Análises genômica e evolutiva de Endotrypanum schaudinni

• Processo: 18/01284-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Vigência (Início): 01 de julho de 2018
• Vigência (Término): 30 de junho de 2020
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
• Pesquisador responsável: João Marcelo Pereira Alves
• Beneficiário: Percy Omar Tullume Vergara
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/14622-3 - Genômica comparativa de Trypanosomatidae, AP.JP
• Assunto(s): Genômica Protozoologia Kinetoplastida Endotrypanum
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Evolução | Genômica | Kinetoplastida | Protozoologia | Genômica

Resumo

Endotrypanum spp. é um protozoário parasita hemoflagelado (Ordem Kinetoplastida, Família Trypanosomatidae) com ciclo de vida digenético, alternado entre insetos vetores como os flebótomos e hospedeiros mamíferos. Endotrypanum é o único entre os Trypanosomatidae que infecta eritrócitos de mamíferos, como as preguiças dos gêneros Choloepus e Bradypus. Endotrypanum schaudinni apresenta ampla distribuição geográfica nas Américas, desde a Costa Rica, ao norte, até a bacia Amazônica, ao sul. O gênero Endotrypanum tem sido considerado controverso em seus aspectos taxonômicos, principalmente devido ao fato de seu ciclo de vida não ser conhecido em sua totalidade; foram identificadas duas formas celulares (epimastigota e tripomastigota) que são encontradas em eritrócitos de preguiças naturalmente infectadas. Estudos de filogenia molecular demonstram que o gênero Endotrypanum está relativamente próximo do grupo de Leishmania conhecidas como Paraleishmania e que contém as chamadas "Leishmanias enigmáticas", que receberam esta designação por estarem mais relacionadas ao gênero Endotrypanum. Este projeto tem como objetivo caracterizar e comparar o genoma de E. schaudinni TCC224 com os de outros tripanossomatídeos e kinetoplastídeos através de técnicas de bioinformática. O genoma do parasita foi previamente sequenciado e montado por nosso grupo e seus colaboradores, e será anotado e comparado com os genomas dos outros organismos neste trabalho. Por comparação com espécies aparentadas de interesse biomédico como Leishmania spp., as técnicas bioinformáticas aqui empregadas nos permitirão o melhor conhecimento do genoma de E. schaudinni, fornecendo uma série de novos dados moleculares, metabólicos e evolutivos, levando à proposta de novas hipóteses sobre a evolução de genomas e do parasitismo na família Trypanosomatidae.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ROMULO AGUILAR-GAMBOA, FRANKLIN; ALBERTO SALCEDO-MEJIA, LUIS; MIGUEL SERQUEN-LOPEZ, LUIS; MECHAN-LLONTOP, MARCO ENRIQUE; OMAR TULLUME-VERGARA, PERCY; BONIFACIO-BRICENO, JUAN JOSE; SALAS-ASENCIOS, RAMSES; SILVA DIAZ, HEBER; CARDENAS, JUAN P.. Genomic Sequences and Analysis of Five SARS-CoV-2 Variants Obtained from Patients in Lambayeque, Peru. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 10, n. 1, JAN 2021. (18/01284-6)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

VERGARA, Percy Omar Tullume. Análise filogenômica e comparativa de Endotrypanum schaudinni TCC224. 2020. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI) São Paulo.