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Suporte técnico na rotina laboratorial e na busca por novos alvos terapêuticos utilizando ferramentas de bioinformática

Processo: 19/00547-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de fevereiro de 2019
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Luiz Gonzaga Tone
Beneficiário:Luís Fernando Peinado Nagano
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/20341-0 - Interação entre alvos terapêuticos emergentes e vias de desenvolvimento associadas à tumorigênese: ênfase em neoplasias da criança e do adolescente, AP.TEM
Assunto(s):Biologia computacional   Oncologia pediátrica   Meduloblastoma   Ependimoma   Carcinoma adrenocortical   Transdução de sinais   Expressão gênica   Transcriptoma

Resumo

Atualmente o câncer infantojuvenil é a principal causa de morte por doença em crianças e adolescentes (INCA, 2017), sendo que, de todos os tumores malignos, o câncer infantojuvenil corresponde a cerca de 2-3% da população brasileira (INCA & SOBOPE, 2008). A busca por alvos moleculares mais específicos para serem utilizados em terapia de tumores de pior prognóstico é uma constante na área oncológica pediátrica e a utilização de dados gerados a partir da tecnologia de RNA-Seq torna possível a análise de interações moleculares complexas, favorecendo essa descoberta. O nosso laboratório já submeteu para sequenciamento, amostras de RNA de três tipos de tumores pediátricos, meduloblastoma, ependimoma e tumor adreno-cortical. Estas amostras foram pré-analisadas e passaram pelas fases de mapeamento de reads e quantificação de transcritos, mas é necessário que se faça a análise dos genes diferencialmente expressos entre os subtipos tumorais e a busca por módulos de co-expressão gênica. Além disso, o projeto temático vigente gerou um grande volume de atividade laboratorial na área de cultura de células e biologia molecular, esta alta demanda criou a necessidade de um auxílio técnico para manutenção dos reagentes e execução de algumas técnicas, como qRT-PCR e Western Blotting. O plano de atividades proposto para esta bolsa de treinamento técnico refere-se a apoio na análise de bioinformática dos transcriptomas gerados, além do suporte na rotina laboratorial para validar genes de interesse do grupo, produção de meio de cultura de células, apoio na coleta de amostras de tumores e outras atividades de alta demanda dentro do laboratório.