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Em tempo real, rápida detecção e sequenciamento de arbovírus no Brasil: Zika, Dengue, Chikungunya e Febre Amarela

Processo: 18/17176-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2019
Vigência (Término): 31 de outubro de 2021
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Ester Cerdeira Sabino
Beneficiário:Ingra Morales Claro
Instituição-sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):19/25047-6 - Estabelecendo uma rápida abordagem móvel para detectar novas epidemias, BE.EP.DD
Assunto(s):Doenças negligenciadas   Análise de sequência de DNA   Tempo-real   Arbovirus   Vírus Zika   Dengue   Febre de Chikungunya   Febre amarela   Brasil

Resumo

As infecções por arbovírus no Brasil, incluindo os Vírus Zika, Chikungunya, Dengue e Febre Amarela, resultam em considerável morbidade e mortalidade, sendo grandes preocupações de saúde pública. No entanto, a nossa compreensão a respeito destes surtos é dificultada devido à disponibilidade limitada de dados de vigilância epidemiológica. Usualmente, estes dados são gerados por ensaios de diagnóstico molecular em que os testes de padronização são caros e carecem de maior especificidade. Consequentemente, temos uma compreensão limitada das interações entre arbovírus em populações humanas e de mosquitos no Brasil, como demonstrado anteriormente pelo vírus Zika em que sua detecção foi adiada pelo menos um ano após o início do surto. Recentemente fomos pioneiros de uma nova abordagem para a vigilância de arboviroses usando um sequenciador portátil, que utiliza tecnologia a base de nanopores para o sequenciamento de genomas em tempo real - chamada "epidemiologia genômica". Isso permite uma detecção sensível que pode ser atribuída a diversos genótipos virais. No entanto, atualmente, os custos e a complexidade desta poderosa técnica (cerca de U$ 100) impedem sua utilização como uma ferramenta de vigilância de rotina em ambientes de laboratório de pesquisa e de saúde pública. Nesta proposta pretendemos resolver três problemas prementes com o sequenciamento portátil para detecção de arbovírus - custo, tempo e complexidade. Continuando uma colaboração altamente produtiva entre a Universidade de São Paulo, a Universidade de Birmingham e a Universidade de Nottingham, que já resultou em publicações de alto impacto nas revistas Nature e Nature Protocols (Faria et al. 2017; Quick et al. 2017), este projeto terá um impacto imediato sobre a vigilância de arbovírus no Brasil e nossa compreensão deste urgente problema de saúde pública. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Brasil vem sofrendo ‘apagão’ de dados genômicos do SARS-CoV-2 nos últimos meses, dizem pesquisadores 
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SindServ Barueri: Brasileira que sequenciou coronavírus: ‘Ciência não se faz sem recursos’ – 10/03/2020 (10/Mar/2020)
Jornal Página do Estado: “Ciência não se faz sem recursos”, diz pesquisadora brasileira (10/Mar/2020)
Jornal Página do Estado: Cientista tem que começar a falar com o público, diz pesquisadora (10/Mar/2020)
Portal Aqui em Goiás: Cientista tem que começar a falar com o público, diz pesquisadora (10/Mar/2020)
Sindireceita - Sindicato Nacional dos Analistas-Tributários da Receita Federal do Brasil: Cientista tem que começar a falar com o público, diz pesquisadora (10/Mar/2020)
