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Caracterização, genômica e diagnóstico de vírus com importância em saúde pública no Brasil por sequenciamento de alto desempenho

Processo: 17/13981-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2017
Vigência (Término): 30 de novembro de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
Pesquisador responsável:Luiz Tadeu Moraes Figueiredo
Beneficiário:William Marciel de Souza
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/02438-6 - Estudos com Bunyaviridae causadores de doença, AP.TEM
Assunto(s):Epidemiologia molecular   Virologia   Genômica

Resumo

Os sequenciadores de alto desempenho tem permitido importantes avanços na identificação e caracterização de vírus, sem a necessidade de isolamento e cultivo celular. Além disso, os custos do uso destes sequenciadores tem sido drasticamente reduzidos nos últimos anos, tornando, este método cada vez mais utilizado em estudos com vírus de importância para a saúde pública humana, incluindo os zoonóticos. Por isso, explorando amplamente esta metodologia, pretendemos: caracterizar cerca de 40 novas espécies de vírus em amostras de morcegos, roedores, gambás e carrapatos de diferentes regiões do Brasil. Para isto, realizaremos a caracterização genômica, taxonomia, evolução e epidemiologia molecular, bem como tentaremos o isolamento viral. Como segunda parte deste projeto, utilizaremos o sequenciamento de alto desempenho em sua última geração, a plataforma MinION, para realizar sequenciamento visando ao diagnóstico viral em etapa única e com direto fornecimento da sequência nucleotídica. Para tanto, desenvolveremos painéis para arbovírus causadores de doença humana, para vírus que acometem pacientes imunossuprimidos e vírus que causam infecção no sistema nervoso central. Nossas abordagens diagnósticas com sequenciamento MinION poderão ser implementadas na rotina clínica, patenteadas e disponibilizadas em kits diagnósticos comerciais. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Vírus identificados recentemente na China infectam carrapatos bovinos no Brasil 
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias: (1 total)

