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Análise comparativa do genoma, transcriptoma e caracterização fenotípica de linhagens de Salmonella typhimurium isoladas de humanos e alimentos no Brasil

Processo: 17/06633-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2018
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Juliana Pfrimer Falcão
Beneficiário:Amanda Aparecida Seribelli
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Bacteriologia   Genomas   Análise de sequência de DNA   Transcriptoma   Salmonella typhimurium   Brasil

Resumo

Salmonella enterica subsp. enterica sorovariedade Typhimurium (S. Typhimurium) é uma das principais causas de gastroenterite em todo o mundo. Anualmente, ocorrem cerca de 93,8 milhões de casos de salmonelose no mundo ocasionados por Salmonella não-tifóide. Entretanto, no Brasil há poucos estudos que elucidaram possíveis diferenças na patogenicidade, virulência e diversidade genotípica de linhagens de S. Typhimurium isoladas de humanos e alimentos. Esse projeto tem como objetivos comparar o genoma, analisar o transcriptoma e o comportamento frente a testes fenotípicos de linhagens de S. Typhimurium isoladas de humanos e alimentos durante 31 anos em diferentes regiões do Brasil. A análise comparativa do genoma será realizada para 92 linhagens isoladas de humanos (43) e alimentos (49). Para 40 linhagens isoladas de humanos (20) e alimentos (20) serão realizados os testes fenotípicos de invasão a células epiteliais (CACO-2), ensaio de sobrevivência em macrófagos (J774), ensaio de tolerância ao stress ácido, ensaio de tolerância ao stress oxidativo. Ademais, será feito a análise do transcriptoma de duas linhagens de S. Typhimurium, os RNAs serão extraídos após os ensaios de tolerância ao stress ácido, ao stress oxidativo e em condições ideais de crescimento para tais linhagens. Além disto, será realizada a determinação da dose letal média (DL50) de duas linhagens selecionadas de S. Typhimurium. Ressalta-se que não existem trabalhos publicados que compararam linhagens de S. Typhimurium isoladas de períodos e de fontes distintas no país que reúnam análises do genoma completo, transcriptoma e testes fenotípicos acima mencionados. Em conjunto, os resultados a serem obtidos deverão contribuir para uma melhor caracterização da patogenicidade, virulência e diversidade genotípica desse importante enteropatógeno mundial. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
AP SERIBELLI, AMANDA; GONZALES, JULIA C.; DE ALMEIDA, FERNANDA; BENEVIDES, LEANDRO; CAZENTINI MEDEIROS, I, MARTA; RODRIGUES, DALIA DOS PRAZERES; SOARES, SIOMAR DE C.; ALLARD, MARC W.; FALCAO, JULIANA P. Phylogenetic analysis revealed that Salmonella Typhimurium ST313 isolated from humans and food in Brazil presented a high genomic similarity. Brazilian Journal of Microbiology, v. 51, n. 1, p. 53-64, MAR 2020. Citações Web of Science: 0.
ALMEIDA, FERNANDA; SERIBELLI, AMANDA APARECIDA; CAZENTINI MEDEIROS, MARTA INES; RODRIGUES, DALIA DOS PRAZERES; DE MELLOVARANI, ALESSANDRO; LUO, YAN; ALLARD, MARC W.; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Phylogenetic and antimicrobial resistance gene analysis of Salmonella Typhimurium strains isolated in Brazil by whole genome sequencing. PLoS One, v. 13, n. 8 AUG 13 2018. Citações Web of Science: 6.

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