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Análise comparativa computacional de transfectante de Leishmania nocaute para PRMT7: transcriptoma e metilproteoma

Processo: 17/14765-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de setembro de 2017
Vigência (Término): 30 de junho de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
Convênio/Acordo: MRC, UKRI ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil
Pesquisador responsável:Angela Kaysel Cruz
Beneficiário:Rubens Daniel Miserani Magalhães
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:15/13618-8 - Regulando trans-reguladores: investigação da via molecular de PRMT7 como regulador epigenético da virulência em Leishmania, AP.TEM
Assunto(s):Leishmania   Transcriptoma   Expressão gênica   Biologia computacional

Resumo

O estudo proposto requer a integração dos dados de análise de expressão gênica em diferentes níveis, com análise fenotípica de parasitas mutantes gerados nesta investigação. As comparações devem incluir estudos transcriptômicos e proteômicos e a análise dos complexos proteína-RNA nos diferentes mutantes gerados, ao longo do ciclo de vida do parasita. A avaliação de possíveis sequências de resíduos de aminoácidos conservados alvos da metilação por PRMT e a comparação de possíveis motivos de RNA preferencialmente associados a RBPs, metilados ou não, dependem predominantemente da participação de um especialista em bioinformática. Os dados gerados devem ser armazenados corretamente e o seu resgate e integração devem ser facilitados. Portanto, o desenvolvimento e integração de ferramentas computacionais que permitem a análise de expressão gênica são essenciais para a otimização da informação fornecida devido grande volume de dados gerados. (AU)

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