Composição genética de raias violas do gênero Pseudobatos (Chondrichthyes, Rhinobatidae) e busca de SNPs associados à adaptação ambiental

• Processo: 18/25429-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2019
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Fausto Foresti
• Beneficiário: Bruno de Campos Souza
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Genética populacional Genômica Polimorfismo de um único nucleotídeo Marcador molecular Sequenciamento de nova geração
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Genômica | Loci outliers | marcadores moleculares | Ngs | pressão seletiva | SNPs | Genética de populações

Resumo

As espécies aquáticas estão entre as que mais sofrem com as rápidas alterações ambientais, as quais promovem, assim, ameaças à biodiversidade, bem como a diminuição do potencial fitness de espécies de se adaptar a futuros ambientes. Em decorrência da revolução genômica, o desenvolvimento de vários métodos de sequenciamento de nova geração (Next Generation Sequencing - NGS) transformou o campo da genômica funcional nos últimos cinco anos, permitindo identificar polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs) em todo o genoma a custos relativamente modestos. Essa metodologia pode ser aplicada em qualquer espécie, nas quais é possível rastrear loci sob seleção, identificando desse modo loci outliers relacionados à base genética das características envolvidas na adaptação ambiental dos organismos. Um modelo interessante para tais estudos evolutivos é representado pelas espécies do grupo dos elasmobrânquios, mais precisamente as raias, que ocupam ambientes aquáticos com diferentes características. As espécies Pseudobatos horkelii e P. percellens são raias costeiras popularmente conhecidas no Brasil como raias viola, pertencentes à família Rhinobatidae. P. horkelii ocorre desde o Rio de Janeiro até o norte da Argentina, enquanto P. percelens tem sua distribuição desde o Golfo do México até o norte da Argentina. Entre os poucos estudos desenvolvidos com estas espécies, destacam-se os de biologia reprodutiva, dinâmica populacional, hábitos alimentares e distribuição. Embora as espécies da família Rhinobatidae não constituam o alvo principal da pesca industrial e artesanal, elas são capturadas frequentemente como fauna acompanhante ("bycatch"), o que atualmente classifica P. horkelli como "criticamente ameaçada" na Lista Vermelha da IUCN (União Internacional para a Conservação da Natureza), enquanto P. percellens está classificada como "quase ameaçada". Diante do exposto, pode ser ressaltada a importância de rastrear marcadores ligados à adaptação ambiental e, para isso serão analisadas as espécies de raias P. horkelii e P. percellens a partir de amostras obtidas de localidades na região do Golfo do México (EUA), região norte da Venezuela, litoral dos estados do Maranhão, Rio Grande do Norte, Paraíba, Pernambuco, Bahia, Rio de Janeiro, São Paulo, Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul (Brasil) e na região do Mar del Plata (Argentina), totalizando 13 localidades, buscando identificar possíveis relações entre as populações com o uso de SNPs. Além de estabelecer relações filogeográficas entre as diferentes populações/espécies identificadas, verificando se os estoques do nordeste e do sudeste são isolados e determinar a existência de estrutura genética populacional, serão investigados os efeitos da pressão seletiva relacionada ao ambiente sobre as espécies. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SOUZA, Bruno de Campos. Composição genética da raia viola Pseudobatos percellens (elasmobranchii: rhinobatidae) utilizando SNPs. 2021. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências. Botucatu Botucatu.