Dinâmica funcional da proteína Orc1b: análise por ChIP-seq

• Processo: 19/04483-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 20 de maio de 2019
• Data de Término da vigência: 27 de julho de 2019
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia
• Pesquisador responsável: Maria Carolina Quartim Barbosa Elias Sabbaga
• Beneficiário: Marcela de Oliveira Vitarelli
• Supervisor: Nicolai Siegel
• Instituição Sede: Instituto Butantan. São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Ludwig Maximilian University of Munich (LMU Munich), Alemanha
• Vinculado à bolsa: 17/07693-2 - Dinâmica funcional da proteína Orc1b durante o ciclo de vida de Trypanosoma, BP.DR
• Assunto(s): Trypanosoma
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: ChIP-seq | TcOrc1b | Trypanosoma | Replicação do DNA de Trypanosoma

Resumo

Trypanosoma cruzi é um protozoário pertencente a família Trypanosomatidae e é o agente etiológico da doença de Chagas, uma doença negligenciada que afeta milhões de pessoas em todo o mundo. Esse parasita alterna entre as formas replicativas (epi e amastigotas) e não replicativas (tripomastigotas) em seus hospedeiros, necessitando de um intenso controle na replicação do DNA, o que envolve a ação coordenada de diversas proteínas. A replicação do DNA se inicia com a montagem de um dos complexos de pré-replicação (pré-RC), o complexo ORC, nas origens de replicação, localizadas próximas aos nucleossomos. Seguida pelo recrutamento de outras proteínas do pré-RC, incluíndo a proteína Orc1b, cuja função ainda não foi elucidada. Análises preliminares de Marques et al., 2016 indicam que Orc1b participa como um regulador positivo na replicação ao invés de possuir um papel puramente estrutural no complexo ORC e análises preliminares do nosso grupo sugerem a ligação de Orc1b ao DNA. Assim, esse projeto visa aprofundar os estudos do papel desempenhado pela proteína Orc1b na replicação do DNA de T. cruzi e seus possíveis interatores. Mais especificamente, esse projeto visa determinar a sequência específica de DNA a qual Orc1b se liga por ChIP-seq para avaliar o papel dessa proteína no complexo de pré-replicação, a ser desenvolvido no laboratório The Siegel Lab, no Biomedical Center Munich, na Ludwig-Maximilians-Universitat, em Munique, Alemanha. O conhecimento adquirido será empregado no desenvolvimento de futuras estratégias anti-parasitárias e na compreensão da biologia do parasita.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

VITARELLI, MARCELA DE OLIVEIRA; FRANCO, THIAGO ANDRADE; PIRES, DAVID DA SILVA; LIMA, ALEX RANIERI JERONIMO; VIALA, VINCENT LOUIS; KRAUS, AMELIE JOHANNA; DE AZEVEDO, INACIO DE LOIOLA MEIRELLES JUNQUEIRA; DA CUNHA, JULIA PINHEIRO CHAGAS; ELIAS, MARIA CAROLINA. Integrating high-throughput analysis to create an atlas of replication origins in Trypanosoma cruzi in the context of genome structure and variability. MBIO, v. 15, n. 4, p. 25-pg., 2024-03-05. (16/50050-2, 19/04483-2, 13/07467-1, 20/00694-6, 17/07693-2, 22/01900-4)

ROSON, JULIANA NUNES; VITARELLI, MARCELA DE OLIVEIRA J.; COSTA-SILVA, HELLIDA MARINA; PEREIRA, KAMILLE SCHMITT; PIRES, DAVID DA SILVA; LOPES, LETICIA DE SOUSA; CORDEIRO, BARBARA; KRAUS, AMELIE; CRUZ, KARIN NAVARRO TOZZI; CALDERANO, SIMONE GUEDES; et al. 2B.V demarcates divergent strand-switch regions, some tDNA loci, and genome compartments in Trypanosoma cruzi and affects parasite differentiation and host cell invasio. PLOS PATHOGENS, v. 18, n. 2, FEB 2022. (18/15553-9, 16/50050-2, 17/06104-3, 19/04483-2, 19/16033-1, 13/07467-1, 19/19834-5)