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Sequenciamento integral do DNA mitocondrial no diagnóstico da Neuropatia Óptica Hereditária de Leber (LHON)

Processo: 17/17790-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de setembro de 2017
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Edi Lúcia Sartorato
Beneficiário:Michelle Carneiro Rachid Ribeiro
Instituição-sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/10188-0 - Sequenciamento integral do DNA mitocondrial no diagnóstico da Neuropatia Óptica Hereditária de Leber (LHON), AP.R
Assunto(s):Atrofia óptica hereditária de Leber   Sequenciamento de nova geração   DNA mitocondrial

Resumo

O presente trabalho propõe a utilização de uma plataforma de Sequenciamento de Próxima Geração (NGS) para o sequenciamento completo do DNA mitocondrial em indivíduos com LHON, nos quais não foram encontradas as mutações primárias. O objetivo principal será realizar o sequenciamento completo do genoma mitocondrial em pacientes brasileiros (com quadro clínico típico de LHON e com Neuropatia Óptica de Etiologia a Esclarecer). Os objetivos específicos serão: Verificar a frequência das mutações secundárias, fazer a correlação fenótipo/genótipo e explicar a expressão variável desta condição; pesquisar os haplogrupos dos pacientes com alteração molecular; e determinar novas variantes relacionadas à neuropatia óptica. Serão avaliados aproximadamente 100 pacientes clinicamente afetados pela LHON (66 casos) ou com neuropatia óptica de etiologia a esclarecer (34 indivíduos). Nos pacientes que não apresentarem mutações primárias, serão realizadas capturas de genes alvos e Sequenciamento Paralelo Massivo com o Kit Agilent SureSelect utilizando a plataforma Illumina HiSeq 2000. Com este trabalho, espera-se obter o espectro de mutações relacionadas à LHON presentes na nossa população, permitindo otimizar testes de diagnóstico molecular com vistas ao prognóstico, tratamento e aconselhamento genético. (AU)

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