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Taxonomia molecular e caracterização genômica de genes regulados por vias de quorum sensing em isolados de bactérias láticas oriundas de diferentes matrizes alimentares

Processo: 18/26719-5
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
Vigência (Início): 05 de setembro de 2019
Vigência (Término): 04 de março de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia
Pesquisador responsável:Elaine Cristina Pereira de Martinis
Beneficiário:Otávio Guilherme Gonçalves de Almeida
Supervisor no Exterior: Giovanna Felis
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Local de pesquisa : Università degli Studi di Verona, Itália  
Vinculado à bolsa:17/13759-6 - Prospecção metagenômica de bactérias relacionadas a quorum sensing durante a fermentação espontânea do cacau, BP.DD
Assunto(s):Microbiologia de alimentos   Biologia computacional   Percepção de Quorum

Resumo

As bactérias do ácido láctico (LAB) compõem um grupo parafilético que está relacionado a várias matrizes alimentares. Na fermentação espontânea de cacau, as LAB formam o principal grupo de bactérias envolvido em todo o processo de fermentação. O Projeto de doutorado direto fomentado pela FAPESP (Número 17/13759-6) busca entender a influência do Quorum Sensing (QS) na fermentação do cacau e visa desenvolver um coquetel bacteriano definido para padronizar a fermentação, selecionando linhagens LAB cuja atividade de QS foi detectada. A abordagem taxonômica para caracterizar os isolados LAB é muito importante porque é fundamental para relacionar a cepa à sua origem, habitat e fisiologia, o que impacta diretamente na seleção de novos microrganismos candidatos para aplicações em fermentações industriais padronizadas. Por outro lado, como as LAB são bem reconhecidas por possuírem Sistemas de QS de dois componentes (QS-TCSs), que são sistemas-chave em vias QS, uma análise genômica das LAB através do Sequenciamento do Genoma Completo (WGS) será útil para identificar in silico as seqüências codificadoras putativas relacionadas a estes QS-TCSs, o que acarretará em vantagens para: (i) para projetar a cultura inicial proposta no projeto 17 / 13759-6 e, (ii) para comparar o esquema de taxonomia LAB com base em marcadores filogenéticos com as sequências de marcadores inteiras recuperadas dos genomas LAB montados.