Caracterização, genômica e diagnóstico de vírus com importância em saúde pública no Brasil por sequenciamento de alto desempenho

• Processo: 17/13981-0
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de dezembro de 2017
• Vigência (Término): 27 de outubro de 2021
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Luiz Tadeu Moraes Figueiredo
• Beneficiário: William Marciel de Souza
• Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/02438-6 - Estudos com Bunyaviridae causadores de doença, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 19/24251-9 - Abordagens multi-ômicas para o estudo da doença por Chikungunya, BE.EP.PD
• Assunto(s): Epidemiologia molecular Virologia Genômica

Resumo

Os sequenciadores de alto desempenho tem permitido importantes avanços na identificação e caracterização de vírus, sem a necessidade de isolamento e cultivo celular. Além disso, os custos do uso destes sequenciadores tem sido drasticamente reduzidos nos últimos anos, tornando, este método cada vez mais utilizado em estudos com vírus de importância para a saúde pública humana, incluindo os zoonóticos. Por isso, explorando amplamente esta metodologia, pretendemos: caracterizar cerca de 40 novas espécies de vírus em amostras de morcegos, roedores, gambás e carrapatos de diferentes regiões do Brasil. Para isto, realizaremos a caracterização genômica, taxonomia, evolução e epidemiologia molecular, bem como tentaremos o isolamento viral. Como segunda parte deste projeto, utilizaremos o sequenciamento de alto desempenho em sua última geração, a plataforma MinION, para realizar sequenciamento visando ao diagnóstico viral em etapa única e com direto fornecimento da sequência nucleotídica. Para tanto, desenvolveremos painéis para arbovírus causadores de doença humana, para vírus que acometem pacientes imunossuprimidos e vírus que causam infecção no sistema nervoso central. Nossas abordagens diagnósticas com sequenciamento MinION poderão ser implementadas na rotina clínica, patenteadas e disponibilizadas em kits diagnósticos comerciais. (AU)

Publicações científicas

(31)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; DE ARAUJO, JANSEN; MODHA, SEJAL; QUEIROZ, LUZIA HELENA; DURIGON, EDISON LUIZ; MURCIA, PABLO RAMIRO; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU. Krykfeie dicistrovirus: A novel dicistrovirus in velvety free-tailed bats from Brazil. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 75, NOV 2019. (12/24150-9, 17/13981-0, 16/01414-1, 06/00572-0, 13/14929-1, 14/20851-8, 15/05778-5)

TAURO, LAURA B.; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; ELISA RIVAROLA, MARIA; DE OLIVEIRA, RODRIGO; KONIGHEIM, BRENDA; SILVA, SANDRO PATROCA; LIMA, CLAYTON; OLIVEIRA, LAYANNA; VASCONCELOS, JANAINA M.; CARDOSO, JEDSON FERREIRA; et al. Genomic characterization of orthobunyavirus of veterinary importance in America. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 73, p. 205-209, SEP 2019. (17/13981-0)

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FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; ALVES ESPOSITO, DANILLO LUCAS; SILVA, ANGELICA; ROMEIRO, MARILIA FARIGNOLI; MARTINEZ, EDSON ZANGIACOMI; LOPES DA FONSECA, BENEDITO ANTONIO; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU. Enzyme-linked immunosorbent assay using recombinant envelope protein 2 antigen for diagnosis of Chikungunya virus. VIROLOGY JOURNAL, v. 15, JUL 24 2018. (16/01414-1, 14/02438-6, 12/24150-9, 17/13981-0, 14/20851-8)

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