Predição genômica aplicada à seleção recorrente recíproca em milho tropical para eficiência no uso de nitrogênio

• Processo: 17/25549-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2018
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia
• Pesquisador responsável: Roberto Fritsche Neto
• Beneficiário: Júlia Silva Morosini
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 19/06532-0 - Predição genômica aplicada à seleção recorrente recíproca em milho tropical para eficiência no uso do nitrogênio, BE.EP.DR
• Assunto(s): Melhoramento genético vegetal Acurácia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Acurácia | grupo heterótico | Índice de Seleção | matriz de parentesco genômico | Melhoramento vegetal

Resumo

Um dos pressupostos da análise dialélica consiste em assumir que os genitores são não-aparentados, o que na prática não ocorre e, portanto, pode conduzir a resultados viesados. Ademais, outro fator crítico em um programa de melhoramento de híbridos é a predição genômica ser realizada com base nos mesmos efeitos de substituição alélica para dois grupos heteróticos complementares. Isto pode direcionar a uma seleção convergente de genitores e, consequentemente, reduzir a probabilidade de obter híbridos com alta heterose ao longo dos ciclos. Nesse sentido, os objetivos são: i) estimar o efeito da matriz de parentesco genômico nas estimativas em análises dialélicas; ii) identificar o efeito da modelagem diferencial dos efeitos de marcadores em função dos grupos heteróticos em uma população de melhoramento de milho via seleção recorrente recíproca. A abordagem de modelos mistos será utilizada para condução das análises fenotípicas, dialélicas e de predição genômica. Os dados fenotípicos serão produtividade e índices de resposta ao nitrogênio em milho tropical obtidos em dois conjuntos de dados, USP e empresa Helix sementes Ltda. Para o primeiro objetivo, será incluída a matriz de parentesco genômico de VanRaden nas análises dialélicas de forma a verificar o efeito desta nas capacidades geral e específica de combinação (CGC e CEC), na formação de grupos heteróticos e na escolha de testadores. No segundo objetivo, três modelos de predição serão testados: i) efeitos aditivos comuns para toda a população; ii) efeitos aditivos-dominantes comuns para toda a população e iii) efeitos aditivos específicos para cada grupo heterótico e interação entre grupos - delineamento II de North Carolina entre genitores de dois grupos heteróticos. A partir dos resultados, pretende-se avaliar o efeito desta modelagem na acurácia preditiva, variabilidade dentro e distancia genética entre os grupos heteróticos ao longo dos ciclos de seleção.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MATIAS, FILIPE INACIO; MOROSINI, JULIA SILVA; ESPOLADOR, FERNANDO GARCIA; FRITSCHE-NETO, ROBERTO. Be-Breeder 2.0: A Web Application for Genetic Analyses in a Plant Breeding Context. CROP SCIENCE, v. 59, n. 4, p. 1371-1373, JUL-AUG 2019. (17/25549-6)

GALLI, GIOVANNI; ALVES, FILIPE COUTO; MOROSINI, JULIA SILVA; FRITSCHE-NETO, ROBERTO. On the usefulness of parental lines GWAS for predicting low heritability traits in tropical maize hybrids. PLoS One, v. 15, n. 2, FEB 7 2020. (13/24135-2, 17/24327-0, 17/25549-6)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

MOROSINI, Júlia Silva. Inferindo padrões heteróticos e o efeito da incorporação de desvios de dominância na predição de híbridos: um exemplo em milho tropical sob condições de estresse de nitrogênio. 2020. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.