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Caracterização de novos elementos regulatórios metagenômicos

Processo: 17/20818-9
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2018
Vigência (Término): 30 de junho de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia
Pesquisador responsável:María Eugenia Guazzaroni
Beneficiário:Tiago Cabral Borelli
Instituição-sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:15/04309-1 - Novas abordagens para melhorar a prospecção funcional de biocatalizadores em bibliotecas metagenômicas, AP.JP
Assunto(s):Expressão gênica   Regulação da expressão gênica   Fatores de transcrição   Transcrição genética   Metagenômica   Biologia sintética

Resumo

Compreender a expressão gênica em bactérias é fundamental para entender a lógica de tomada de decisão bacterianas, fornece ferramentas para Biologia Sintética e estudar a regulação da expressão gênica em comunidades microbianas. Em procariotos existem dois principais níveis no controle no início da transcrição. O primeiro são os fatores sigma (Ã) que dão especificidade à RNA polimerase guiando-a para determinados promotores; depois estão os fatores de transcrição (FT) que promovem ou reprimem a transcrição, formando um fino mecanismo de controle. O presente projeto tem como objetivo caracterizar a influência dos sigmas Ã70(RpoD), Ã38(RpoS) e Ã32(RpoH) e dos fatores de transcrição CRP e IHF sobre promotores metagenômicos usando cepas mutantes RpoS, RpoS, RpoH, CRP, IHF e selvagens wtRpoS, wtRpoS wtRpoH, wtCRP, wtIHF. Nossos resultados preliminares indicam que é de fundamental importância que as medições sejam feitas na fase estacionária da curva de crescimento bacteriano para garantir a presenta de Ã38(RpoS), inerente a esse período, bem como impedir viés imposto pela diferença de crescimento das cepas MC4100 (wtRpoH) e K16 (RpoH) antes da fase estacionária (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
LUANA DE FÁTIMA ALVES; TIAGO CABRAL BORELLI; CAUÃ ANTUNES WESTMANN; RAFAEL SILVA-ROCHA; MARÍA-EUGENIA GUAZZARONI. Boundaries in metagenomic screenings using lacZα-based vectors. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 43, n. 1, p. -, 2020.
ALVES, LUANA DE FATIMA; BORELLI, TIAGO CABRAL; WESTMANN, CAUA ANTUNES; SILVA-ROCHA, RAFAEL; GUAZZARONI, MARIA-EUGENIA. Boundaries in metagenomic screenings using lacZ alpha-based vectors. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 43, n. 1 2020. Citações Web of Science: 0.
ALVES, LUANA DE FATIMA; WESTMANN, CAUA ANTUNES; LOVATE, GABRIEL LENCIONI; VIANA DE SIQUEIRA, GUILHERME MARCELINO; BORELLI, TIAGO CABRAL; GUAZZARONI, MARIA-EUGENIA. Metagenomic Approaches for Understanding New Concepts in Microbial Science. INTERNATIONAL JOURNAL OF GENOMICS, 2018. Citações Web of Science: 4.

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