Estudo de associação genômica ampla para identificação de locus de interesse agronômico em feijão comum

• Processo: 18/15526-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
• Data de Início da vigência: 14 de janeiro de 2019
• Data de Término da vigência: 28 de junho de 2019
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
• Acordo de Cooperação: Rede de Universidades Italianas
• Pesquisador responsável: Luciana Lasry Benchimol-Reis
• Beneficiário: Caléo Panhoca de Almeida
• Supervisor: Roberto Papa
• Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Università Politecnica delle Marche (UNIVPM), Itália
• Vinculado à bolsa: 17/01753-3 - Seleção assistida por marcadores moleculares e genotipagem por sequenciamento (GBS) visando à resistência à mancha angular em feijão comum, BP.MS
• Assunto(s): Polimorfismo de um único nucleotídeo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Associative mapping | Genome Wide Association Studies | Genotyping by Sequencing (GBS) | Phaseulus vulgaris L | SNPs | Mapeamento associativo em feijoeiro comum

Resumo

O feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) é a principal fonte de proteína vegetal na dieta humana e devido as suas características nutricionais trata-se de uma leguminosa de grande importância mundial. Com o avanço da tecnologia e a queda do custo de sequenciamento de nova geração (NGS), a obtenção de dados genotípicos, tais como SNPs vem se tornando cada dia mais acessível. O grande "gargalo" atual é a exploração da grande quantidade de dados obtidos, de modo que possa ser aproveitado ao máximo o investimento para a genotipagem. Estudos de associação ampla do genoma (GWAS) viabilizam a identificação de locos que influenciam a expressão principalmente de características quantitativas. Neste contexto, o atual projeto tem por objetivo a identificação de QTLs/genes associados ao controle da coloração associada ao brilho do grão, ciclo de floração, maturação e conteúdo proteico. Para isso será utilizado um conjunto de 5.679 SNPs genotipados via GBS em população composta por 91 linhagens obtidas por retrocruzamento e 6.000 SNPs genotipados via BeadChip em um painel de diversidade (core collection) composto por 288 acessos do BAG do Instituto Agronômico de Campinas (IAC), totalizando um conjunto de 379 acessos brasileiros com 11.679 SNPs. O trabalho também possibilitará a integração dos dados genotípicos dos acessos brasileiros ao conjunto de acessos do projeto BEAN_ADAPT, contribuindo significativamente na compreensão da evolução, diversidade genética e estruturação populacional, possibilitando a aplicação dos resultados em futuros programas de melhoramento do feijão comum no mundo.

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE CARVALHO PAULINO, JEAN FAUSTO; DE ALMEIDA, CALEO PANHOCA; SONG, QIJIAN; CARBONELL, SERGIO AUGUSTO MORAIS; CHIORATO, ALISSON FERNANDO; BENCHIMOL-REIS, LUCIANA LASRY. Genetic diversity and inter-gene pool introgression of Mesoamerican Diversity Panel in common beans. JOURNAL OF APPLIED GENETICS, v. 62, n. 4, AUG 2021. (19/19670-2, 18/15526-1, 17/01753-3, 17/24711-4)

ALMEIDA, CALEO PANHOCA DE; DE CARVALHO PAULINO, JEAN FAUSTO; BONFANTE, GABRIEL FRANCESCO JANINI; PERSEGUINI, JULIANA MORINI KUPPER CARDOSO; SANTOS, ISABELLA LAPORTE; GONCALVES, JOAO GUILHERME RIBEIRO; PATRICIO, FLAVIA RODRIGUES ALVES; TANIGUTI, CRISTIANE HAYUMI; GESTEIRA, GABRIEL DE SIQUEIRA; GARCIA, ANTONIO AUGUSTO FRANCO; et al. Angular Leaf Spot Resistance Loci Associated With Different Plant Growth Stages in Common Bean. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 12, APR 13 2021. (18/20992-1, 18/15526-1, 19/19670-2, 14/11145-2, 17/24711-4, 17/01753-3, 14/08280-5)

ALMEIDA, CALEO PANHOCA DE; PAULINO, JEAN FAUSTO DE CARVALHO; MORAIS CARBONELL, SERGIO AUGUSTO; CHIORATO, ALISSON FERNANDO; SONG, QIJIAN; DI VITTORI, VALERIO; RODRIGUEZ, MONICA; PAPA, ROBERTO; BENCHIMOL-REIS, LUCIANA LASRY. Genetic Diversity, Population Structure, and Andean Introgression in Brazilian Common Bean Cultivars after Half a Century of Genetic Breeding. GENES, v. 11, n. 11, NOV 2020. (17/01753-3, 17/24711-4, 19/19670-2, 18/15526-1)

DE CARVALHO PAULINO, JEAN FAUSTO; DE ALMEIDA, CALEO PANHOCA; BUENO, CESAR JUNIOR; SONG, QIJIAN; FRITSCHE-NETO, ROBERTO; MORAIS CARBONELL, SERGIO AUGUSTO; CHIORATO, ALISSON FERNANDO; BENCHIMOL-REIS, LUCIANA LASRY. Genome-Wide Association Study Reveals Genomic Regions Associated with Fusarium Wilt Resistance in Common Bean. GENES, v. 12, n. 5, MAY 2021. (19/19670-2, 18/15526-1, 17/01753-3, 17/24711-4)

DE CARVALHO PAULINO, JEAN FAUSTO; DE ALMEIDA, CALEO PANHOCA; FERRARI BARBOSA, CAIO CESAR; DE MORAES, GABRIEL; GONCALVES, CUNHA; BUENO, CESAR JUNIOR; HARAKAVA, RICARDO; MORAIS CARBONELL, SERGIO AUGUSTO; CHIORATO, ALISSON FERNANDO; BENCHIMOL-REIS, LUCIANA LASRY. Molecular and pathogenicity characterization of Fusarium oxysporum species complex associated with Fusarium wilt of common bean in Brazil. ROPICAL PLANT PATHOLOG, v. N/A, p. 10-pg., 2022-03-16. (17/24711-4, 17/01753-3, 18/15526-1, 19/19670-2)