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Uso de simulações em seleção genômica para avanços em programas de melhoramento de seringueira

Processo: 18/14305-1
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de novembro de 2018
Vigência (Término): 31 de outubro de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Luciano Henrique Braz dos Santos
Supervisor no Exterior: John Micheal Hickey
Instituição-sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Local de pesquisa : University of Edinburgh, Escócia  
Vinculado à bolsa:17/07908-9 - Análises genéticas e genômicas no gênero Hevea visando contribuir para o melhoramento genético de Hevea brasiliensis, BP.DD
Assunto(s):Melhoramento genético vegetal   Polimorfismo de um único nucleotídeo   Seleção genômica   Seringueira

Resumo

A seringueira (Hevea brasiliensis) é a principal fonte comercial de borracha natural, utilizada em diversos produtos, incluindo pneus e dispositivos médicos. Apesar de sua importância, esta árvore apresenta um longo ciclo de geração, o que explica o lento progresso no melhoramento, geralmente 30 anos por ciclo usando métodos tradicionais. Considerando o tempo de reprodução, qualquer ferramenta que reduza esse tempo, como a seleção assistida por marcadores, pode representar uma vantagem para a cultura. Com o desenvolvimento da tecnologia de sequenciamento de próxima geração, o custo dos métodos de sequenciamento de DNA diminuiu, tornando possível o uso da genotipagem por sequenciamento (GBS) em muitos estudos. A seleção genômica pode reduzir o tempo de melhoramento da seringueira usando equações de predição com parâmetros baseados em indivíduos genotipados e fenotipados para predizer os valores nos indivíduos que são candidatos à seleção e que possuem apenas dados genotípicos, evitando assim o longo tempo de fenotipagem utilizado para esta seleção. Resultados preliminares foram gerados no projeto de doutorado (2017 / 07908-9)m utilizando métodos GBS em estudos de desequilíbrio de ligação, possibilitando a utilização deste conjunto de dados para simular ciclos de seleção genômica e compará-los com os métodos tradicionais de melhoramento utilizados nesta cultura. Para analisar tais dados ou utilizar simulações, é de vital importância que se ocorra a colaboração com um grupo de pesquisa que tenha experiência no uso de simulações para a criação de um melhor programa de melhoramento genético com seleção genômica.

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