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Análise de componentes do metabolismo energético ao longo do crescimento em cultura de Arcella intermedia

Processo: 17/16077-3
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
Vigência (Início): 08 de outubro de 2017
Vigência (Término): 07 de novembro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Daniel José Galafasse Lahr
Beneficiário:Giulia Magri Ribeiro
Supervisor no Exterior: Laura Aline Katz
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Local de pesquisa: Smith College, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:16/14402-1 - Análise do perfil de expressão gênica de Arcella vulgaris ao longo de sua curva de crescimento em laboratório, BP.MS
Assunto(s):Metabolismo   Expressão gênica   Evolução molecular   Micro-organismos

Resumo

O crescimento microbiano é um processo complexo que envolve inúmeras reações metabólicas que resultam em divisão celular. As curvas de crescimento típico têm 4 fases: lag, log, estacionária e declínio. Arcella intermedia não parece seguir exatamente esse mesmo padrão de crescimento. In vitro, o crescimento celular depende de vários fatores, como o pH,Temperatura, osmolalidade, concentração de gás, substratos de superfície disponíveis e estado deAs células na inoculação. Durante o cultivo in vitro de células animais, qualquer mudança das condições ambientais ideais pode resultar em uma rápida diminuição da viabilidade da célula. Todas as células vivas "trabalham", e para fazer esses trabalhos a célula precisa de energia.As vias metabólicas são reguladas em vários níveis dentro da célula. E já foi mostrado que essas regulações são muito variáveis em protistas. Com RNAseq podemos identificar genes e transcritos ativos nas células. Isso é útil paraIdentificar genes expressos diferencialmente, que devem estar respondendo a sinais do meio ambiente. Neste projeto, pretendemos investigar as modificações do metabolismo energetico em toda a linhagem do crescimento de amebas. Nós já geramos dados do transcriptoma (RNAseq). Nós vamosFazer uma análise computacional para extrair genes relacionados ao metabolismo e tentar compreender seu padrão de expressão ao longo da curva de crescimento da ameba. Pretendo fazer isso no decorrer de um mês. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
RIBEIRO, GIULIA M.; PORFIRIO-SOUSA, ALFREDO L.; MAURER-ALCALA, XYRUS X.; KATZ, LAURA A.; LAHR, DANIEL J. G.. De novo Sequencing, Assembly, and Annotation of the Transcriptome for the Free-Living Testate Amoeba Arcella intermedia. Journal of Eukaryotic Microbiology, v. 67, n. 3, . (17/16077-3, 16/14317-4, 16/14402-1)

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