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Metafundadores para predição genômica na raça montana

Processo: 19/05516-1
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 10 de junho de 2019
Vigência (Término): 09 de março de 2020
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Fernando Sebastián Baldi Rey
Beneficiário:Sabrina Kluska
Supervisor no Exterior: Daniela Andressa Lino Lourenco
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Local de pesquisa : University of Georgia (UGA), Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:17/21573-0 - Avaliação genômica em bovinos compostos da raça Montana utilizando dados reais e simulados, aplicando o método do passo único genômico BLUP, BP.DR

Resumo

A busca por metodologias capazes de aumentar a precisão da avaliação genética é constante. No entanto, para populações multirraciais, poucos são os estudos que usam o ssGBLUP e abordagens específicas para essas populações. O objetivo deste projeto de pesquisa é avaliar o impacto do uso de metafundadores na estimação de parâmetros genéticos, valores genéticos genômicos (GEBV), viés e acurácia do GEBV para populações multirraciais e método ssGBLUP. A base de dados é composta por informações fenotípicas de 514.165 animais de raça pura, cruzamentos e animais compostos (Montana). As características de peso ao nascimento(PN), peso à desmama (PD), ganho de peso pós-desmame (GPD) e circunferência escrotal aos 12 meses de idade (CE12)serão utilizadas. Um total de 1.899 animais foram genotipados usando três painéis diferentes com 30, 35 ou 770 mil marcadores SNPs. Posteriormente, todos esses genótipos foram imputados a um painel comercial Profiler (GGP) GeneSeek® da Illumina, contendo aproximadamente 30.000 marcadores SNPs. Análises de uni-características para todas as características descritas acima serão realizadas. Os métodos BLUP, ssGBLUP (BLUP de etapa única) e ssGBLUP + MFS (BLUP de etapa única + metafundadores) serão executados e, em seguida, esses modelos serão comparados entre si. Os resultados deste estudo devem mostrar as vantagens do uso de metafundadores, bem como a implementação do ssGBLUP em uma avaliação multirracial, a fim de aumentar a precisão das avaliações genéticas.

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