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Genoma de Gracilaria domingensis, uma macroalga de importância econômica e ambiental

Processo: 18/26220-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de abril de 2019
Vigência (Término): 31 de março de 2021
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Oceanografia - Oceanografia Biológica
Pesquisador responsável:Pio Colepicolo Neto
Beneficiário:Natalia Nakamura Gouvea
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo, SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:16/06931-4 - Biodiversidade e prospecção de algas de águas tropicais e da Antártica marítima, AP.BTA.TEM
Assunto(s):Biologia computacional

Resumo

Gracilaria domingensis é uma típica alga vermelha brasileira. Além essencial para o ecossistema costeiro, tem grande importância econômica por ser fonte de extração de ficocolóides (ágar-ágar) e metabólitos secundários que apresentam uma larga aplicação industrial e biotecnológica. Muitas vias metabólicas têm sido elucidadas a partir de ferramentas de biologia molecular, abrindo o caminho para a geração de novos metabólitos bioativos em grande quantidade. Este projeto visa montar sequências (PacBio) para produzir scaffolds do genoma e anotar genes visando a descoberta de vias síntese de ágar e carboidratos em geral, transportadores de metais, metabolismo de halogênios, assimilação de nitrogênio, stress oxidativo e multicelularidade (processamento de RNA e fatores de transcrição), além de realizar uma análise comparativa com outros genomas. Para isso será selecionado um bioinformata para utilização e desenvolvimento de programas para montagem e anotação de genomas de eucariotos, como descritos no projeto. Espera-se criar bases para o estabelecimento de um novo organismo modelo brasileiro que permitirá o enriquecimento da ciência nacional nas áreas de biologia molecular e bioquímica de plantas, biorremediação, ecotoxicologia e bioprospeção de bioativos.