Publicações científicas (14)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; ROMEIRO, MARILIA FARIGNOLI; DE SOUZA COSTA, MICHELL CHARLES; SLHESSARENKO, RENATA DEZENGRINI; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU. Development of an Enzyme-Linked Immunosorbent Assay To Detect Antibodies Targeting Recombinant Envelope Protein 2 of Mayaro Virus. Journal of Clinical Microbiology, v. 57, n. 5 MAY 2019. Citações Web of Science: 0.
DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; DE ARAUJO, JANSEN; OMETTO, TATIANA; MODHA, SEJAL; THOMAZELLI, LUCIANO MATSUMIYA; DURIGON, EDISON LUIS; MURCIA, PABLO RAMIRO; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU. Discovery of novel astrovirus and calicivirus identified in ruddy turnstones in Brazil. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, APR 3 2019. Citações Web of Science: 0.
DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; SABINO-SANTOS, JR., GILBERTO; MOTTA MAIA, FELIPE GONCALVES; MODHA, SEJAL; TEIXEIRA NUNES, MARCIO ROBERTO; MURCIA, PABLO RAMIRO; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU. A Novel Hepacivirus in Wild Rodents from South America. Viruses-Basel, v. 11, n. 3 MAR 24 2019. Citações Web of Science: 0.
DENNIS, TRISTAN P. W.; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; MARSILE-MEDUN, SOLEDAD; SINGER, JOSHUA B.; WILSON, SAM J.; GIFFORD, ROBERT J. The evolution, distribution and diversity of endogenous circoviral elements in vertebrate genomes. VIRUS RESEARCH, v. 262, n. SI, p. 15-23, MAR 2019. Citações Web of Science: 2.
TEIXEIRA NUNES, MARCIO ROBERTO; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; SAVJI, NAZIR; FIGUEIREDO, MARIO LUIS; CARDOSO, JEDSON FERREIRA; DA SILVA, SANDRO PATROCA; DA SILVA DE LIMA, CLAYTON PEREIRA; VASCONCELOS, HELENA BALDEZ; RODRIGUES, SUELI GUERREIRO; LIPKIN, W. IAN; COSTA VASCONCELOS, PEDRO FERNANDO; PALACIOS, GUSTAVO. Oropouche orthobunyavirus: Genetic characterization of full-length genomes and development of molecular methods to discriminate natural reassortments. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 68, p. 16-22, MAR 2019. Citações Web of Science: 0.
DE SOUZA, WILLIAM MARCIE; FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; TORRES CARRASCO, ADRIANO DE OLIVEIRA; ROMEIRO, MARILIA FARIGNOLI; MODHA, SEJAL; SEKI, MEIRE CHRISTINA; GHELLER, JANAINA MENEGAZZO; DAFFRE, SIRLEI; TEIXEIRA NUNES, MARCIO ROBERTO; MURCIA, PABLO RAMIRO; ACRANI, GUSTAVO OLSZANSKI; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU. Viral diversity of Rhipicephalus microplus parasitizing cattle in southern Brazil. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, NOV 5 2018. Citações Web of Science: 2.
MOTTA MAIA, FELIPE GONCALVES; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; SABINO-SANTOS, JR., GILBERTO; FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; MODHA, SEJAL; MURCIA, PABLO RAMIRO; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU. A novel polyomavirus in sigmodontine rodents from So Paulo State, Brazil. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 163, n. 10, p. 2913-2915, OCT 2018. Citações Web of Science: 0.
DENNIS, TRISTAN P. W.; FLYNN, PETER J.; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; SINGER, JOSHUA B.; MOREAU, CORRIE S.; WILSON, SAM J.; GIFFORD, ROBERT J. Insights into Circovirus Host Range from the Genomic Fossil Record. Journal of Virology, v. 92, n. 16 AUG 2018. Citações Web of Science: 3.
FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; ALVES ESPOSITO, DANILLO LUCAS; SILVA, ANGELICA; ROMEIRO, MARILIA FARIGNOLI; MARTINEZ, EDSON ZANGIACOMI; LOPES DA FONSECA, BENEDITO ANTONIO; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU. Enzyme-linked immunosorbent assay using recombinant envelope protein 2 antigen for diagnosis of Chikungunya virus. VIROLOGY JOURNAL, v. 15, JUL 24 2018. Citações Web of Science: 1.
DE MELO JUNIOR, ARISTIDES BEZERRA; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; ACRANI, GUSTAVO OLSZANSKI; CARVALHO, VALERIA LIMA; ROMEIRO, MARILIA FARIGNOLI; TOLARDO, ALINE LAVADO; DA SILVA, SANDRO PATROCA; CARDOSO, JEDSON FERREIRA; CHIANG, JANNIFER DE OLIVEIRA; DA SILVA GONCALVES VIANEZ JUNIOR, JOAO LIDIO; DA SILVA AZEVEDO, RAIMUNDA DO SOCORRO; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU; DA COSTA VASCONCELOS, PEDRO FERNANDO; TEIXEIRA NUNES, MARCIO ROBERTO; DE ALMEIDA MEDEIROS, DANIELE BARBOSA. Genomic characterization and evolution of Tacaiuma orthobunyavirus (Peribunyaviridae family) isolated in Brazil. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 60, p. 71-76, JUN 2018. Citações Web of Science: 0.
DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; ROMEIRO, MARILIA FARIGNOLI; SABINO-SANTOS, JR., GILBERTO; MOTTA MAIA, FELIPE GONCALVES; FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; MODHA, SEJAL; TEIXEIRA NUNES, MARCIO ROBERTO; MURCIA, PABLO RAMIRO; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU. Novel orthohepeviruses in wild rodents from Sao Paulo State, Brazil. VIROLOGY, v. 519, p. 12-16, JUN 2018. Citações Web of Science: 4.
DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; DENNIS, TRISTAN; FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; ARAUJO, JANSEN; SABINO-SANTOS, JR., GILBERTO; MOTTA MAIA, FELIPE GONCALVES; ACRANI, GUSTAVO OLSZANSKI; TORRES CARRASCO, ADRIANO DE OLIVEIRA; ROMEIRO, MARILIA FARIGNOLI; MODHA, SEJAL; VIEIRA, LUIZ CARLOS; OMETTO, TATIANA; QUEIROZ, LUZIA HELENA; DURIGON, EDISON LUIZ; TEIXEIRA NUNES, MIRCIO ROBERTO; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU; GIFFORD, ROBERT JAMES. Novel Parvoviruses from Wild and Domestic Animals in Brazil Provide New Insights into Parvovirus Distribution and Diversity. Viruses-Basel, v. 10, n. 4 APR 2018. Citações Web of Science: 2.
COSTA BARREIRA, LUZIA APARECIDA; SCHEUCHER, PRISCILA SANTOS; ROMEIRO, MARILIA FARIGNOLI; LA SERRA, LEONARDO; BADRA, SORAYA JABUR; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU. Evaluating the use of fluorescence-based flow cytometry assay for dengue diagnosis using peripheral blood mononuclear cells. Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical, v. 51, n. 2, p. 168-173, MAR-APR 2018. Citações Web of Science: 1.
AGUILAR, PATRICIA V.; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; SILVAS, JESUS A.; WOOD, THOMAS; WIDEN, STEVEN; FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; TEIXEIRA NUNES, MARCIO ROBERTO. Genetic Characterization of the Patois Serogroup (Genus Orthobunyavirus; Family Peribunyaviridae) and Evidence That Estero Real Virus is a Member of the Genus Orthonairovirus. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, v. 99, n. 2, p. 451-457, 2018. Citações Web of Science: 0.

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