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Avaliações taxonômica e funcional da comunidade microbiana envolvidas na ciclagem do metano nos solos da Amazônia Brasileira

Processo: 17/26138-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2018
Vigência (Término): 30 de setembro de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia
Convênio/Acordo: NSF - Dimensions of Biodiversity e BIOTA
Pesquisador responsável:Tsai Siu Mui
Beneficiário:Fabiana da Silva Paula
Instituição-sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/50320-4 - Dimensões US-BIOTA - São Paulo: pesquisa colaborativa: integrando as dimensões da biodiversidade microbiana ao longo de áreas de alteração do uso da terra em florestas tropicais, AP.BTA.TEM
Assunto(s):Ecologia microbiana   Uso do solo   Mudança climática   Ciclos biogeoquímicos

Resumo

Esta proposta visa estudar Bacteria/Archaea envolvidas no consumo/emissão de metano em solos sob diferentes usos da terra em comparação com a floresta natural. Estamos investigando vários recursos metabólicos através da modelagem in silico e integração funcional de dados -omics. A avaliação das frações funcionais das comunidades será mediada pela análise SIP (Stable Isotope Probing) e também pelo isolamento de organismos envolvidos no ciclo do metano. Com base em ambos os recursos, o DNA /RNA e os isolados marcados com SIP servirão para a reconstrução metabólica, gerando um conjunto inovador de dados de genes ativos e presentes em solos sob diferentes usos. A integração de tais dados com outras dimensões da biodiversidade na Amazônia pode levar a um modelo, cujo potencial preditivo será validado contra um conjunto de taxas de crescimento determinadas experimentalmente e dados fenotípicos de crescimento. Além disso, a integração de evidências a partir de dados proteômicos, fenômicos, fisiologia e modelagem metabólica nos permitirá revelar possíveis interferências nas mudanças dependentes de metano através da expressão gênica na rede metabólica global do ciclo de metano. Este estudo trará uma plataforma valiosa para pesquisas futuras sobre os estados funcionais celulares bacterianos para os processos microbianos de consumo/emissão de metano. (AU)