Folha Extra: Cientista tem que começar a falar com o público, diz pesquisadora (10/Mar/2020)
Ler News: Cientista tem que começar a falar com o público, diz pesquisadora (10/Mar/2020)
Blog H News (Irã): Cientista tem que começar a falar com o público, diz pesquisadora (10/Mar/2020)
Bahia Diário: Cientista tem que começar a falar com o público, diz pesquisadora (10/Mar/2020)
Sem Limites News: Cientista tem que começar a falar com o público, diz pesquisadora (10/Mar/2020)
Portal do Norte: Cientista tem que começar a falar com o público, diz Ester Sabino (10/Mar/2020)
Jornal A Folha do Sudoeste online: Cientista tem que começar a falar com o público, diz pesquisadora (10/Mar/2020)
Web Rádio Mandaguaçu: Cientista tem que começar a falar com o público, diz pesquisadora (10/Mar/2020)
Rondônia In Foco: Cientista tem que começar a falar com o público, diz pesquisadora (10/Mar/2020)
Fundacred: Conheça as cinco pesquisadoras que sequenciaram o genoma do coronavírus (09/Mar/2020)
Guajara Hoje: Conheça as mulheres que pesquisam genoma do coronavírus (09/Mar/2020)
O Imparcial (São Luís, MA) online: Conheça as cientistas que sequenciaram o genoma do coronavírus (08/Mar/2020)
Mais Goiás: Pesquisadoras a USP dão exemplo de eficácia na luta contra coronavírus (08/Mar/2020)
Contexto Exato: Amor pela pesquisa. Cinco mulheres que mudaram a ciência (08/Mar/2020)
Central das Notícias: Conheça as cientistas que sequenciaram o genoma do coronavírus (08/Mar/2020)
Central das Notícias: Pesquisadoras a USP dão exemplo de eficácia na luta contra coronavírus (08/Mar/2020)
Portal Aqui em Goiás: Pesquisadoras a USP dão exemplo de eficácia na luta contra coronavírus (08/Mar/2020)
Blog de Luciano Siqueira: Mulheres cientistas vitoriosas (07/Mar/2020)
ODTUR - Turismo e Políticas Públicas: Sequenciar coronavírus só foi possível com investimento público, diz cientista (06/Mar/2020)
SERJUSMIG - Sindicato dos Servidores da Justiça de Primeira Instância de Minas Gerais: Sequenciar coronavírus só foi possível com investimento público, diz cientista (06/Mar/2020)
CONDSEF - Confederação dos Trabalhadores do Serviço Público Federal: Sequenciar coronavírus só foi possível com investimento público, diz cientista (06/Mar/2020)
Contexto Exato: Sequenciar coronavírus só foi possível com investimento público, diz cientista (05/Mar/2020)
SINASEFE IFSul - Sindicato Nacional dos Servidores Federais da Educação Básica, Profissional e Tecnológica - Seção Sindical IFSul: Sequenciar coronavírus só foi possível com investimento público, diz cientista (05/Mar/2020)
CTB - Central dos Trabalhadores e Trabalhadoras do Brasil: Sequenciar coronavírus só foi possível com investimento público, diz cientista (05/Mar/2020)
Terra: Liderado por mulheres, grupo que sequenciou genoma do coronavírus vive fama repentina (04/Mar/2020)
MSN: Liderado por mulheres, grupo que sequenciou genoma do coronavírus vive fama repentina (04/Mar/2020)
Agência Patrícia Galvão: Liderado por mulheres, grupo da USP que sequenciou genoma do coronavírus vive fama repentina (04/Mar/2020)
IE - Instituto de Engenharia: Liderado por mulheres, grupo que sequenciou genoma do coronavírus vive fama repentina (04/Mar/2020)
Tecmundo: Duas brasileiras sequenciaram o genoma do coronavírus em 48 horas (04/Mar/2020)
