Análise comparativa do genoma completo, transcriptoma e caracterização fenotípica de linhagens de Campylobacter jejuni isoladas de diversas fontes durante 20 anos no Brasil

• Processo: 18/06904-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2018
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Juliana Pfrimer Falcão
• Beneficiário: Miliane Rodrigues Frazão
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Bacteriologia Transcriptoma Campylobacter jejuni
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Campylobacter jejuni | Sequenciamento do genoma completo | Testes fenotípicos relacionados a virulência | Transcriptoma | Bacteriologia

Resumo

A campilobacteriose é uma zoonose de ampla distribuição mundial, sendo que a espécie Campylobacter jejuni é uma importante causa de gastroenterite em humanos em vários países da Europa, bem como nos Estados Unidos, Canadá, Austrália, dentre outros. Entretanto, no Brasil o estudo e o isolamento de C. jejuni não são realizados com frequência, o que dificulta a avaliação da importância e dimensão desse patógeno como causador de doença em humanos no nosso país. Esse projeto tem como objetivos analisar e comparar, por meio do sequenciamento do genoma completo, sequenciamento do transcriptoma e de testes fenotípicos relacionados à virulência linhagens de Campylobacter jejuni isoladas de humanos, animais, ambiente e alimentos ao longo de 20 anos no Brasil. A análise comparativa do genoma completo sequenciado será realizada para 116 linhagens de C. jejuni isoladas de humanos (47), animais (35), alimentos (32) e ambiente (02). Para 46 linhagens de C. jejuni isoladas de humanos (18), animais (14) e alimentos (14) serão realizados os testes fenotípicos de flutuação da temperatura, stress ácido e stress oxidativo, virulência em Galleria mellonella, invasão a células CACO-2 e multiplicação e sobrevivência em macrófagos de humanos U937. Ademais, será feita a análise do transcriptoma de seis linhagens de C. jejuni que apresentarem diferenças significativas frente aos testes fenotípicos de stress ácido e oxidativo, e os RNAs serão extraídos após submeter as linhagens a cada stress e também em condições ideais de crescimento. Devido à escassez de trabalhos envolvendo linhagens de C. jejuni no nosso país, estudos que objetivem a análise do genoma completo e a elucidação dos possíveis mecanismos de patogenicidade e virulência em tais linhagens são inovadores e de extrema importância. Portanto, os resultados a serem obtidos deverão contribuir para a caracterização de linhagens de C. jejuni isoladas durante 20 anos no Brasil, colaborando para um melhor entendimento desse patógeno de grande importância mundial.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FRAZAO, MILIANE RODRIGUES; CAO, GUOJIE; MEDEIROS, MARTA INES CAZENTINI; DUQUE, SHEILA DA SILVA; ALLARD, MARC WILLIAM; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Antimicrobial Resistance Profiles and Phylogenetic Analysis ofCampylobacter jejuniStrains Isolated in Brazil by Whole Genome Sequencing. MICROBIAL DRUG RESISTANCE, v. 27, n. 5, p. 660-669, MAY 1 2021. (14/13029-0, 16/24716-3, 18/06904-2, 19/19338-8)