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Diversidade de microbiomas de animais da raça Nelore frente à diferentes dietas e sua influência em características de produção e emissão de metano

Processo: 17/12642-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de março de 2018
Vigência (Término): 15 de outubro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Luciana Correia de Almeida Regitano
Beneficiário:Bruno Gabriel Nascimento Andrade
Instituição-sede: Embrapa Pecuária Sudeste. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). São Carlos , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):19/15557-7 - Associações do microbioma de Nelore com metadados do hospedeiro utilizando aprendizado de máquina e redes convolucionais, BE.EP.PD
Assunto(s):Bos taurus   Microbiota

Resumo

O sucesso que diferentes espécies de ruminantes tem em colonizar diversos ambientes terrestres se deve a capacidade ímpar de ingerir e metabolizar celulose, encontrada de forma abundante no ambiente natural em folhas e gramíneas. Esta característica ímpar se deve a existência de uma estrutura única conhecida como rúmen e a uma complexa comunidade composta por microrganismos residentes neste, conhecida como microbioma. Assim como o rúmen, o microbioma intestinal possui grande importância no desenvolvimento e saúde do hospedeiro, sendo que mudanças na abundância e/ou na diversidade podem ter efeitos dramáticos, como o aumento de susceptibilidade a doenças e problemas no desenvolvimento do animal. Avanços em técnicas de sequenciamento de DNA permitem explorar a diversidade de microrganismos que não são passíveis de cultivo, tal método é conhecido como metagenômica e pode ser aplicada diretamente ao conjuntos de genes da comunidade (sequenciamento profundo) ou através do sequenciamento do gene codificador do RNA ribossomal (16 ou 18s). Análises prévias indicam uma diferença significativa em fenótipos, como a emissão de metano, para animais de diferentes dietas, portanto, esta pesquisa tem como objetivo explorar a diversidade de microrganismos encontrados nos microbiomas do rúmen e do intestino grosso de 50 animais submetidos a duas condições alimentares, identificando a possível relação da abundância de taxas com a dieta empregada e características fenotípicas, bem como a existência de interdependência entre taxas de ambos microbiomas em um mesmo animal. O sequenciamento desses microbiomas ampliará o volume e diversidade de dados gerados previamente pelo grupo de pesquisa em animais da raça Nelore, introduzindo uma nova fonte de informação às múltiplas camadas de dados genômicos (perfil de mRNA, de miRNA e proteômico do músculo, marcadores SNPs em alta densidade e sequenciamento genômico) devendo contribuir para o aprofundamento do conhecimento acerca da relação entre microbiomas e características do hospedeiro.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ANDRADE, BRUNO G. N.; BRESSANI, FLAVIA A.; CUADRAT, RAFAEL R. C.; TIZIOTO, POLYANA C.; DE OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; MOURAO, GERSON B.; COUTINHO, LUIZ L.; REECY, JAMES M.; KOLTES, JAMES E.; WALSH, PAUL; BERNDT, ALEXANDRE; PALHARES, JULIO C. P.; REGITANO, LUCIANA C. A. The structure of microbial populations in Nelore GIT reveals inter-dependency of methanogens in feces and rumen. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE AND BIOTECHNOLOGY, v. 11, n. 1 FEB 24 2020. Citações Web of Science: 0.

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