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Detecção de assinaturas de seleção em búfalos leiteiros (Bubalus bubalis)

Processo: 17/10542-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2017
Situação:Interrompido
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Humberto Tonhati
Beneficiário:André Vieira do Nascimento
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):18/25725-1 - Efeitos da depressão endogâmica sobre características de produção de leite em búfalas Murrah, BE.EP.DR
Assunto(s):Bubalus bubalis   Brasil

Resumo

Alterações na morfologia, fisiologia e em aspectos comportamentais de uma espécie são reflexos da seleção natural e/ou artificial. Tais processos modificam regiões genômicas específicas, gerando as chamadas assinaturas de seleção (SS, do inglês, selection signatures). O objetivo do presente estudo é a invetigação de SS em búfalos leiteiros criados no Brasil, com intuito de identificar regiões genômicas relacionadas a características de importância econômica selecionadas no rebanho nacional. Serão utilizados 652 animais da raça Murrah genotipados para aproximadamente 90.000 marcadores, contidos no painel Axiom Buffalo Genotyping. Os dados genotípicos serão submetidos ao controle de qualidade para marcadores e amostras. A identificação de SS dentro de população será realizada através de metodologias com perpectivas diferentes sobre sinais de seleção: a corrida de homozigose; o escore de integração haplotípica e o escore de número de sítios segregantes por comprimento haplotípico. As regiões destacadas como SS em qualquer das metodologias empenhadas, serão comparadas aos resultados obtidos com estudos de associação genômica ampla em bubalinos e exploradas para busca de genes, considerando o assembly UMD v3.1 do genoma bovino. Até o presente momento não se tem conhecimento de outros estudos utilizando ferramenta genômica destinado à detecção de SS em bubalinos. Assim, justifica-se o desenvolvimento do atual projeto com a finalidade de gerar informações por diferentes metodologias de identificação de SS, que poderão subsidiar estudos posteriores. (AU)

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