Uso de biópsias líquidas baseadas no sequenciamento do ctDNA para a detecção de doença residual em pacientes com câncer de reto localmente avançado após quimioradioterapia neoadjuvante (nQRT)

• Processo: 18/23531-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 26 de fevereiro de 2019
• Data de Término da vigência: 12 de fevereiro de 2020
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Anamaria Aranha Camargo
• Beneficiário: Franciele Hinterholz Knebel
• Supervisor: Marco Gerlinger
• Instituição Sede: Hospital Sírio-Libanês. Sociedade Beneficente de Senhoras (SBSHSL). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Institute of Cancer Research (ICR), Inglaterra
• Vinculado à bolsa: 15/16854-4 - Estudo e detecção de alterações genéticas associadas à resistência adquirida à terapia anti-EGFR no DNA tumoral circulante de pacientes com câncer de cólon e pulmão, BP.PD
• Assunto(s): Células neoplásicas circulantes Oncologia molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: ctDNA | Liquid biopsy | Massive parallel sequencing | Neoadjuvant chemoradiotherapy | rectal cancer | Residual disease | Oncologia molecular

Resumo

Monitoramento e detecção de alterações genéticas associadas à resistência adquirida à terapia alvo anti-EGFR no ctDNA de pacientes com câncer de pulmão e cólonO Receptor do Fator de Crescimento Epidérmico (EGFR) foi o primeiro receptor a ser proposto como alvo para a terapia do câncer após duas décadas de intensas investigações. Terapias anti-EGFR são usadas na clínica para tratar câncer de pulmão não pequenas células (CPNPC) e câncer colorretal metastático (mCCR). Inibidores tirosina quinase (ITKs) - Gefitinib, Erlotinibe, Afatinibe e Osimertinibe - são usados para tratar pacientes com câncer de pulmão não pequenas células (CPNPC) com mutações ativadoras no EGFR, enquanto anticorpos monoclonais anti-EGFR - Cetuximabe e Panitumumabe - são usados para o tratamento de mCCR com status KRAS tipo selvagem. Embora esses agentes apresentem uma boa taxa de resposta e ganhos importantes na sobrevida livre de progressão e sobrevida global, invariavelmente os pacientes desenvolvem resistência adquirida (RA), levando à progressão da doença (PD). Neste estudo, estamos usando biópsias líquidas seriadas e PCR digital em gotas (ddPCR) para monitorar a evolução clonal de alterações genéticas conhecidas associadas a RA a agentes anti-EGFR em CPNPC e mCCR. Também pretendemos caracterizar novas alterações genéticas associadas à resistência adquirida à terapia anti-EGFR através do sequenciamento direto do ctDNA de pacientes com CPNPC e CCR que apresentaram progressão da doença durante terapia anti-EGFR. Um total de 36 pacientes com CPNPC e 15 pacientes com mCCR foram incluídos em nosso estudo. Pacientes com CPNPC apresentaram EGFR T790M como principal mecanismo de resistência associado ao uso de erlotinibe, gefitinibe e afatinibe, enquanto EGFR C797S e amplificação de EGFR-exon19del foi observada em um paciente que progrediu ao osimertinibe. Em mCCR, mutações KRAS foram observadas em 2 pacientes que apresentaram PD. Não foi possível identificar mutações conhecidas associadas à resistência adquirida à terapia anti-EGFR para uma fração significativa de pacientes com CPNPC e mCCR que tiveram PD. O sequenciamento do ctDNA é uma ferramenta poderosa para identificar e caracterizar novos mecanismos moleculares de resistência adquirida à terapia alvo, entretanto, seu uso é limitado pelas baixas concentrações de ctDNA no plasma de pacientes com câncer e a alta taxa de erro de seqüenciamento das atuais plataformas. Para superar essas limitações, o grupo do Dr. Gerlinger desenvolveu recentemente um protocolo de seqüenciamento de supressão de erros usando códigos de barras moleculares e um pipeline de bioinformática para a identificação de mutações somáticas que ocorrem em baixas concentrações no ctDNA de pacientes com câncer. A colaboração com o grupo do Dr. Gerlinger nos permitirá aprender e aplicar essa estratégia de sequenciamento para investigar novos mecanismos de resistência adquirida aos ITKs anti-EGFR em nossos pacientes.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

KNEBEL, FRANCIELE H.; BARBER, LOUISE J.; NEWEY, ALICE; KLEFTOGIANNIS, DIMITRIOS; WOOLSTON, ANDREW; GRIFFITHS, BEATRICE; FENWICK, KERRY; BETTONI, FABIANA; SILVA ALMEIDA RIBEIRO, MAURICIO FERNANDO; FONSECA, LEONARDO; et al. Circulating Tumour DNA Sequencing Identifies a Genetic Resistance-Gap in Colorectal Cancers with Acquired Resistance to EGFR-Antibodies and Chemotherapy. CANCERS, v. 12, n. 12, DEC 2020. (15/16854-4, 18/23531-5)