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Organização e localização de DNA satélites nos cromossomos de Proceratophrys boiei (Anura, Odontophrynidae)

Processo: 18/12128-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2018
Vigência (Término): 30 de novembro de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Patricia Pasquali Parise Maltempi
Beneficiário:Raquel Fogarin Destro
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia computacional   Cromossomos sexuais   Seleção genômica   Sequências repetitivas de ácido nucleico   Vertebrados   Heterocromatina   Hibridização in situ

Resumo

A heterocromatina de organismos eucariotos é normalmente composta por sequências de DNAs repetitivos. Um tipo especial destes é o DNA satélite que constitui uma fração não codificadora do genoma, consistindo em longas matrizes de sequências repetidas em tandem, localizadas preferencialmente na heterocromatina das regiões cromossômicas pericentroméricas e subteloméricas. No presente trabalho, pretende-se estudar a organização genômica e a localização cromossômica de sequências de satDNAs presentes no genoma da espécie Proceratophrys boiei (Wied-Neuwied, 1825), que se mostra bastante interessante do ponto de vista genético e citogenético, uma vez que em estudos anteriores foi identificado um heteromorfismo cromossômico ligado à diferenciação de cromossomos sexuais em fêmeas de uma população da espécie Para isso, foi realizada previamente uma extensiva análise no genoma sequenciado da espécie, utilizando ferramentas de bioinformática, da qual foram isolados inúmeros possíveis satDNAs. Como parte dos objetivos da presente proposta esses possíveis satDNAs serão validados por PCR e hibridação in situ cromossômica e algumas sequências serão escolhidas para serem estudadas profundamente nesse projeto Essas análises foram realizadas pelo grupo de pesquisa da Profa Patricia P. P. Maltempi, com a participação da aluna proponente do presente projeto. O isolamento de sequências repetitivas, sobretudo de satDNA, é um estudo inovador, constituindo uma ferramenta importante para obter dados que enriquecerão estudos evolutivos em anuros, podendo revelar novidades à cerca do genoma e dos cromossomos desses organismos, uma vez que poucos são os trabalhos envolvendo sequências repetitivas em anuros.