O Papel de PTEN na Resposta Inflamatória Mediada por STAT1 e STAT3 no Câncer de Próstata

• Processo: 17/08614-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de dezembro de 2017
• Vigência (Término): 31 de julho de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Jeremy Andrew Squire
• Beneficiário: Thiago Vidotto
• Supervisor: Charles H Graham
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Local de pesquisa: Queen's University, Canadá
• Vinculado à bolsa: 15/22785-5 - O Papel da Perda do Gene PTEN na Facilitação da Resposta Inflamatória no Câncer de Prótata, BP.DR
• Assunto(s): Imunogenética Neoplasias da próstata PTEN fosfo-hidrolase Fator de transcrição STAT3
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Imunogenetics | Prostate Cancer | Pten | Stat1 | Stat3 | Type I and II IFN Response | Imunogenética

Resumo

Realizamos uma análise in silico utilizando dados de aCGH e RNAseq em 493 casos de câncer de próstata da coorte Genomic Data Commons (GDC) e identificamos que 124 de 449 genes relacionados a respostas imunológicas e inflamatórias foram diferencialmente expressos entre casos com perda em hemizigose e homozigose do gene PTEN (n = 104) versus casos com o gene PTEN intacto (n = 398). Análises de enrichment indicaram que os 124 genes diferencialmente expressos são associados às respostas de Interferon tipo I e II, sendo reguladas downstream por fatores de transcrição STATs. Em seguida, avaliamos a expressão dos genes PTEN, STAT1 e pSTAT3, além da infiltração de células T CD8+ por imunohistoquímica em 286 casos de PCa do The Centre Hospitalier de l'Université de Montréal. Nesta coorte, detectamos que a perda da expressão do gene PTEN está diretamente associada à menor expressão de STAT1 e pSTAT3, além de uma menor infiltração de células T CD8+. Além disso, nossos resultados indicam que uma menor expressão de STAT1 e pSTAT3 aumenta a chance de metástase óssea de câncer de próstata. Nesta proposta, temos como objetivo validar, por imunohistoquímica, a expressão de 10 genes diferencialmente expressos utilizando 150 amostras de câncer de próstata do Hospital das Clínicas - FMRP/USP em lâminas de microarrays de tecidos (TMA). A imunohistoquímica será conduzida com os dez genes mais diferencialmente expressos obtidos através da análise in silico. Em seguida, quantificaremos a expressão de mRNA de 770 marcadores imunes de seis casos de câncer de próstata que apresentam perda do gene PTEN e seis casos de câncer de próstata que apresentam ambas as cópias do gene PTEN através da plataforma NanoString nCounter PanCancer Immune Profiling. Os resultados obtidos através dos experimentos de imunohistoquímica e de quantificação de mRNA pela plataforma NanoString serão validados in silico em outra coorte de câncer de próstata utilizando dados RNAseq e de sequenciamento disponíveis na plataforma dbGaP. Uma vez que os dados de expressão são obtidos a partir de uma mistura de células tumorais e estromais, os dados obtidos pela plataforma NanoString serão validados através da plataforma CIBERSORT, uma estrutura computacional para quantificar com precisão a abundância relativa de vários tipos de células presentes em uma população mista usando dados de expressão de RNA. Os experimentos propostos irão estabelecer uma relação primária entre o status de deleção do gene PTEN e a ativação dependente de Interferon das proteínas STAT1 e STAT3 no microambiente tumoral do câncer de próstata. A identificação da expressão diferencial de PTEN em casos de câncer de próstata em prognósticos da doença poderá confirmar o papel deste gene na regulação das respostas imune e inflamatória que favorecem a progressão tumoral mediada pela imunosupressão.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

VIDOTTO, THIAGO; MELO, CAMILA MORAIS; CASTELLI, ERICK; KOTI, MADHURI; DOS REIS, RODOLFO BORGES; SQUIRE, JEREMY A.. Emerging role of PTEN loss in evasion of the immune response to tumours. BRITISH JOURNAL OF CANCER, v. 122, n. 12, APR 2020. (15/09111-5, 17/08614-9, 15/22785-5)

HARMON, STEPHANIE A.; PATEL, PALAK G.; SANFORD, THOMAS H.; CAVEN, ISABELLE; ISEMAN, RACHAEL; VIDOTTO, THIAGO; PICANCO, CLARISSA; SQUIRE, JEREMY A.; MASOUDI, SAMIRA; MEHRALIVAND, SHERIF; et al. High throughput assessment of biomarkers in tissue microarrays using artificial intelligence: PTEN loss as a proof-of-principle in multi-center prostate cancer cohorts. MODERN PATHOLOGY, v. 34, n. 2, SEP 2020. (15/09111-5, 17/08614-9, 15/22785-5)