Metagenômica do microbioma associado à alga marinha Sargassum spp. (Phaeophyceae)

• Processo: 18/17843-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Vigência (Início): 01 de janeiro de 2019
• Vigência (Término): 31 de julho de 2023
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Mariana Cabral de Oliveira
• Beneficiário: Inara Regina Wengratt Mendonça
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Microbiota Macroalgas Sargassum Metagenômica Sequenciamento de nova geração Santa Catarina São Paulo Bahia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Escalas Espaciais | Microbioma | Sargassum | sequenciamento de nova geração | 16S rRNA | Microbioma de macroalgas marinhas

Resumo

O objetivo principal deste projeto é reconhecer a comunidade bacteriana que vive associada à macroalga marinha Sargassum, e compreender como esta comunidade varia entre estruturas do talo, populações, latitudes e hábitos de vida. Trabalhos recentes têm demonstrado a importância das bactérias associadas às algas devido à produção de bioativos que influenciam na proteção, assentamento, crescimento vegetativo e até mesmo na reprodução das algas. Sargassum é um gênero de Phaeophyceae amplamente distribuído, com importância ecológica e econômica, mas para o qual pouco se sabe sobre o seu microbioma associado. O gênero Sargassum apresenta formas bentônicas e holopelágicas. Nos últimos anos, aglomerados de Sargassum holopelágico arribaram em regiões costeiras do Norte e Nordeste do Brasil formando as chamadas marés douradas. Neste projeto, compararemos o microbioma do Sargassum holopelágico arribado com o do Sargassum bentônico local. Para tal estudo, será utilizado um delineamento amostral hierarquizado que permitirá não apenas descrever o microbioma, mas investigar as escalas de variação. As coletas de Sargassum bentônico (S. vulgare) serão realizadas em Santa Catarina, São Paulo e Bahia. As coletas de Sargassum holopelágico (S. natans) se darão em Salinólopolis/PA onde ocorrem arribadas. Para a identificação do microbioma destas estruturas do talo serão feitas sequências metagenômicas do 16S rRNA. As sequências produzidas serão analisadas utilizando pipelines, e a partir do número de OTUs gerados será possível executar análises estatísticas para avaliar variação entre os diferentes níveis amostrais. Os resultados obtidos permitirão a comparação do microbioma em termos qualitativos e quantitativos. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

THEIRLYNCK, TOM; MENDONCA, INARA REGINA W.; ENGELEN, ASCHWIN H.; BOLHUIS, HENK; COLLADO-VIDES, LIGIA; VAN TUSSENBROEK, BRIGITTA I.; GARCIA-SANCHEZ, MARTA; ZETTLER, ERIK; MUYZER, GERARD; AMARAL-ZETTLER, LINDA. Diversity of the holopelagic Sargassum microbiome from the Great Atlantic Sargassum Belt to coastal stranding locations. HARMFUL ALGAE, v. 122, p. 13-pg., 2022-12-30. (18/17843-4)

INARA R. W. MENDONÇA; TOM THEIRLYNCK; ERIK R. ZETTLER; LINDA A. AMARAL-ZETTLER; MARIANA CABRAL OLIVEIRA. Microbiome changes in a stranding simulation of the holopelagic macroalgae Sargassum natans and Sargassum fluitans. Ocean and Coastal Research, v. 72, 2024-06-17. (20/09406-3, 18/17843-4)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

MENDONÇA, Inara Regina Wengratt. Metagenômica do microbioma associado à alga marinha Sargassum spp. (Phaeophyceae). 2024. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Biociências (IBIOC/SB) São Paulo.