| Processo: | 18/03679-8 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 05 de julho de 2018 |
| Data de Término da vigência: | 04 de julho de 2019 |
| Área de conhecimento: | Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica |
| Pesquisador responsável: | Roberto Gomes de Souza Berlinck |
| Beneficiário: | Mirelle Takaki |
| Supervisor: | Roger Linington |
| Instituição Sede: | Instituto de Química de São Carlos (IQSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | Simon Fraser University, Burnaby, Canadá |
| Vinculado à bolsa: | 15/14114-3 - Quais componentes metabolômicos influenciam a fitopatogenicidade de Colletotrichum spp.?, BP.DR |
| Assunto(s): | Biologia computacional Metabolômica Química de produtos naturais Colletotrichum |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Colletotrichum spp | fitopatogenicidade | Metabolomica | Química de Produtos Naturais |
Resumo Nos últimos anos, a cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massa tornou-se uma ferramenta essencial para estudos de metabolômica. Estudos metabolômicos não-direcionados resultam em uma grande quantidade de dados. Estes grandes conjuntos de dados tornam a avaliação e a interpretação dos resultados da metabolômica altamente complexas. A anotação correta e a subseqüente identificação inequívoca de metabólitos a partir desses dados ainda representam um dos principais desafios nesta área. Na tentativa de superar estas barreiras, foram desenvolvidos métodos de pré-tratamento de dados, algoritmos de processamento e ferramentas de bioinformática. Uma dessas ferramentas é o Molecular Networking (MN), que tem sido amplamente utilizado em estudos de amostras complexas. Molecular Networking organiza dados MS/MS em redes moleculares, fornecendo uma visão geral de todos os compostos detectados e as relações químicas entre eles. Além de acelerar o processo de descoberta e caracterização de moléculas desconhecidas, MN oferece novas maneiras para a investigação do metaboloma de amostras biológicas. Outra abordagem é a plataforma Compound Activity Mapping, que rapidamente identifica e prevê a função biológica de novos componentes bioativos em amostras complexas diretamente dos dados primários de triagem. Esta ferramenta combina screening químico e biológico com análise de metabolômica não direcionada de alta resolução e permite selecionar compostos baseados em informações biológicas e/ou químicas relevantes Métodos estatísticos e de quimiometria multivariada também são amplamente utilizados em estudos metabolômicos, uma vez que esses métodos permitem a combinação de informações biológicas para a interpretação dos dados de metabolômica. Este projeto tem como objetivo realizar análises metabolômicas de linhagens de Colletotrichum fitopatogênicas e endofíticas, utilizando dados UPLC-MS/MS conjuntamente com a ferramenta de Compound Activity Mapping, Molecular Networking, análises estatísticas e quimiométricas para identificar quais os metabólitos secundários produzidos pelos fungos Colletotrichum são responsáveis por suas atividades fitotóxicas. (AU) | |
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