Suporte técnico na rotina laboratorial e na busca por novos alvos terapêuticos utilizando ferramentas de bioinformática

• Processo: 19/00547-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Luiz Gonzaga Tone
• Beneficiário: Luís Fernando Peinado Nagano
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/20341-0 - Interação entre alvos terapêuticos emergentes e vias de desenvolvimento associadas à tumorigênese: ênfase em neoplasias da criança e do adolescente, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Oncologia pediátrica Meduloblastoma Ependimoma Carcinoma adrenocortical Transdução de sinais Expressão gênica Transcriptoma
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: ependimoma | Meduloblastoma | Módulos de co-expressão | Tumor Adreno-cortical | vias de sinalização | Oncologia Infantil

Resumo

Atualmente o câncer infantojuvenil é a principal causa de morte por doença em crianças e adolescentes (INCA, 2017), sendo que, de todos os tumores malignos, o câncer infantojuvenil corresponde a cerca de 2-3% da população brasileira (INCA & SOBOPE, 2008). A busca por alvos moleculares mais específicos para serem utilizados em terapia de tumores de pior prognóstico é uma constante na área oncológica pediátrica e a utilização de dados gerados a partir da tecnologia de RNA-Seq torna possível a análise de interações moleculares complexas, favorecendo essa descoberta. O nosso laboratório já submeteu para sequenciamento, amostras de RNA de três tipos de tumores pediátricos, meduloblastoma, ependimoma e tumor adreno-cortical. Estas amostras foram pré-analisadas e passaram pelas fases de mapeamento de reads e quantificação de transcritos, mas é necessário que se faça a análise dos genes diferencialmente expressos entre os subtipos tumorais e a busca por módulos de co-expressão gênica. Além disso, o projeto temático vigente gerou um grande volume de atividade laboratorial na área de cultura de células e biologia molecular, esta alta demanda criou a necessidade de um auxílio técnico para manutenção dos reagentes e execução de algumas técnicas, como qRT-PCR e Western Blotting. O plano de atividades proposto para esta bolsa de treinamento técnico refere-se a apoio na análise de bioinformática dos transcriptomas gerados, além do suporte na rotina laboratorial para validar genes de interesse do grupo, produção de meio de cultura de células, apoio na coleta de amostras de tumores e outras atividades de alta demanda dentro do laboratório.