Variações em regiões regulatórias associadas a características de produção e qualidade de carne na raça Nelore

• Processo: 18/11953-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de janeiro de 2019
• Vigência (Término): 31 de dezembro de 2022
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Luciana Correia de Almeida Regitano
• Beneficiário: Tainã Figueiredo Cardoso
• Instituição Sede: Embrapa Pecuária Sudeste. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/04089-2 - O Hologenoma de Nelore: implicações na qualidade de carne e em eficiência alimentar, AP.ESCIENCE.TEM
• Assunto(s): Genética animal Qualidade da carne Gado Nelore Bos taurus indicus MicroRNAs Polimorfismo de um único nucleotídeo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bos indicus | fatores de ligação | microRNA | Polimorfismos | Proteoma | Transcriptoma | Genética animal

Resumo

A Pecuária de corte no Brasil é uma atividade de extrema importância econômica para o país, na qual os bovinos Zebuínos (Bos indicus) representam cerca de 80% do rebanho nacional. A produção de carne e características de qualidade, como eficiência alimentar e gordura intramuscular, determinam os custos de produção e a aceitação da carne, e podem ser melhoradas através de seleção genética. Dentro dos projetos "Estratégias genéticas para produção de carne bovina de qualidade" e "Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore" se produziu uma grande quantidade de dados genômicos e proteômicos que permitiu identificar uma serie de variações genômicas, estruturais e funcionais, associadas a estes caracteres de interesse. Neste contexto, esta proposta pretende utilizar genótipos imputados ao nível de sequência genômica de um total de 814 animais para identificar polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) em regiões reguladoras. Através de análises de bioinformática iremos realizar uma busca de SNPs em sequências de microRNA (pré- e maduro- miRNA), bem como nas sequências referentes aos sítios de ligação de microRNA ao RNA. Além disso, pretendemos buscar SNPs em sequências de fatores (TF) e co-fatores (TcoF) de transcrição. Finalmente, iremos integrar a informação sobre as interações SNP-miRNA-mRNA e SNP-TF/TcoF-mRNA com dados genômicos, transcriptômicos e proteômicos disponíveis para a população. Os resultados oriundos desse trabalho irão indicar possíveis variações causais e auxiliar na compreensão das funções dos genes (e suas interações) relacionados às características de interesse. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CARDOSO, TAINA FIGUEIREDO; COUTINHO, LUIZ LEHMANN; BRUSCADIN, JENNIFER JESSICA; DA SILVA DINIZ, WELLISON JARLES; PETRINI, JULIANA; ANDRADE, BRUNO GABRIEL NASCIMENTO; DE OLIVEIRA, PRISCILA SILVA NEUBERN; POLETI, MIRELE DAIANA; CESAR, ALINE SILVA MELLO; DA SILVEIRA, JULIANO COELHO; et al. Multi-Omics Approach Reveals miR-SNPs Affecting Muscle Fatty Acids Profile in Nelore Cattle. GENES, v. 12, n. 1, JAN 2021. (18/11953-2, 12/23638-8, 19/04089-2)

CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; AFONSO, J.; PETRINI, J.; ANDRADE, B. G. N.; DE OLIVEIRA, P. S. N.; MALHEIROS, J. M.; ROCHA, M. I. P.; ZERLOTINI, A.; FERRAZ, J. B. S.; et al. EEF1A1 transcription cofactor gene polymorphism is associated with muscle gene expression and residual feed intake in Nelore cattle. Mammalian Genome, v. 33, n. 4, p. 10-pg., 2022-07-11. (18/11953-2, 12/23638-8, 19/04089-2)