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Preparo de amostras e LC-MS para análises metabolômica e expossômica: estudos e aplicação para matrizes biológicas diversas

Processo: 18/01448-9
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Pesquisa
Vigência (Início): 01 de julho de 2018
Vigência (Término): 30 de junho de 2019
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Analítica
Pesquisador responsável:Alvaro José dos Santos Neto
Beneficiário:Alvaro José dos Santos Neto
Anfitrião: Caroline Helen Johnson
Instituição-sede: Instituto de Química de São Carlos (IQSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Local de pesquisa : Yale University, Estados Unidos  
Vinculado ao auxílio:17/02147-0 - Cromatografia líquida em uma gota e seu acoplamento com espectrometria de massas: estratégias instrumentais, desenvolvimento de materiais, automatização e aplicações analíticas, AP.TEM
Assunto(s):Separação   Toxicologia ambiental   Metabolômica   Metaboloma   Nascimento prematuro   Cordão umbilical

Resumo

A metabolômica tem requerido a evolução de protocolos analíticos e de bioinformática. Os avanços nessa ciência demonstram aplicações que vão de microrganismos e plantas até problemas toxicológico/ambientais relacionados à exposição de humanos a contaminantes químicos. O sucesso de um experimento em metabolômica depende de planejamento, coleta da amostra, extração, análise do extrato, processamento dos dados e análise estatística, etapas que ainda requerem estudos. Nesta proposta, buscam-se avanços na análise de amostras biológicas por plataformas metabolômicas baseadas em LC-MS, bem como o desenvolvimento de análises de contaminantes químicos do ambiente nessas amostras, com aplicações em expossômica. Os conhecimentos do proponente em microextrações e LC-MS serão associados à especialização e plataformas em metabolômica e expossômica, do grupo de pesquisa no exterior, de maneira a buscar-se evolução nas análises de toxicantes e metabólitos endógenos e exógenos por abordagens alvo e não-alvo, em diversas amostras relacionadas à gravidez (tecidos da placenta, soro do cordão umbilical e materno). Por meio de um protocolo de comparação entre partos a termo e pré-termo, técnicas e métodos miniaturizados de análise serão investigados na determinação do intervalo dinâmico de concentração de metabólitos, xenobióticos selecionados e seus produtos de biotransformação. Além dos avanços analíticos em miniaturização aplicados a metabolômica, deve-se avaliar: (i) a variação dos perfis metabólicos entre os diferentes tecidos e localização da amostragem (e.g., lado fetal ou materno da placenta), (ii) se uma amostragem aleatória é efetiva na análise metabolômica da placenta e demais tecidos, (iii) a existência/identidade de marcadores metabólicos de partos prematuros. Finalmente, o estágio propiciará a expansão dos conhecimentos do proponente nas áreas emergentes de metabolômica e expossômica, em grupo criteriosamente selecionado, e com perspectiva de futuras colaborações e aplicações no grupo do proponente, nessa área e a partir de demanda já existente nesse sentido, contribuindo para o sucesso dos projetos do grupo no país. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CAI, YUPING; RATTRAY, NICHOLAS J. W.; ZHANG, QIAN; MIRONOVA, VARVARA; SANTOS-NETO, ALVARO; MUCA, ENGJEL; VOLLMAR, ANA K. ROSEN; HSU, KUO-SHUN; RATTRAY, ZAHRA; CROSS, JUSTIN R.; ZHANG, YAWEI; PATY, PHILIP B.; KHAN, SAJID A.; JOHNSON, CAROLINE H. Tumor Tissue-Specific Biomarkers of Colorectal Cancer by Anatomic Location and Stage. METABOLITES, v. 10, n. 6 JUN 2020. Citações Web of Science: 0.
VOLLMAR, ANA K. ROSEN; RATTRAY, NICHOLAS J. W.; CAI, YUPING; SANTOS-NETO, ALVARO J.; DEZIEL, NICOLE C.; JUKIC, ANNE MARIE Z.; JOHNSON, CAROLINE H. Normalizing Untargeted Periconceptional Urinary Metabolomics Data: A Comparison of Approaches. METABOLITES, v. 9, n. 10 OCT 2019. Citações Web of Science: 0.

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