Jornais Virtuais: Liderado por mulheres, grupo de pesquisa que sequenciou genoma do coronavírus vive fama repentina (04/Mar/2020)
Ufw: Liderado por mulheres, grupo que sequenciou genoma do coronavírus vive fama repentina (04/Mar/2020)
Press From Brasil (EUA): Liderado por mulheres, grupo de pesquisa que sequenciou genoma do coronavírus vive fama repentina (04/Mar/2020)
Contexto Exato: Liderado por mulheres, grupo que sequenciou genoma do coronavírus vive fama repentina (04/Mar/2020)
Central das Notícias: Liderado por mulheres, grupo de pesquisa que sequenciou genoma do coronavírus vive fama repentina (04/Mar/2020)
Central das Notícias: Liderado por mulheres, grupo que sequenciou genoma do coronavírus vive fama repentina (04/Mar/2020)
Thunder Cheats: Duas brasileiras sequenciaram o genoma do coronavírus em 48 horas (04/Mar/2020)
Gazeta online: Coronavírus: Cientistas brasileiros identificam mutações no genoma (03/Mar/2020)
Ufw: Conheça as cientistas que sequenciaram o genoma do coronavírus (01/Mar/2020)
Midia News Campo Grande: Cientista tem que começar a falar com o público, diz pesquisadora (01/Mar/2020)
Portal dos 3: As brasileiras que sequenciaram o genoma do coronavírus (29/Fev/2020)
Nota Diária: “Ciência não se faz sem recursos”, diz pesquisadora brasileira (04/Fev/2020)
Replicário: As brasileiras que sequenciaram o genoma do coronavírus (03/Fev/2020)
Nh Tv: Conheça as cinco pesquisadoras que sequenciaram o genoma do coronavírus (08/Mar/2020)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CANDIDO, DARLAN S.; CLARO, INGRA M.; DE JESUS, JAQUELINE G.; SOUZA, WILLIAM M.; MOREIRA, FILIPE R. R.; DELLICOUR, SIMON; MELLAN, THOMAS A.; DU PLESSIS, LOUIS; PEREIRA, RAFAEL H. M.; SALES, FLAVIA C. S.; MANULI, ERIKA R.; THEZE, JULIEN; ALMEIDA, LUIZ; MENEZES, MARIANE T.; VOLOCH, CAROLINA M.; FUMAGALLI, MARCILIO J.; COLETTI, THAIS M.; SILVA, CAMILA A. M.; RAMUNDO, MARIANA S.; AMORIM, MARIENE R.; HOELTGEBAUM, HENRIQUE H.; MISHRA, SWAPNIL; GILL, MANDEV S.; CARVALHO, LUIZ M.; BUSS, LEWIS F.; PRETE JR, CARLOS A.; ASHWORTH, JORDAN; NAKAYA, I, HELDER; PEIXOTO, PEDRO S.; BRADY, OLIVER J.; NICHOLLS, SAMUEL M.; TANURI, AMILCAR; ROSSI, ATILA D.; BRAGA, V, CARLOS K.; GERBER, ALEXANDRA L.; GUIMARAES, ANA PAULA DE C.; GABURO JR, NELSON; ALENCAR, CECILA SALETE; FERREIRA, ALESSANDRO C. S.; LIMA, CRISTIANO X.; LEVI, JOSE EDUARDO; GRANATO, CELSO; FERREIRA, GIULIA M.; FRANCISCO JR, RONALDO S.; GRANJA, FABIANA; GARCIA, MARCIA T.; MORETTI, MARIA LUIZA; PERROUD JR, MAURICIO W.; CASTINEIRAS, TEREZINHA M. P. P.; LAZARI, CAROLINA S.; HILL, SARAH C.; DE SOUZA SANTOS, ANDREZA ARUSKA; SIMEONI, CAMILA L.; FORATO, JULIA; SPOSITO, ANDREI C.; SCHREIBER, ANGELICA Z.; SANTOS, MAGNUN N. N.; DE SA, CAMILA ZOLINI; SOUZA, RENAN P.; RESENDE-MOREIRA, LUCIANA C.; TEIXEIRA, MAURO M.; HUBNER, JOSY; LEME, PATRICIA A. F.; MOREIRA, RENNAN G.; NOGUEIRA, MAURICIO L.; FERGUSON, NEIL M.; COSTA, SILVIA F.; PROENCA-MODENA, JOSE LUIZ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R.; BHATT, SAMIR; LEMEY, PHILIPPE; WU, CHIEH-HSI; RAMBAUT, ANDREW; LOMAN, NICK J.; AGUIAR, RENATO S.; PYBUS, OLIVER G.; SABINO, ESTER C.; FARIA, NUNO RODRIGUES; DISCOVERY, BRAZIL-UK CTR ARBOVIRUS. Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil. Science, v. 369, n. 6508, SI, p. 1255+, SEP 4 2020. Citações Web of Science: 1.

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