Avaliação do desempenho do escore poligênico de risco e da interação gene ambiente em uma amostra brasileira miscigenada

• Processo: 18/09328-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 29 de outubro de 2018
• Data de Término da vigência: 28 de outubro de 2019
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Psiquiatria
• Pesquisador responsável: Síntia Iole Nogueira Belangero
• Beneficiário: Marcos Leite Santoro
• Supervisor: Benjamin Neale
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Massachusetts General Hospital, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 16/13737-0 - Análise do escore poligênico e caracterização do perfil de expressão gênica em crianças e adolescentes em risco para transtornos psiquiátricos, BP.PD
• Assunto(s): Genética psiquiátrica Transtorno do deficit de atenção com hiperatividade Depressão Psiquiatria infantil
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: depressão | Escore poligênico de risco | interação gene ambiente | Psiquiatria Infantil | Transtorno do déficit de atenção com hiperatividade | transtornos psiquiátricos | Genética psiquiátrica / Psiquiatria infantojuvenil

Resumo

Este estudo tem como objetivo caracterizar a miscigenação de uma coorte longitudinal de crianças e adolescentes (INPD) e compreender como a ancestralidade influencia o escore poligênico de risco (PRS) em transtornos psiquiátricos (TP) nessa coorte. Ademais, simularemos genótipos latino-americanos para descobrir qual é o melhor painel de referência para caracterizar com precisão a miscigenação. Além disso, aproveitando a abordagem longitudinal do INPD, pretendemos explorar quais genótipos predispõem ao aparecimento da depressão (MDD) e do transtorno do déficit de atenção e hiperatividade (TDAH). Usaremos os dados de Avaliação de Desenvolvimento e Bem-Estar (DAWBA) para definir os diagnósticos psiquiátricos e outras escalas, aplicados com os pais e com os adolescentes. Os dados de genotipagem já estão disponíveis para 2240 indivíduos. Usaremos os haplótipos disponíveis do Projeto Simons Diversity Genome (SGDP) e o projeto 1000 Genomes como referência, aplicando (1) ADMIXTURE e RFMix para inferir ancestralidade local e (2) Admix-simu para simular os genótipos latino-americanos e para definir qual é a maneira mais precisa de inferir ancestralidade para amostras miscigenadas. O PRS será gerado com o Plink utilizando como amostra base os resultados mais recentes do consórcio de genética psiquiátrica (PGC). Com este estudo, esperamos caracterizar a mistura de nossa amostra e entender como isso influencia o PRS, bem como explorar interações gene-ambiente no risco de TPs. (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ATKINSON, ELIZABETH G.; MAIHOFER, ADAM X.; KANAI, MASAHIRO; MARTIN, ALICIA R.; KARCZEWSKI, KONRAD J.; SANTORO, MARCOS L.; ULIRSCH, JACOB C.; KAMATANI, YOICHIRO; OKADA, YUKINORI; FINUCANE, HILARY K.; et al. Tractor uses local ancestry to enable the inclusion of admixed individuals in GWAS and to boost power. Nature Genetics, v. 53, n. 2, JAN 2021. (18/09328-2)

ATKINSON, ELIZABETH G.; MAIHOFER, ADAM X.; KANAI, MASAHIRO; MARTIN, ALICIA R.; KARCZEWSKI, KONRAD J.; SANTORO, MARCOS L.; ULIRSCH, JACOB C.; KAMATANI, YOICHIRO; OKADA, YUKINORI; FINUCANE, HILARY K.; et al. Tractor uses local ancestry to enable the inclusion of admixed individuals in GWAS and to boost power. Nature Genetics, v. 53, n. 2, p. 195+, FEB 2021. (18/09328-2)

ATKINSON, ELIZABETH; MAIHOFER, ADAM; KANAI, MASAHIRO; MARTIN, ALICIA; KARCZEWSKI, KONRAD; SANTORO, MARCOS; ULIRSCH, JACOB; KAMATANI, YOICHIRO; OKADA, YUKINORI; FINUCANE, HILARY; et al. Gene Discovery in Admixed Cohorts With Tractor. BIOLOGICAL PSYCHIATRY, v. 89, n. 9, p. 1-pg., 2021-05-01. (18/09328-2)

ATKINSON, ELIZABETH G.; MAIHOFER, ADAM X.; KANAI, MASAHIRO; MARTIN, ALICIA R.; KARCZEWSKI, KONRAD J.; SANTORO, MARCOS L.; ULIRSCH, JACOB C.; KAMATANI, YOICHIRO; OKADA, YUKINORI; FINUCANE, HILARY K.; et al. Tractor uses local ancestry to enable the inclusion of admixed individuals in GWAS and to boost power. Nature Genetics, v. 53, n. 2, p. 21-pg., 2021-01-18. (18/09328-2)