Avaliação do impacto de vírus emergentes e re-emergentes em hemoterapia e transplante de células-tronco por meio de técnicas moleculares avançadas

• Processo: 18/15826-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Jovens Pesquisadores
• Vigência (Início): 01 de agosto de 2018
• Vigência (Término): 31 de julho de 2021
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Svetoslav Nanev Slavov
• Beneficiário: Svetoslav Nanev Slavov
• Instituição Sede: Hemocentro de Ribeirão Preto. Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da USP (HCMRP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/23205-8 - Avaliação do impacto de vírus emergentes e re-emergentes em hemoterapia e transplante de células-tronco por meio de técnicas moleculares avançadas, AP.JP
• Assunto(s): Doenças transmissíveis Doenças parasitárias Virologia Serviço de hemoterapia Transplantados Metagenômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: metagenômica | Múltiplas transfusões | Pacientes transplantados | serviço de hemoterapia | Doenças Infecciosas E Parasitárias

Resumo

Nas últimas décadas, a atenção científica esteve amplamente voltada a uma área específica da virologia clínica que engloba os vírus emergentes e re-emergentes. Atribui-se isso ao fato desses agentes infecciosos terem sido reconhecidos como uma ameaça constante à saúde humana. Muitos deles podem ser transmitidos por procedimentos hemoterápicos, principalmente pela aplicação de hemoderivados e transplantes de células-tronco hematopoéticas (TCTH). Na maioria dos casos, as viroses emergentes estão representadas por vírus zoonóticos com ciclos naturais exóticos, que são transmitidos por vetores artrópodes. Sua disseminação entre a população humana pode estar relacionada a surtos de alta morbidade com muitas infecções assintomáticas que, por sua vez, podem impactar o processo hemoterápico. No Brasil, não foram desenvolvidos estudos abrangentes sobre tais infecções e sua ameaça real para os processos hemoterápicos é subestimada e pouco conhecida. Portanto, esta proposta visa investigar o impacto das viroses emergentes na área da hemoterapia utilizando sequenciamento de última geração e análise do metagenoma viral. Para tal finalidade, os estudos serão realizados em amostras de plasma obtidas de pacientes submetidos a TCTH, pacientes politransfundidos e unidades de sangue reprovadas. Outro objetivo desse projeto é uma avaliação contínua da prevalência de diferentes infecções arbovirais na população de doadores voluntários de sangue da região Noroeste do Estado de São Paulo. Esta região geográfica é sujeita a frequentes surtos de diversos arbovírus. Assim, este projeto contribuirá positivamente na compreensão do impacto dos vírus emergentes para a hemoterapia e capacitará os pesquisadores brasileiros na área de análise metagenômica e o sequenciamento de última geração. Esta proposta representa uma nova linha de pesquisa em centro de pesquisa já consolidado e conta com colaborações nacionais de importantes centros clínicos como o Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, Hospital Israelita "Albert Einstein", São Paulo, e a Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto-USP. Além disso, haverá a participarão de pesquisadores internacionais de importantes centros de virologia clínica e bioinformática da França e Alemanha (Instituto Pasteur; Centro de Transfusão Sanguínea de Paris, França; Instituto de Virologia da Universidade de Bonn, Alemanha). Por fim, esta proposta permitirá estabelecer um grupo multicêntrico e multidisciplinar de pesquisa em vírus emergentes e hemoterapia/transplantes.

Publicações científicas

(20)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; VALENCA, IAN N.; RUY, PATRICIA DE CASSIA; XIMENEZ, JOAO P. B.; SILVA JUNIOR, WILSON A.; COVAS, DIMAS T.; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV N.. The novel coronavirus SARS-CoV-2: From a zoonotic infection to coronavirus disease 2019. Journal of Medical Virology, v. 92, n. 11, JUN 2020. (19/08528-0, 18/15826-5, 19/07861-8)

NUNES VALENCA, I; SILVA-PINTO, A. C.; ARAUJO DA SILVA JUNIOR, W.; COVAS, D. TADEU; KASHIMA, S.; NANEV SLAVOV, S.. Viral metagenomics in Brazilian multiply transfused patients with sickle cell disease as an indicator for blood transfusion safety. TRANSFUSION CLINIQUE ET BIOLOGIQUE, v. 27, n. 4, p. 237-242, NOV 2020. (18/22009-3, 17/23205-8, 19/07861-8, 18/15826-5, 19/08528-0)

VALENCA, IAN NUNES; DOS SANTOS, RAFAEL BEZERRA; PERONNI, KAMILA CHAGAS; SAUVAGE, VIRGINIE; VANDENBOGAERT, MATHIAS; CARO, VALERIE; DA SILVA JUNIOR, WILSON ARAUJO; COVAS, DIMAS TADEU; SILVA-PINTO, ANA CRISTINA; LAPERCHE, SYRIA; et al. Deep sequencing applied to the analysis of viromes in patients with beta-thalassemia. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 63, 2021. (19/07861-8, 18/15826-5, 19/08528-0, 17/23205-8)

