Avaliações taxonômica e funcional da comunidade microbiana envolvidas na ciclagem do metano nos solos da Amazônia Brasileira

• Processo: 17/26138-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de abril de 2018
• Vigência (Término): 30 de setembro de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia
• Acordo de Cooperação: NSF - Dimensions of Biodiversity e BIOTA
• Pesquisador responsável: Tsai Siu Mui
• Beneficiário: Fabiana da Silva Paula
• Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/50320-4 - Dimensões US-BIOTA - São Paulo: pesquisa colaborativa: integrando as dimensões da biodiversidade microbiana ao longo de áreas de alteração do uso da terra em florestas tropicais, AP.BTA.TEM
• Assunto(s): Ecologia microbiana Uso do solo Mudança climática Ciclos biogeoquímicos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Ciclos Biogeoquímicos | Ecologia microbiana | Mudanças Climáticas | Uso do solo | Microbiologia de solo

Resumo

Esta proposta visa estudar Bacteria/Archaea envolvidas no consumo/emissão de metano em solos sob diferentes usos da terra em comparação com a floresta natural. Estamos investigando vários recursos metabólicos através da modelagem in silico e integração funcional de dados -omics. A avaliação das frações funcionais das comunidades será mediada pela análise SIP (Stable Isotope Probing) e também pelo isolamento de organismos envolvidos no ciclo do metano. Com base em ambos os recursos, o DNA /RNA e os isolados marcados com SIP servirão para a reconstrução metabólica, gerando um conjunto inovador de dados de genes ativos e presentes em solos sob diferentes usos. A integração de tais dados com outras dimensões da biodiversidade na Amazônia pode levar a um modelo, cujo potencial preditivo será validado contra um conjunto de taxas de crescimento determinadas experimentalmente e dados fenotípicos de crescimento. Além disso, a integração de evidências a partir de dados proteômicos, fenômicos, fisiologia e modelagem metabólica nos permitirá revelar possíveis interferências nas mudanças dependentes de metano através da expressão gênica na rede metabólica global do ciclo de metano. Este estudo trará uma plataforma valiosa para pesquisas futuras sobre os estados funcionais celulares bacterianos para os processos microbianos de consumo/emissão de metano. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

GONTIJO, JULIA B.; PAULA, FABIANA S.; VENTURINI, ANDRESSA M.; MANDRO, JESSICA A.; BODELIER, PAUL L. E.; TSAI, SIU M.. Insights into the Genomic Potential of a Methylocystis sp. from Amazonian Floodplain Sediments. MICROORGANISMS, v. 10, n. 9, p. 11-pg., 2022-09-01. (18/14974-0, 14/50320-4, 17/26138-0, 19/25924-7, 19/25931-3)

GONTIJO, JULIA B.; PAULA, FABIANA S.; VENTURINI, ANDRESSA M.; YOSHIURA, CAIO A.; BORGES, CLOVIS D.; MOURA, JOSE MAURO S.; BOHANNAN, BRENDAN J. M.; NUSSLEIN, KLAUS; MAZZA RODRIGUES, JORGE L.; TSAI, SIU M.. Not just a methane source: Amazonian floodplain sediments harbour a high diversity of methanotrophs with different metabolic capabilities. Molecular Ecology, v. 30, n. 11, p. 2560-2572, JUN 2021. (14/50320-4, 17/26138-0, 18/14974-0, 17/09643-2, 15/13546-7, 19/25931-3)

VENTURINI, ANDRESSA M.; DIAS, NAISSA M. S.; GONTIJO, JULIA B.; YOSHIURA, CAIO A.; PAULA, FABIANA S.; MEYER, KYLE M.; NAKAMURA, FERNANDA M.; DA FRANCA, ALINE G.; BORGES, CLOVIS D.; BARLOW, JOS; et al. Increased soil moisture intensifies the impacts of forest-to-pasture conversion on methane emissions and methane-cycling communities in the Eastern Amazon. Environmental Research, v. 212, p. 13-pg., 2022-04-06. (14/50320-4, 15/13546-7, 15/08564-6, 19/25931-3, 17/09616-5, 17/26138-0, 15/19979-2, 16/11268-2, 17/09643-2, 17/09952-5, 15/12282-6, 18/14974-0)