Caracterização funcional de RNAs longos não-codificadores de proteínas em Schistosoma mansoni

• Processo: 18/24015-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de março de 2019
• Vigência (Término): 09 de janeiro de 2022
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Sergio Verjovski Almeida
• Beneficiário: Gilbert de Oliveira Silveira
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Interferência de RNA Schistosoma mansoni Alvo terapêutico RNAs não codificadores
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: alvos terapeuticos | long intergenic non coding RNAs | RNAi | Schistosoma mansoni | RNAs não codificantes

Resumo

Com o advento das novas tecnologias de sequenciamento em larga-escala na última década utilizados para detecção de RNAs expressos em diversos organismos sob diversas condições, milhares de RNAs longos (maiores que 200 nucleotídeos) não codificadores de proteínas (long non-coding RNAs, lncRNAs) vêm sendo identificados. No entanto, apenas cerca de 40 lncRNAs em humanos tiveram seus mecanismos moleculares de ação identificados e caracterizados detalhadamente, em geral atrelados a uma função de regulação da transcrição gênica. No ano de 2011, nosso grupo publicou a primeira evidência demonstrando a presença de lncRNAs expressos em diferentes processos e respostas fisiológicas em Schistosoma mansoni, o parasita causador da esquistossomose no Brasil. Essa doença acomete milhões de pessoas no mundo, e afetou cerca de 19 mil pessoas no Brasil somente no ano de 2017. Em seguida àquele trabalho, três outros trabalhos foram publicados por nosso grupo e mais dois outros grupos, corroborando com o interesse exponencial na descrição e caracterização destas moléculas em praticamente todos os organismos. Tendo em vista o acentuado interesse na caracterização dos lncRNAs e seus papéis no controle da expressão gênica observados em eucariotos, e sabendo da grande necessidade do desenvolvimento de novas abordagens para eliminação do S. mansoni, o presente trabalho tem como objetivo a identificação e caracterização funcional dos lncRNAs envolvidos em processos biológicos essenciais para o desenvolvimento do parasita, assim como aqueles envolvidos na resposta ao tratamento com drogas. A aplicação de novas tecnologias para detectar a interação entre lncRNAs, proteínas e seus possíveis sítios de ligação no DNA genômico permitirão entender o papel regulatório de lncRNAs, abrindo portas para o eventual uso desses lncRNAs como novos alvos terapêuticos.

Publicações científicas

(8)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CARNEIRO, VITOR COUTINHO; DE ABREU SILVA, ISABEL CAETANO; AMARAL, MURILO SENA; PEREIRA, ADRIANA S. A.; SILVEIRA, GILBERT OLIVEIRA; PIRES, DAVID DA SILVA; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO; DEKKER, FRANK J.; ROTILI, DANTE; MAI, ANTONELLO; et al. Pharmacological inhibition of lysine-specific demethylase 1 (LSD1) induces global transcriptional deregulation and ultrastructural alterations that impair viability inSchistosoma mansoni. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 14, n. 7, JUL 2020. (18/24015-0)

CARNEIRO, VITOR COUTINHO; DE ABREU SILVA, ISABEL CAETANO; AMARAL, MURILO SENA; PEREIRA, ADRIANA S. A.; SILVEIRA, GILBERT OLIVEIRA; PIRES, DAVID DA SILVA; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO; DEKKER, FRANK J.; ROTILI, DANTE; MAI, ANTONELLO; et al. Pharmacological inhibition of lysine-specific demethylase 1 (LSD1) induces global transcriptional deregulation and ultrastructural alterations that impair viability in Schistosoma mansoni. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 14, n. 7, p. 29-pg., 2020-07-01. (18/24015-0)

MACIEL, LUCAS F.; MORALES-VICENTE, DAVID A.; SILVEIRA, GILBERT O.; RIBEIRO, RAPHAEL O.; OLBERG, GIOVANNA G. O.; PIRES, DAVID S.; AMARAL, MURILO S.; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Weighted Gene Co-Expression Analyses Point to Long Non-Coding RNA Hub Genes at Different Schistosoma mansoni Life-Cycle Stages. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, SEP 12 2019. (14/03620-2, 17/22379-2, 18/24015-0, 18/23693-5)

SILVEIRA, GILBERT O.; AMARAL, MURILO S.; COELHO, HELENA S.; MACIEL, LUCAS F.; PEREIRA, ADRIANA S. A.; OLBERG, GIOVANNA G. O.; MIYASATO, PATRICIA A.; NAKANO, ELIANA; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Assessment of reference genes at six different developmental stages of Schistosoma mansoni for quantitative RT-PCR. SCIENTIFIC REPORTS, v. 11, n. 1, p. 18-pg., 2021-08-19. (18/19591-2, 16/10046-6, 18/24015-0, 18/23693-5)

AMARAL, MURILO S.; MACIEL, LUCAS F.; SILVEIRA, GILBERT O.; OLBERG, GIOVANNA G. O.; LEITE, JOAO V. P.; IMAMURA, LUCAS K.; PEREIRA, ADRIANA S. A.; MIYASATO, PATRICIA A.; NAKANO, ELIANA; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Long non-coding RNA levels can be modulated by 5-azacytidine in Schistosoma mansoni. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, DEC 9 2020. (18/19591-2, 18/23693-5, 16/10046-6, 18/24015-0)

PEREIRA, ADRIANA S. A.; SILVEIRA, GILBERT O.; AMARAL, MURILO S.; ALMEIDA, V, SINARA M.; OLIVEIRA, JAMERSON F.; LIMA, MARIA C. A.; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. In vitro activity of aryl-thiazole derivatives against Schistosoma mansoni schistosomula and adult worms. PLoS One, v. 14, n. 11, NOV 25 2019. (18/24015-0)

SILVEIRA, GILBERT O.; COELHO, HELENA S.; AMARAL, MURILO S.; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Long non-coding RNAs as possible therapeutic targets in protozoa, and in Schistosoma and other helminths. Parasitology Research, DEC 2021. (18/23693-5, 18/24015-0)

SILVEIRA, GILBERT O.; COELHO, HELENA S.; PEREIRA, ADRIANA S. A.; MIYASATO, PATRICIA A.; SANTOS, DAISY W.; MACIEL, LUCAS F.; OLBERG, GIOVANNA G. G.; TAHIRA, ANA C.; NAKANO, ELIANA; OLIVEIRA, MARIA LEONOR S.; et al. Long non-coding RNAs are essential for Schistosoma mansoni pairing-dependent adult worm homeostasis and fertility. PLOS PATHOGENS, v. 19, n. 5, p. 30-pg., 2023-05-01. (18/24015-0)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SILVEIRA, Gilbert de Oliveira. Caracterização funcional de RNAs longos não-codificadores de proteínas em Schistosoma mansoni. 2022. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ) São Paulo.