Bioinformática aplicada a microRNAs de peixes

• Processo: 17/15708-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de outubro de 2017
• Vigência (Término): 31 de março de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura
• Pesquisador responsável: Maeli Dal Pai
• Beneficiário: Bruno Evaristo de Almeida Fantinatti
• Supervisor: Michela Alessandra Denti
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Local de pesquisa: Universitá degli Studi di Trento, Itália
• Vinculado à bolsa: 15/19985-2 - Análise integrativa do microRNAoma no músculo esquelético de Colossoma macropomum (tambaqui), Piaractus mesopotamicus (pacu) e seu híbrido, tambacu, BP.PD
• Assunto(s): Biologia computacional Sequenciamento de nova geração MicroRNAs Alimentação animal Tambaqui Colossoma macropomum Pacu Piaractus mesopotamicus
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | MicroRNAs | Sequenciamento de próxima geração | Aquicultura

Resumo

As espécies Colossoma macropomum (tambaqui) e Piaractus mesopotamicus (pacu) são boas espécies para o mercado de carne e apresentam características importantes para a produção, como crescimento rápido e boa adaptação à variação da alimentação. Tais espécies têm semelhanças relacionadas aos hábitos alimentares, mas apresentam variação em termos de temperaturas de crescimento. Os indivíduos originados pela hibridação entre essas espécies, o tambacu, apresentam uma boa adaptação a temperaturas próximas a 20°C (característica do pacu) e podem atingir um peso semelhante ao tambaqui. Tais características tornaram o tambacu como uma boa escolha para a produção. MicroRNAs são pequenas moléculas de RNA capazes de controlar a expressão genética pós-transcricionalmente. Esses microRNAs podem ser usados para analisar fatores de crescimento responsáveis pelo desenvolvimento de ambas as espécies. Com base em novas tecnologias de sequenciamento, a análise em larga escala de tais elementos tornou-se uma ferramenta importante na caracterização de moléculas tão pequenas, para analisar o papel do microRNA sobre o controle pós-transcricional de genes e para prever as vias de sinalização envolvidas nos processos celulares através da análise de rede. O tecido muscular do peixe representa uma importante fonte de proteína. Desta forma, este projeto visa analisar dados de microRNA de músculo rápido (branco) de espécimes juvenis da espécie tambaqui, pacu e híbrido tambacu, direcionado ao perfil transcricional de microRNAs envolvidos com o crescimento muscular. Tais análises podem contribuir para um melhor conhecimento relacionado a essas pequenas moléculas no controle da expressão de genes relacionados ao crescimento muscular que são compartilhados pelos três genótipos e à identificação de marcadores moleculares relacionados ao crescimento muscular. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FANTINATTI, BRUNO E. A.; PEREZ, ERIKA S.; ZANELLA, BRUNA T. T.; VALENTE, JESSICA S.; DE PAULA, TASSIANA G.; MARECO, EDSON A.; CARVALHO, ROBSON F.; PIAZZA, SILVANO; DENTI, MICHELA A.; DAL-PAI-SILVA, MAELI. Integrative microRNAome analysis of skeletal muscle of Colossoma macropomum (tambaqui), Piaractus mesopotamicus (pacu), and the hybrid tambacu, based on next-generation sequencing data. BMC Genomics, v. 22, n. 1, APR 6 2021. (16/05009-4, 15/19985-2, 17/15708-0)

FANTINATTI, BRUNO E. A.; PEREZ, ERIKA S.; ZANELLA, BRUNA T. T.; VALENTE, JESSICA S.; DE PAULA, TASSIANA G.; MARECO, EDSON A.; CARVALHO, ROBSON F.; PIAZZA, SILVANO; DENTI, MICHELA A.; DAL-PAI-SILVA, MAELI. Integrative microRNAome analysis of skeletal muscle of Colossoma macropomum (tambaqui), Piaractus mesopotamicus (pacu), and the hybrid tambacu, based on next-generation sequencing data. BMC Genomics, v. 22, n. 1, p. 17-pg., 2021-04-06. (16/05009-4, 15/19985-2, 17/15708-0)