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Descoberta de ligantes como inibidores da diidropteroato sintase de Xanthomonas albilineans

Processo: 17/17816-4
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
Vigência (Início): 23 de janeiro de 2018
Vigência (Término): 22 de janeiro de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Rafael Victorio Carvalho Guido
Beneficiário:Andrew Albert de Oliveira
Supervisor no Exterior: Marko Hyvonen
Instituição-sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos, SP, Brasil
Local de pesquisa : University of Cambridge, Inglaterra  
Vinculado à bolsa:15/07005-3 - Estudos de Biologia Estrutural e Química Medicinal para a descoberta e planejamento de novos agroquímicos, BP.DD

Resumo

Derivados da cana-de-açúcar são atualmente os maiores contribuidores para a produção de bioenergia. Entretanto, as ocorrências de doenças severas afetam negativamente a produtividade canavieira. Uma destas condições é a Escaldadura das Folhas, a qual é causada pela bactéria gram-negativa Xanthomonas albilineans. A fitodoença causa drástica redução da qualidade do caldo extraído, desencadeando na perda de produção. A ausência de controles, químico ou biológico, para o tratamento da fitodoença justifica a pesquisa e desenvolvimento de novas moléculas bioativas que sejam efetivas e seletivas, como um novo agroquímico. Uma via metabólica atrativa a ser explorada para este propósito é a via de síntese dos folatos. Enzimas envolvidas na síntese e modificação dos folatos são validadas como alvo molecular para o desenvolvimento de inibidores. Neste contexto, a enzima Diidropteroato sintase (XaDHPS) é essencial para a biosíntese de folatos e tem sido explorada e caracterizada como alvo para descoberta de inibidores. Previamente, foram realizadas a caracterização estrutural e funcional da XaDHPS em nosso laboratório, o que nos fornece a base molecular para explorar o alvo na triagem e descoberta de novos inibidores. Nesta proposta investigaremos, com a aplicação dos métodos de descoberta de inibidores com base na estrutura do fragmento (FBDD), a diversidade química necessária, direcionada ao desenvolvimento de um novo inibidor para a enzima XaDHPS. Os ligantes identificados por esta estratégia serão caracterizados por métodos biofísicos visando o melhor entendimento das iterações moleculares. O inibidor mais potente será testado in vitro contra a bactéria X. albilineans. O sucesso será alcançado através da abordagem multidisciplinar para identificação de inibidores da XaDHPS, e assim, desenvolver candidatos líderes que atuem como agroquímicos.

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