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Exploração de dados de sequenciamento de nova geração para descobrir o conteúdo genômico e origem dos Cromossomos B

Processo: 18/03877-4
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 01 de agosto de 2018
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:César Martins
Beneficiário:Syed Farhan Ahmad
Supervisor no Exterior: Rachel Oneill
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Local de pesquisa : University of Connecticut (UCONN), Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:14/16477-3 - Análise genômica em larga escala aplicadas à biologia de Cromossomos B, BP.DR
Assunto(s):Genes   Genomas   Genômica   Biologia computacional   Evolução   Sequenciamento de nova geração

Resumo

Os cromossomos B (Bs), também conhecidos como cromossomos supernumerários ou acessórios, são adicionais e constituintes não essenciais de cariótipos. A origem genética, evolução e composição de Bs permanece ainda em debate. Nós sequenciamos os genomas completos de três espécies incluindo os peixes Astyanax mexicanus, Astyanax correntinus e o gafanhoto Abracris flavolinea com e sem Bs para identificar as seqüências localizadas em B. Aqui propomos um projeto de pesquisa (a ser desenvolvido durante um estágio de seis meses no exterior), visando investigar profundamente estes sequências através de aplicações de metodologias avançadas de genômica e bioinformática. A análise compreenderá etapas como análise comparativa e anotação de genes ao longo do cromossomo B, incluindo estudos evolutivos. O desenvolvimento do projeto atual permitirá a identificação de genes presentes em Bs de diferentes espécies e seu possível papel biológico e origem evolutiva. Além disso, o estágio facilitará o candidato de doutorado experimentar um atmosfera científica diferente em um laboratório nos EUA, o que contribuirá muito para sua carreira.