SLAVOV, SVETOSLAV N.; PATANE, JOSE S. L.; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; GIOVANETTI, MARTA; FONSECA, VAGNER; MARTINS, ANTONIO J.; VIALA, VINCENT L.; RODRIGUES, EVANDRA S.; SANTOS, ELAINE V.; BARROS, CLAUDIA R. S.; et al. Genomic monitoring unveil the early detection of the SARS-CoV-2 B.1.351 (beta) variant (20H/501Y.V2) in Brazil. Journal of Medical Virology, v. 93, n. 12, JUL 2021. (20/10127-1, 18/15826-5, 13/08135-2, 20/05367-3, 20/00694-6, 17/26950-6)

BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; DIEFENBACH, CRISTIANE FRACAO; PEREIRA, DALNEI VEIGA; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Viral metagenomics performed in patients with acute febrile syndrome during Toxoplasma gondii outbreak in south Brazil. Brazilian Journal of Infectious Diseases, v. 24, n. 3, p. 250-255, MAY-JUN 2020. (19/07861-8, 18/15826-5, 19/08528-0, 17/23205-8)

CAVALCANTE SOUZA, JULIANA VANESSA; SANTOS, HAZERRAL DE OLIVEIRA; LEITE, ANDERSON BRANDAO; GIOVANETTI, MARTA; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; DE CARVALHO, ENEAS; TODAO BERNARDINO, JARDELINA DE SOUZA; VIALA, VINCENT LOUIS; HADDAD, RODRIGO; CICCOZZI, MASSIMO; et al. Viral Metagenomics for the Identification of Emerging Infections in Clinical Samples with Inconclusive Dengue, Zika, and Chikungunya Viral Amplification. Viruses-Basel, v. 14, n. 9, p. 8-pg., 2022-09-01. (17/23205-8, 18/15826-5, 21/09446-8, 21/11944-6, 20/13194-1, 19/08528-0)

I.N. VALENÇA; F.A. RÓS; V.S. ZUCHERATO; A.C. SILVA-PINTO; D.T. COVAS; S. KASHIMA; S.N. SLAVOV. Comparative metavirome analysis in polytransfused patients. Brazilian Journal of Medical and Biological Research, v. 54, n. 12, 2021-10-18. (19/07861-8, 17/23205-8, 20/13194-1, 18/15826-5, 19/22155-2)

SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Viral Metagenomics for Identification of Emerging Viruses in Transfusion Medicine. Viruses-Basel, v. 14, n. 11, p. 10-pg., 2022-11-01. (18/15826-5)

BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; BUB, CAROLINA BONET; PERONNI, KAMILA CHAGAS; DE FIGIUEIREDO BARROS, BRUNA DURAES; DA COSTA LIRA, SANNY MARCELE; KUTNER, JOSE MAURO; COVAS, DIMAS TADEU; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Virome comparison of deferred blood donations obtained from different geographic regions in the Sao Paulo State, Brazil. TRANSFUSION AND APHERESIS SCIENCE, v. 60, n. 3, JUN 2021. (17/23205-8, 19/08528-0, 19/07861-8, 18/15826-5)

BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; BITENCOURT, HELLEN TAYANA; COVAS, DIMAS TADEU; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Molecular evolution pattern of Merkel cell polyomavirus identified by viral metagenomics in plasma of high-risk blood donors from the Brazilian Amazon. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 85, NOV 2020. (19/08528-0, 17/23205-8, 18/15826-5, 19/07861-8)

RAFAEL DOS SANTOS BEZERRA; KAMILA CHAGAS PERONNI; BRUNA DURÃES DE FIGUEIREDO BARROS; LEONARDO SCALON DE OLIVEIRA; EVANDRA STRAZZA RODRIGUES; ROCHELE AZEVEDO; EUGÊNIA MARIA AMORIM UBIALI; DIMAS TADEU COVAS; SIMONE KASHIMA; SVETOSLAV NANEV SLAVOV. Viral metagenomics in blood donors with post-donation diseases and negative tests for dengue and Zika viruses RNA detection during a major outbreak of arboviruses in Sao Paulo State in 2016. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 62, p. -, 2020. (19/08528-0, 18/15826-5, 19/07861-8, 17/23205-8)

SLAVOV, SVETOSLAV NANEV; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; RODRIGUES, EVANDRA STRAZZA; SANTOS, ELAINE VIEIRA; BORGES, JOSEANE SERRANO; DE LA ROQUE, DEBORA GLENDA LIMA; PATAN, JOSE SALVATORE LEISTER; LIMA, ALEX RANIERI JERONIMO; RIBEIRO, GABRIELA; VIALA, VINCENT LOUIS; et al. Genomic monitoring of the SARS-CoV-2 B1.1.7 (WHO VOC Alpha) in the Sao Paulo state, Brazil. VIRUS RESEARCH, v. 308, p. 6-pg., 2022-01-15. (20/05367-3, 17/26950-6, 18/15826-5, 19/08528-0)

BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; XIMENEZ, JOAO PAULO BIANCHI; GIOVANETTI, MARTA; ZUCHERATO, VICTORIA SIMIONATTO; BITENCOURT, HELEN TAYANA; ZIMMERMANN, ANA; ALCANTARA JUNIOR, LUIZ CARLOS JUNIOR; COVAS, DIMAS TADEU; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Metavirome composition of Brazilian blood donors positive for the routinely tested blood-borne infections. VIRUS RESEARCH, v. 311, p. 7-pg., 2022-04-02. (20/13194-1, 17/23205-8, 19/08528-0, 18/15826-5)

SLAVOV, SVETOSLAV NANEV; GIOVANETTI, MARTA; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; FONSECA, VAGNER; SANTOS, ELAINE VIEIRA; RODRIGUES, EVANDRA STRAZZA; ADELINO, TALITA; XAVIER, JOILSON; BORGES, JOSIANE SERRANO; EVARISTO, MARIANE; et al. Molecular surveillance of the on-going SARS-COV-2 epidemic in Ribeirao Preto City, Brazil. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 93, SEP 2021. (13/08135-2, 17/26950-6, 18/15826-5)

ELIAS, MARIA CAROLINA; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV; LIMA, ALEX RANIERI JERONIMO; MARTINS, ANTONIO JORGE; BARROS, CLAUDIA RENATA DOS SANTOS; MORETTI, DEBORA BOTEQUIO; ARAUJO, EDUARDO L.; MARQUEZE, ELAINE CRISTINA; RIBEIRO, GABRIELA; RIBEIRO, GABRIELA MAURIC FROSSARD; et al. A traveling SARS-CoV-2 laboratory as part of a pandemic response among vulnerable Brazilian populations. BMC PUBLIC HEALTH, v. 23, n. 1, p. 9-pg., 2023-01-03. (20/10127-1, 20/00694-6, 18/15826-5, 13/07467-1)

VIALA, VINCENT LOUIS; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV; OLIVEIRA DE LIMA, LOYZE PAOLA; JERONIMO LIMA, ALEX RANIERI; RIBEIRO, GABRIELA; MARTINS, ANTONIO JORGE; PETRY, BRUNA; BANHO, CECILIA ARTICO; DOS SANTOS BARROS, CLAUDIA RENATA; MONCAU, CRISTINA TSCHORNY; et al. The Divergent Pattern of SARS-CoV-2 Variant Predominance and Transmission Dynamics in the Brazilian Island of Ilhabela. Viruses-Basel, v. 14, n. 7, p. 9-pg., 2022-07-01. (20/10127-1, 20/06441-2, 18/15826-5)

SLAVOV, SVETOSLAV NANEV; LIMA DE LA-ROQUE, DEBORA GLENDA; MENDES DA COSTA, PERICLES NATAN; RODRIGUES, EVANDRA STRAZZA; SANTOS, ELAINE VIEIRA; BORGES, JOSIANE SERRANO; EVARISTO, MARIANE; MACONETTO, JULIANA DE MATOS; MARQUES, ADRIANA APARECIDA; MILHOMENS, JONATHAN; et al. Dynamics of SARS-CoV-2 Variants of Concern in Vaccination Model City in the State of Sao Paulo, Brazil. Viruses-Basel, v. 14, n. 10, p. 12-pg., 2022-10-01. (14/50947-7, 18/15826-5, 20/10127-1, 20/06441-2, 19/22155-2, 17/26950-6, 21/11944-6, 13/08135-2)

BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; DE MELO JORGE, DANIEL MACEDO; CASTRO, ITALO ARAUJO; MORETTO, EDSON LARA; DE OLIVEIRA, LEONARDO SCALON; AMORIM UBIALI, EUGENIA MARIA; COVAS, DIMAS TADEU; ARRUDA, EURICO; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Detection of Influenza A(H3N2) Virus RNA in Donated Blood. Emerging Infectious Diseases, v. 26, n. 7, p. 1621-1623, JUL 2020. (17/23205-8, 19/07861-8, 18/15826-5, 19/08528-0)

ZUCHERATO, VICTORIA SIMIONATTO; DA COSTA, PERICLES NATAN MENDES; GIOVANETTI, MARTA; KRAUSE, LUCIANA MARIA FONTANARI; ALVES, DAIANI CRISTINA CILIAO; MOREIRA, RENATA MARIA ALENCAR; PIMENTEL, BARBARA MACIEL SIDOU; HADDAD, RODRIGO; BITENCOURT, HELLEN TAYANA; CICCOZZI, MASSIMO; et al. Merkel cell polyomavirus (MCPyV) DNA prevalence in Brazilian blood donors. TRANSFUSION CLINIQUE ET BIOLOGIQUE, v. 30, n. 1, p. 4-pg., 2023-01-31. (20/13194-1, 17/23205-8, 18/15826-5)

BEZERRA, RAFAEL S.; BITENCOURT, HELLEN T.; COVAS, DIMAS T.; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV N.. Metagenomic identification of human Gemykibivirus-2 (HuGkV-2) in parenterally infected blood donors from the Brazilian Amazon. INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES, v. 98, p. 3-pg., 2020-09-01. (19/08528-0, 18/15826-5, 19/07861-8, 17/23205-8)