; EZAZ, TARIQ; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; KILIAN, ANDRZEJ; MARUYAMA, SANDRA REGINA; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; ARTONI, ROBERTO FERREIRA; SANTOS, MATEUS HENRIQUE; JEGEDE, OLADELE ILESANMI; HATANAKA, TERUMI; TANOMTONG, ALONGKLOD; LIEHR, THOMAS; CIOFFI, MARCELO DE BELLO. From Chromosomes to Genome: Insights into the Evolutionary Relationships and Biogeography of Old World Knifefishes (Notopteridae; Osteoglossiformes). GENES, v. 9, n. 6 JUN 2018. Citações Web of Science: 4.

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