Investigação metagenômica dos microbiomas de plantas adaptadas à limitação nutricional de fósforo

• Processo: 18/04240-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2018
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Marcelo Falsarella Carazzolle
• Beneficiário: Antônio Pedro de Castello Branco da Rocha Camargo
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Metagenômica Análise de sequência de DNA Transcriptômica Bioma Plantas Nutrição vegetal Fósforo Desenvolvimento de tecnologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: fósforo | metagenômica | Microbioma | Velloziaceae | Bioinformática

Resumo

O fósforo é um nutriente essencial para o desenvolvimento das plantas e, portanto, é intensamente consumido por sistema agricultura modernos. Para reduzir a dependência dos fertilizantes à base de fosfato, uma possível estratégia é a utilização de inóculos de microrganismos capazes de aumentar a captação de fósforo pelas plantas. Dessa forma, microbiomas de plantas que colonizam solos pobres em fósforo representam um reservatório natural de microrganismos de potencial biotecnológico. Nesse contexto, propomos a investigação bioinformática dos metagenomas de comunidades microbianas associadas a duas espécies de planta que crescem nos solos extremamente pobres em fósforo dos campos rupestres brasileiros. Ao longo do desenvolvimento deste projeto, serão analisados dados de sequenciamento genômico e transcriptômico dessas comunidades com o objetivo de desvendar as suas composições taxonômicas e mecanismos moleculares. Com esses resultados, esperamos compreender melhor o papel dos microbiomas na nutrição de plantas sob limitação de fósforo e contribuir para o desenvolvimento de novas tecnologias de uso agrícola. (AU)

Publicações científicas

(7)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ALMEIDA, LUDIMILA DIAS; SILVA, ALI SALIM FARAJ; MOTA, DANIEL CALIXTO; VASCONCELOS, ADRIELLE AYUMI; CAMARGO, ANTONIO PEDRO; PIRES, GABRIEL SILVA; FURLAN, MONIQUE; FREIRE, HELENA MARTINS RIBEIRO DA CUNHA; KLIPPEL, ANGELICA HOLLUNDER; SILVA, SUELEN FERNANDES; et al. Yeast Double Transporter Gene Deletion Library for Identification of Xenobiotic Carriers in Low or High Throughput. MBIO, v. 12, n. 6, NOV-DEC 2021. (17/13015-7, 19/14146-3, 17/01986-8, 18/04240-0, 18/05328-8, 18/16672-1, 15/03553-6, 19/17876-2)

VASCONCELOS, ADRIELLE A.; JOSE, JULIANA; TOKIMATU, PAULO M.; CAMARGO, ANTONIO P.; TEIXEIRA, PAULO J. P. L.; THOMAZELLA, DANIELA P. T.; DO PRADO, V, PAULA F.; FIORIN, GABRIEL L.; COSTA, JULIANA L.; FIGUEIRA, ANTONIO; et al. Adaptive evolution of Moniliophthora PR-1 proteins towards its pathogenic lifestyle. BMC ECOLOGY AND EVOLUTION, v. 21, n. 1, MAY 14 2021. (16/10498-4, 18/04240-0, 14/06181-0, 13/09878-9, 13/08293-7, 17/13015-7, 14/00802-2, 09/51018-1, 17/13319-6, 13/05979-5, 13/04309-6, 11/23315-1)

CAMARGO, ANTONIO P.; SOURKOV, VSEVOLOD; PEREIRA, GONCALO A. G.; CARAZZOLLE, MARCELO F.. RNAsamba: neural network-based assessment of the protein-coding potential of RNA sequences. NAR GENOMICS AND BIOINFORMATICS, v. 2, n. 1, p. 12-pg., 2020-03-01. (13/08293-7, 18/04240-0)

CAMARGO, ANTONIO P.; DE SOUZA, RAFAEL S. C.; JOSE, JULIANA; GERHARDT, ISABEL R.; DANTE, RICARDO A.; MUKHERJEE, SUPRATIM; HUNTEMANN, MARCEL; KYRPIDES, NIKOS C.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; ARRUDA, PAULO. Plant microbiomes harbor potential to promote nutrient turnover in impoverished substrates of a Brazilian biodiversity hotspot. ISME Journal, v. N/A, p. 17-pg., 2022-12-20. (18/19100-9, 18/04240-0, 16/23218-0)

CAMARGO, ANTONIO PEDRO; CORREA DE SOUZA, RAFAEL SOARES; COSTA, PATRICIA DE BRITTO; GERHARDT, ISABEL RODRIGUES; DANTE, RICARDO AUGUSTO; TEODORO, GRAZIELLE SALES; ABRAHAO, ANNA; LAMBERS, HANS; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; HUNTEMANN, MARCEL; et al. Microbiomes of Velloziaceae from phosphorus-impoverished soils of the campos rupestres, a biodiversity hotspot. SCIENTIFIC DATA, v. 6, JUL 31 2019. (16/23218-0, 18/04240-0)

NAYFACH, STEPHEN; CAMARGO, ANTONIO PEDRO; SCHULZ, FREDERIK; ELOE-FADROSH, EMILEY; ROUX, SIMON; KYRPIDES, NIKOS C.. CheckV assesses the quality and completeness of metagenome-assembled viral genomes. NATURE BIOTECHNOLOGY, v. 39, n. 5, DEC 2020. (16/23218-0, 18/04240-0)

PAPES, FABIO; CAMARGO, ANTONIO P.; DE SOUZA, JANAINA S.; CARVALHO, VINICIUS M. A.; SZETO, RYAN A.; LAMONTAGNE, ERIN; TEIXEIRA, JOSE R.; AVANSINI, SIMONI H.; SANCHEZ-SANCHEZ, SANDRA M.; NAKAHARA, THIAGO S.; et al. Transcription Factor 4 loss-of-function is associated with deficits in progenitor proliferation and cortical neuron content. NATURE COMMUNICATIONS, v. 13, n. 1, p. 26-pg., 2022-05-02. (20/11451-7, 18/04240-0, 18/03613-7)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

CAMARGO, Antônio Pedro de Castello Branco da Rocha. Investigação metagenômica dos microbiomas de plantas adaptadas à limitação nutricional. 2021. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.