Varredura genomica ampla por loci afetados pela seleção recente em raças bovinas de corte, taurina e zebuina, através de medidas compostas.

• Processo: 18/11460-6
• Linha de fomento: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de setembro de 2018
• Vigência (Término): 31 de agosto de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Humberto Tonhati
• Beneficiário: Diercles Francisco Cardoso
• Supervisor no Exterior: Antonio Reverter-Gomez
• Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Local de pesquisa: Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO), Austrália
• Vinculado à bolsa: 16/22490-8 - Mapeamento de assinaturas de seleção no genoma das principais espécies domésticas da tribo Bovini exploradas na pecuária, os bovinos (Bos taurus) e os bubalinos (Bubalus bubalis), BP.PD
• Assunto(s): Gado Nelore

Resumo

A combinação de diferentes metodologias estatísticas em uma medida composta, é sugerida como forma de melhorar o discernimento de verdadeiras assinaturas de seleção em dados genômicos populacionais. O presente projeto propõem a utilização a varredura por assinaturas de seleção no genoma de bovinos das raças Nelore e Angus, por meio do método composto intitulado 'de-correlated composite of multiple signals' (DCMS), que combina oito estatísticas distintas, com ponderações pela correlação entre elas, em um único valor. As estatísticas que compõem o DCMS incluem cinco abordagens intra-populacionais (D de Tajima, D* de Fu e Li, F* de Fu e Li, Composite Likelihood Ratio - "CLR" e integrated Haplotype Score - "iHS") e três abordagens inter-populacionais ( Índice de Fixação de Wright - "FST", Cross-Population Composite Likelihood Ratio - "XPCLR" e Cross-Population Extended Haplotype Homozygosity - "XPEHH"). A população analisada neste estudo se constituirá de aproximadamente 700 animais de cada raça, com informações genotípicas para aproximadamente 150K SNPs. Após identificação das assinaturas de seleção em cada raça, elas serão criteriosamente avaliadas quanto a sobreposição com QTL previamente conhecidos e funcionalidade de genes nelas mapeados.