Busca avançada
Ano de início
Entree

Emprego de ferramentas estatísticas e redes moleculares para análises metabolômicas de Colletotrichum spp

Processo: 18/03679-8
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 05 de julho de 2018
Vigência (Término): 04 de julho de 2019
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
Pesquisador responsável:Roberto Gomes de Souza Berlinck
Beneficiário:Mirelle Takaki
Supervisor no Exterior: Roger Linington
Instituição-sede: Instituto de Química de São Carlos (IQSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Local de pesquisa : Simon Fraser University, Canadá  
Vinculado à bolsa:15/14114-3 - Quais componentes metabolômicos influenciam a fitopatogenicidade de Colletotrichum spp.?, BP.DR
Assunto(s):Metabolômica   Química de produtos naturais

Resumo

Nos últimos anos, a cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massa tornou-se uma ferramenta essencial para estudos de metabolômica. Estudos metabolômicos não-direcionados resultam em uma grande quantidade de dados. Estes grandes conjuntos de dados tornam a avaliação e a interpretação dos resultados da metabolômica altamente complexas. A anotação correta e a subseqüente identificação inequívoca de metabólitos a partir desses dados ainda representam um dos principais desafios nesta área. Na tentativa de superar estas barreiras, foram desenvolvidos métodos de pré-tratamento de dados, algoritmos de processamento e ferramentas de bioinformática. Uma dessas ferramentas é o Molecular Networking (MN), que tem sido amplamente utilizado em estudos de amostras complexas. Molecular Networking organiza dados MS/MS em redes moleculares, fornecendo uma visão geral de todos os compostos detectados e as relações químicas entre eles. Além de acelerar o processo de descoberta e caracterização de moléculas desconhecidas, MN oferece novas maneiras para a investigação do metaboloma de amostras biológicas. Outra abordagem é a plataforma Compound Activity Mapping, que rapidamente identifica e prevê a função biológica de novos componentes bioativos em amostras complexas diretamente dos dados primários de triagem. Esta ferramenta combina screening químico e biológico com análise de metabolômica não direcionada de alta resolução e permite selecionar compostos baseados em informações biológicas e/ou químicas relevantes Métodos estatísticos e de quimiometria multivariada também são amplamente utilizados em estudos metabolômicos, uma vez que esses métodos permitem a combinação de informações biológicas para a interpretação dos dados de metabolômica.Este projeto tem como objetivo realizar análises metabolômicas de linhagens de Colletotrichum fitopatogênicas e endofíticas, utilizando dados UPLC-MS/MS conjuntamente com a ferramenta de Compound Activity Mapping, Molecular Networking, análises estatísticas e quimiométricas para identificar quais os metabólitos secundários produzidos pelos fungos Colletotrichum são responsáveis por suas atividades fitotóxicas.

Mapa da distribuição dos acessos desta página
Para ver o sumário de acessos desta página, clique aqui.