Mecanismos fisiopatológicos e moleculares de tumorigênese: abordagem baseada em plataformas de sequenciamento em escala genômica (NGS - Next-generation sequencing).

• Processo: 19/00860-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2019
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2023
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Sonir Roberto Rauber Antonini
• Beneficiário: Ana Carolina Bueno de Queiroz Arruda
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/03989-6 - Mecanismos fisiopatológicos e moleculares de tumorigênese: abordagem baseada em plataformas de sequenciamento em escala genômica (NGS - Next-Generation Sequencing), AP.TEM
• Assunto(s): Endocrinologia Mutação Sequenciamento de nova geração
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Mutações | Ngs | sequenciamento exomico | Tumor adrenocortical | Endocrinologia

Resumo

Na tentativa de esclarecer a patogênese molecular dos tumores endócrinos estudos, utilizando abordagens baseadas em genes candidatos e estudos de ligação (linkage), têm investigado o papel de genes específicos do desenvolvimento de cada glândula endócrina, genes envolvidos em tumorigênese de outros tecidos, como genes que levam à progressão do ciclo e divisão celular (oncogenes) ou que bloqueiam o ciclo celular (genes de supressão tumoral). Ainda, miRNAs e lncRNAs (large noncoding RNAs) têm sido associados à tumorigênese geral e especifica das glândulas endócrinas. Houve grande avanço no esclarecimento molecular de várias síndromes genéticas associadas a tumores hipofisários (McCune-Albright, Neoplasia endócrina múltipla (NEM) tipo 1 e tipo 4, síndrome de Carney e adenoma hipofisário familial isolado-FIPA); associadas a tumores adrenais (Li-Fraumeni, Beckwith-Wiedemann, Complexo de Carney, McCune-Albright e NEM1) e aquelas associadas com tumores tireoidianos (NEM2 e Carcinoma Medular de Tireóide Hereditário). Apesar dos avanços, a patogênese molecular dos tumores endócrinos, principalmente dos esporádicos, ainda não está elucidada. As novas plataformas de sequenciamento em escala genômica, ou ainda, de última geração (Next-generation sequencing ou NGS) apresentam vantagens e diversas aplicações, dependendo da hipótese formulada. Para a análise do genoma pode-se utilizar sequenciamento de novo, Target-seq, análise de exoma (whole exoma seq) ou análise de todo o genoma (whole genoma seq). Para a análise epigenômica pode-se utilizar imunoprecipitação de cromatina (ChIP) e análise de metilação (metiloma); outra abordagem é a análise do perfil de expressão gênica do transcriptoma inteiro. Portanto, este projeto objetiva, pelo uso de uma ferramenta atual e poderosa - os NGS, entender e esclarecer a gênese dos tumores hipofisários, adrenais, tireoideanos e de um subtipo de tumor do sistema nervoso central, os gliomas, avaliando alterações na totalidade de genes expressos, nos processos epigenéticos e no estudo de transcriptomas em amostras desses tumores. A casuística será composta por pacientes seguidos no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (HCFMRP-USP). Como controles, amostras de tecido normal obtidas no CEMEL (Centro de Medicina Legal) após necropsia de indivíduos com morte acidental ou súbita de causa cardíaca serão utilizadas. O NGS certamente indicará novos genes e/ou novas vias de sinalização que poderão ser chaves para o esclarecimento da tumorigênese

Publicações científicas

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BUENO, ANA CAROLINA; STECCHINI, MONICA F.; MARRERO-GUTIERREZ, JUNIER; MORE, CANDY BELLIDO; LEAL, LETICIA FERRO; GOMES, DEBORA CRISTIANE; DE LIMA NETO, DANIEL FERREIRA; BRANDALISE, SILVIA REGINA; CARDINALLI, IZILDA APARECIDA; YUNES, JOSE ANDRES; et al. Vitamin D receptor hypermethylation as a biomarker for pediatric adrenocortical tumors. EUROPEAN JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY, v. 186, n. 5, p. 13-pg., 2022-05-01. (15/19663-5, 20/03835-0, 14/03989-6, 19/00860-6)

SOARES MOTA, JOSE ITALO; PATRICIO SILVA-JUNIOR, RUI MILTON; MARTINS, CLARISSA SILVA; BUENO, ANA CAROLINA; WILDEMBERG, LUIZ EDUARDO; DA SILVA ANTUNES, XIMENE LIMA; OKANOBO OZAKI, JORGE GUILHERME; COELI-LACCHINI, FERNANDA BORCHERS; GARCIA-PERAL, CARLOS; ROCHA OLIVEIRA, ANTONIO EDSON; et al. Telomere length and Wnt/beta-catenin pathway in adamantinomatous craniopharyngiomas. EUROPEAN JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY, v. 187, n. 2, p. 12-pg., 2022-08-01. (19/00849-2, 14/03989-6, 19/00860-6)

BUENO, ANA CAROLINA; MORE, CANDY BELLIDO; MARRERO-GUTIERREZ, JUNIER; SILVA, DANILLO C. DE ALMEIDA E.; LEAL, LETICIA FERRO; MONTALDI, ANA PAULA; RAMALHO, FERNANDO SILVA; NICOLIELLO VENCIO, RICARDO ZORZETTO; DE CASTRO, MARGARET; ANTONINI, SONIR ROBERTO R.. Vitamin D receptor activation is a feasible therapeutic target to impair adrenocortical tumorigenesis. Molecular and Cellular Endocrinology, v. 558, p. 14-pg., 2022-09-02. (21/04368-9, 15/19663-5, 17/17737-7, 22/04883-3, 14/03989-6, 19/00860-6)

BUENO, ANA CAROLINA; DA SILVA, RUI M. P.; STECCHINI, MONICA F.; MARRERO-GUTIERREZ, JUNIER; DE ALMEIDA E SILVA, DANILLO C.; CARDINALLI, IZILDA; SCRIDELI, CARLOS ALBERTO; JUNQUEIRA, THAIS; MOLINA, CARLOS A. F.; RAMALHO, FERNANDO SILVA; et al. DNA methylation is a comprehensive marker for pediatric adrenocortical tumors. Endocrine-Related Cancer, v. 29, n. 11, p. 15-pg., 2022-11-01. (20/03835-0, 19/00860-6, 21/04368-9, 19/00849-2, 14/03989-6)