Formação de carapaça nos Arcellinida (Amoebozoa): Geração de transcriptomas de Cryptodifflugia durante a formação da carapaça e otimização de transcriptomas e análises de famílias gênicas

• Processo: 17/19388-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
• Vigência (Início): 01 de março de 2018
• Vigência (Término): 30 de junho de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Daniel José Galafasse Lahr
• Beneficiário: Alfredo Leonardo Porfirio de Sousa
• Supervisor: Matthew William Brown
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Local de pesquisa: Mississippi State University (MSU), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 16/14317-4 - Identificação de genes envolvidos na formação da teca em Arcella intermedia leavis através de transcriptomas, BP.MS
• Assunto(s): Evolução molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Differential gene expression | Evolutionary novelty | molecular evolution | Shell biogenesis | Testate amoeba | Transcriptomica e expresão gênica

Resumo

Conchas (tecas) estão presentes em diversas linhagens eucarióticas. As amebas tecadas formam um grupo polifilético diverso dentro dos Eucariotos, compreendendo apenas organismos unicelulares tecados. Apesar do campo diverso que estuda as amebas tecadas não temos informações moleculares relacionadas à origem e evolução das carapaças das amebas tecadas. Arcellinida é um grupo monofilético de amebas tecadas dentro de Amoebozoa, uma linhagem chave para estudar a origem e evolução de suas carapaças. Neste projeto, propomos a geração de transcriptomas de Cryptodifflugia operculata (Amoebozoa: Arcellinida) durante a formação de teca e durante o estágio vegetativo para identificar os genes responsáveis pela formação da carapaça. Cryptodifflugia é um gênero basal de Arcellinida, distante do gênero Arcella (gênero que estamos estudando atualmente). Isso nos permitirá analisar se os Arcellinidas constrõem carapaças usando genes/proteínas conservados, genes/proteínas espécie-específicos, ou ambos. Além disso, otimizaremos nossos pipelines de análise de transcriptoma e pipelines de análise de famílias gênicas. A inclusão do gênero Cryptodifflugia e a otimização da análise de transcriptomas e famílias gênicas permitirão esclarecer molecularmente a origem e evolução da carapaça nos Arcellinida.