ESTUDO DE ASSOCIAÇÃO DE VARREDURA GENÔMICA BASEADA NA EXPRESSÃO GÊNICA (eGWAS) EM EPILEPSIA DE LOBO TEMPORAL MESIAL

• Processo: 18/03254-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de setembro de 2018
• Vigência (Término): 28 de novembro de 2023
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Iscia Teresinha Lopes Cendes
• Beneficiário: Estela Maria Bruxel
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/07559-3 - Instituto Brasileiro de Neurociência e Neurotecnologia - BRAINN, AP.CEPID
• Bolsa(s) vinculada(s): 21/15030-9 - Desenvolvimento de um protocolo para estudo de associação de varredura genômica a ser aplicado na investigação de epilepsia do lobo temporal mesial em brasileiros miscigenados, BE.EP.PD
• Assunto(s): Neurologia Expressão gênica Epilepsia do lobo temporal
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Epilepsia de Lobo Temporal | Estudos de associação | expressão gênica | Herança complexa | Neurologia

Resumo

A epilepsia é definida como um distúrbio neurológico caracterizado pela predisposição permanente do cérebro em gerar crises epilépticas espontâneas, sendo a epilepsia do lobo temporal a forma mais comum de epilepsia focal na população adulta e responsável por 40% de todos os casos de epilepsia nesta população. O entendimento da epilepsia tem crescido rapidamente com a expansão das descobertas genéticas e novas tecnologias. No entanto, nas epilepsias de herança complexa e que são as mais frequentes, as bases genéticas continuam ainda largamente desconhecidas. Principalmente nas epilepsias focais o desafio de se identificar loci de suscetibilidade utilizando estudos de varredura genômica tem sido infrutífero. Isso posto, o projeto de pesquisa proposto visa identificar loci de suscetibilidade para a epilepsia de lobo temporal mesial (ELTM), a formar mais frequente de epilepsia de lobo temporal, através de um estudo de associação de varredura genômica baseada na expressão gênica (eGWAS). Para o desenvolvimento do projeto serão gerados dados de GWAS de uma amostra de 500 pacientes com ELTM e 500 controles, usando uma plataforma de SNP-array genômico. Conjuntamente, serão gerados dados de expressão gênica em material cirúrgico de pacientes com ELTM (n=5) e controles obtidos de autopsia (n=5) para realizar um estudo de eQTL. Posteriormente, serão realizadas análises estatísticas com a finalidade de integrar os dados de GWAS e eQTL para identificar loci de suscetibilidade. A estratégia de eGWAS nunca foi utilizada para estudas a ELTM, porém tem levando a sucesso em outras doenças de herança complexa. A literatura tem mostrado que ao integrar os dados de expressão gênica a análise de associação é possível aumentar a sensibilidade pela incorporação de dados funcionais, o que por sua vez e reduz o número de comparações múltiplas reduzindo a penalização estatística que dificulta o encontro de resultados positivos nos estudos de GWAS.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MAURER-MORELLI, CLAUDIA, V; DE VASCONCELLOS, JAIRA F.; BRUXEL, ESTELA M.; ROCHA, CRISTIANE S.; DO CANTO, AMANDA M.; TEDESCHI, HELDER; YASUDA, CLARISSA L.; CENDES, FERNANDO; LOPES-CENDES, ISCIA. Gene expression profile suggests different mechanisms underlying sporadic and familial mesial temporal lobe epilepsy. Experimental Biology and Medicine, v. 247, n. 24, p. 18-pg., 2022-10-19. (10/17440-5, 19/25948-3, 18/03254-7, 08/54789-6, 05/56578-4)

BRUXEL, ESTELA M.; BRUNO, DANIELLE C. F.; DO CANTO, AMANDA M.; GERALDIS, JAQUELINE C.; GODOI, ALEXANDRE B.; MARTIN, MARIANA; LOPES-CENDES, ISCIA. Multi-omics in mesial temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis: Clues into the underlying mechanisms leading to disease. SEIZURE-EUROPEAN JOURNAL OF EPILEPSY, v. 90, n. SI, p. 34-50, AUG 2021. (20/06168-4, 19/25948-3, 18/03254-7, 19/20953-9, 19/00213-0, 17/26167-0)

BRUXEL, ESTELA M.; DO CANTO, AMANDA M.; BRUNO, DANIELLE C. F.; GERALDIS, JAQUELINE C.; LOPES-CENDES, ISCIA. Multi-omic strategies applied to the study of pharmacoresistance in mesial temporal lobe epilepsy. EPILEPSIA OPEN, OCT 2021. (19/25948-3, 20/06168-4, 13/07559-3, 18/03254-7, 17/26167-0)