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Aspectos teóricos de evolução molecular adaptativa e convergente e suas aplicações em genômica comparada

Processo: 18/19682-8
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 07 de janeiro de 2019
Vigência (Término): 06 de janeiro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética
Pesquisador responsável:Mariana Freitas Nery
Beneficiário:Lucas Araujo Freitas
Supervisor no Exterior: Mario dos Reis Barros
Instituição-sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Local de pesquisa : Queen Mary University of London, Inglaterra  
Vinculado à bolsa:17/25058-2 - Evolução adaptativa convergente de genes relacionados à hematofagia em Insecta, BP.PD
Assunto(s):Biologia computacional

Resumo

Atualmente, o decréscimo no custo de sequenciamento de genomas está aumentando o número de estudos em vários campos de pesquisa, por exemplo evolução molecular e genômica comparativa. Entretanto, apesar da disponibilidade de novos genomas a cada ano, estudos teóricos são necessários para que esses dados sejam explorados de forma satisfatória. Neste contexto, este projeto tem como objetivo determinar as melhores abordagens ao analisar dados de genômica comparada. Para determinar as melhores abordagens nestas metodologias, utilizaremos tanto dados simulados como dados empíricos da classe Insecta e de outros grupos taxonômicos. O projeto é subdividido em três tópicos diferentes, correspondentes a três diferentes análises de genômica comparada. No primeiro, determinaremos a influência de diferentes valores iniciais do parâmetro da taxa evolutiva (É) nos resultados do teste de quociente de verossimilhança do programa PAML. No segundo, inferiremos substituições convergentes e paralelas ao longo de conjuntos aleatórios de espécies para determinar os padrões dessas substituições ao longo dos genomas de linhagens que evoluíram de maneira independente. No terceiro, determinaremos a influência de diferentes estimativas de tempo de divergência na análise da evolução de famílias gênicas. Assim, no final deste projeto esperamos determinar e fornecer as melhores abordagens a serem usadas em estudos genômicos comparativos em larga escala, como a base genética para a evolução da hematofagia no Insecta.