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Integração entre vias de sinalização e modificações pós traducionais em histonas em resposta a fator de crescimento

Processo: 17/15835-1
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de novembro de 2017
Vigência (Término): 31 de outubro de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica
Pesquisador responsável:Julia Pinheiro Chagas da Cunha
Beneficiário:Mariana de Camargo Lopes
Supervisor no Exterior: Benjamin Aaron Garcia
Instituição-sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
Local de pesquisa : University of Pennsylvania, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:16/24881-4 - Análise de alterações induzidas por fator de crescimento no proteoma nuclear ao longo do ciclo celular de células tumorais de camundongo, BP.DD
Assunto(s):Espectrometria de massas   Transdução de sinais   Histonas

Resumo

Apesar de ser um fator de crescimento, o FGF-2 possui funções anti-proliferativas e anti-tumorais em alguns contextos celulares. Em uma linha celular de tumor adrenocortical de camundongoo (linhagem Y1), o FGF-2 desencadeia uma resposta mitogênica inicial através da sinalização ERK1/2, PKC e AKT, mas resulta em uma parada do ciclo celular em G2/M através da sinalização RhoA/GTP-src. Recentemente, encontramos fatores de transcrição relacionados a genes de respostas iniciais (como fosB e junB) que são diferencialmente expressos após o tratamento com FGF-2. Também encontramos uma diminuição global em marcas de cromatina ativa, como as acetilações no N-terminal da histona H4, após 3 horas de estímulo com FGF-2. Para entender melhor a resposta fenotípica dupla (indução mitogênica versus parada no ciclo celular) induzida pelo FGF-2, objetivamos realizar uma análise proteômica quantitativa das MPTs em histonas, além de uma análise fosfoproteômica, após a estímulo com soro e soro+FGF-2 na linha celular Y1. Uma integração entre as vias de sinalização e mudanças epigenéticas induzidas por soro e/ou FGF-2 será realizada em uma perspectiva de biologia de sistemas usando ferramentas de bioinformática. Para o nosso conhecimento, a análise high throughput da ativação da sinalização celular integrada à dinâmica de MPTs em histonas tem sido mal explorada na literatura, apesar da sua importância na regulação gênica. Acreditamos que o nosso trabalho explicará como as vias de sinalização podem interagir com as MPTs das histonas nas respostas proliferativas (células estimuladas no soro) e não proliferativas (células estimuladas com FGF-2).

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SIDOLI, SIMONE; LOPES, MARIANA; LUND, PEDER J.; GOLDMAN, NAOMI; FASOLINO, MARIA; CORADIN, MARIEL; KULEJ, KATARZYNA; BHANU, V, NATARAJAN; VAHEDI, GOLNAZ; GARCIA, BENJAMIN A. A mass spectrometry-based assay using metabolic labeling to rapidly monitor chromatin accessibility of modified histone proteins. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, SEP 20 2019. Citações Web of Science: 0.
SIDOLI, SIMONE; KORI, YEKATERINA; LOPES, MARIANA; YUAN, ZUO-FEI; KIM, HEE JONG; KULEJ, KATARZYNA; JANSSEN, KEVIN A.; AGOSTO, LAURA M.; CHAGAS DA CUNHA, JULIA PINHEIRO; ANDREWS, ANDREW J.; GARCIA, BENJAMIN A. One minute analysis of 200 histone posttranslational modifications by direct injection mass spectrometry. Genome Research, v. 29, n. 6, p. 978-987, JUN 2019. Citações Web of Science: 1.
LIU, XIAOJING; COOPER, DANIEL E.; CLUNTUN, AHMAD A.; WARMOES, MARC O.; ZHAO, STEVEN; REID, MICHAEL A.; LIU, JUAN; LUND, PEDER J.; LOPES, MARIANA; GARCIA, BENJAMIN A.; WELLEN, KATHRYN E.; KIRSCH, DAVID G.; LOCASALE, JASON W. Acetate Production from Glucose and Coupling to Mitochondrial Metabolism in Mammals. Cell, v. 175, n. 2, p. 502+, OCT 4 2018. Citações Web of Science: 21.

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