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Caracterização funcional de RNAs longos não-codificadores de proteínas em Schistosoma mansoni

Processo: 18/24015-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de março de 2019
Vigência (Término): 30 de abril de 2022
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Sergio Verjovski Almeida
Beneficiário:Gilbert de Oliveira Silveira
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Interferência de RNA   Schistosoma mansoni   Alvo terapêutico

Resumo

Com o advento das novas tecnologias de sequenciamento em larga-escala na última década utilizados para detecção de RNAs expressos em diversos organismos sob diversas condições, milhares de RNAs longos (maiores que 200 nucleotídeos) não codificadores de proteínas (long non-coding RNAs, lncRNAs) vêm sendo identificados. No entanto, apenas cerca de 40 lncRNAs em humanos tiveram seus mecanismos moleculares de ação identificados e caracterizados detalhadamente, em geral atrelados a uma função de regulação da transcrição gênica. No ano de 2011, nosso grupo publicou a primeira evidência demonstrando a presença de lncRNAs expressos em diferentes processos e respostas fisiológicas em Schistosoma mansoni, o parasita causador da esquistossomose no Brasil. Essa doença acomete milhões de pessoas no mundo, e afetou cerca de 19 mil pessoas no Brasil somente no ano de 2017. Em seguida àquele trabalho, três outros trabalhos foram publicados por nosso grupo e mais dois outros grupos, corroborando com o interesse exponencial na descrição e caracterização destas moléculas em praticamente todos os organismos. Tendo em vista o acentuado interesse na caracterização dos lncRNAs e seus papéis no controle da expressão gênica observados em eucariotos, e sabendo da grande necessidade do desenvolvimento de novas abordagens para eliminação do S. mansoni, o presente trabalho tem como objetivo a identificação e caracterização funcional dos lncRNAs envolvidos em processos biológicos essenciais para o desenvolvimento do parasita, assim como aqueles envolvidos na resposta ao tratamento com drogas. A aplicação de novas tecnologias para detectar a interação entre lncRNAs, proteínas e seus possíveis sítios de ligação no DNA genômico permitirão entender o papel regulatório de lncRNAs, abrindo portas para o eventual uso desses lncRNAs como novos alvos terapêuticos.

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
AMARAL, MURILO S.; MACIEL, LUCAS F.; SILVEIRA, GILBERT O.; OLBERG, GIOVANNA G. O.; LEITE, JOAO V. P.; IMAMURA, LUCAS K.; PEREIRA, ADRIANA S. A.; MIYASATO, PATRICIA A.; NAKANO, ELIANA; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Long non-coding RNA levels can be modulated by 5-azacytidine in Schistosoma mansoni. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1 DEC 9 2020. Citações Web of Science: 0.
CARNEIRO, VITOR COUTINHO; DE ABREU SILVA, ISABEL CAETANO; AMARAL, MURILO SENA; PEREIRA, ADRIANA S. A.; SILVEIRA, GILBERT OLIVEIRA; PIRES, DAVID DA SILVA; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO; DEKKER, FRANK J.; ROTILI, DANTE; MAI, ANTONELLO; LOPES-TORRES, EDUARDO JOSE; ROBAA, DINA; SIPPL, WOLFGANG; PIERCE, RAYMOND J.; BORRELLO, M. TERESA; GANESAN, A.; LANCELOT, JULIEN; THIENGO, SILVANA; FERNANDEZ, MONICA AMMON; REVOREDO VICENTINO, AMANDA ROBERTA; MOURAO, MARINA MORAES; COELHO, FERNANDA SALES; FANTAPPIE, MARCELO ROSADO. Pharmacological inhibition of lysine-specific demethylase 1 (LSD1) induces global transcriptional deregulation and ultrastructural alterations that impair viability inSchistosoma mansoni. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 14, n. 7 JUL 2020. Citações Web of Science: 0.
PEREIRA, ADRIANA S. A.; SILVEIRA, GILBERT O.; AMARAL, MURILO S.; ALMEIDA, V, SINARA M.; OLIVEIRA, JAMERSON F.; LIMA, MARIA C. A.; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. In vitro activity of aryl-thiazole derivatives against Schistosoma mansoni schistosomula and adult worms. PLoS One, v. 14, n. 11 NOV 25 2019. Citações Web of Science: 0.
MACIEL, LUCAS F.; MORALES-VICENTE, DAVID A.; SILVEIRA, GILBERT O.; RIBEIRO, RAPHAEL O.; OLBERG, GIOVANNA G. O.; PIRES, DAVID S.; AMARAL, MURILO S.; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Weighted Gene Co-Expression Analyses Point to Long Non-Coding RNA Hub Genes at Different Schistosoma mansoni Life-Cycle Stages. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, SEP 12 2019. Citações Web of Science: 0.

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