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Investigando o metabolismo secundário de Brasilonema (Cyanobacteria: Scytonemataceae)

Processo: 18/01563-2
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de julho de 2018
Vigência (Término): 30 de junho de 2019
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia
Pesquisador responsável:Alessandro de Mello Varani
Beneficiário:Danillo Oliveira de Alvarenga
Supervisor: Anna Kaarina Sivonen
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Local de pesquisa: University of Helsinki, Finlândia  
Vinculado à bolsa:15/14600-5 - Genômica comparativa de isolados de Brasilonema (Cyanobacteria, Scytonemataceae) para identificação de genes relacionados à infecção de folhas de Eucalyptus grandis, BP.PD
Assunto(s):Produtos naturais   Moléculas bioativas   Mineração de genoma
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:mineração genômica | Moléculas bioativas | Produtos Naturais | patogenômica

Resumo

Brasilonema é um gênero cianobacteriano no qual estão classificadas as únicas oxifotobactérias conhecidas por infectar plantas. O estudo de genomas de micro-organismos deste gênero pode trazer diversas contribuições, incluindo uma melhor compreensão da diversidade do metabolismo secundário e o possível papel de suas moléculas bioativas. Anteriormente, como parte do projeto "Genômica comparativa de isolados de Brasilonema (Cyanobacteria, Scytonemataceae) para identificação de genes relacionados à infecção de folhas de Eucalyptus grandis" (FAPESP nº 2015/146005), um número considerável de agrupamentos gênicos preditos como envolvidos no metabolismo secundário foram identificados nos genomas de duas linhagens de Brasilonema spp. O objetivo desta proposta de pesquisa é analisar os metabólitos secundários produzidos pelas linhagens B. octagenarum UFV-E1 e B. sennae CENA114 e identificar possíveis agrupamentos gênicos que codifiquem enzimas envolvidas em sua biossíntese. Para esse fim, células de culturas de UFV-E1 e CENA114 serão cultivadas em meio BG-110 líquido por três semanas e usadas para a produção de extratos brutos, os quais terão sua capacidade de inibir linhagens de patógenos microbianos testada. Extratos positivos serão fracionados e sujeitos a análises de cromatografia líquida/espectrometria de massas para identificação estrutural. As moléculas caracterizadas serão então correlacionadas a agrupamentos preditos contendo os genes para suas possíveis enzimas biossintéticas. Espera-se que novas moléculas e/ou novas variantes de moléculas produzidas por linhagens de Brasilonema sejam encontradas e atribuídas a suas possíveis vias biossintéticas.

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Publicações científicas (6)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
AHMED, MUHAMMAD N.; WAHLSTEN, MATTI; JOKELA, JOUNI; NEES, MATTHIAS; STENMAN, ULF-HAKAN; ALVARENGA, DANILLO O.; STRANDIN, TOMAS; SIVONEN, KAARINA; POSO, ANTTI; PERMI, PERTTU; et al. Potent Inhibitor of Human Trypsins from the Aeruginosin Family of Natural Products. ACS Chemical Biology, v. 16, n. 11, p. 10-pg., . (18/01563-2)
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SHISHIDO, TANIA KEIKO; JOKELA, JOUNI; HUMISTO, ANU; SUURNAKKI, SUVI; WAHLSTEN, MATTI; ALVARENGA, DANILLO O.; SIVONEN, KAARINA; FEWER, DAVID P.. The Biosynthesis of Rare Homo-Amino Acid Containing Variants of Microcystin by a Benthic Cyanobacterium. MARINE DRUGS, v. 17, n. 5, . (18/01563-2)
GERALDES, VANESSA; DE MEDEIROS, LIVIA SOMAN; LIMA, STELLA T.; ALVARENGA, DANILLO OLIVEIRA; GACESA, RANKO; LONG, PAUL F.; FIORE, MARLI FATIMA; PINTO, ERNANI. Genetic and biochemical evidence for redundant pathways leading to mycosporine-like amino acid biosynthesis in the cyanobacterium Sphaerospermopsis torques-reginae ITEP-024. ALGAE, v. 35, n. 2, p. 177-187, . (14/50420-9, 15/22742-4, 18/01563-2)
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POPIN, RAFAEL VICENTINI; ALVARENGA, DANILLO OLIVEIRA; CASTELO-BRANCO, RAQUEL; FEWER, DAVID PETER; SIVONEN, KAARINA. Mining of Cyanobacterial Genomes Indicates Natural Product Biosynthetic Gene Clusters Located in Conjugative Plasmids. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 12, . (18/01563-2)

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