Detecção de DNA circulante metilado como biomarcador não invasivo para identificação de pacientes com epilepsia do lobo temporal mesial e acidente vascular cerebral isquêmico

• Processo: 17/26167-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de abril de 2019
• Vigência (Término): 21 de março de 2024
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Iscia Teresinha Lopes Cendes
• Beneficiário: Danielle do Carmo Ferreira Bruno
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/07559-3 - Instituto Brasileiro de Neurociência e Neurotecnologia - BRAINN, AP.CEPID
• Bolsa(s) vinculada(s): 20/16213-7 - Análise multiômica do reguloma e transcriptoma em resolução de uma célula-única na epilepsia do lobo temporal mesial com esclerose hipocampal, BE.EP.PD
• Assunto(s): Biomarcadores Neurologia Metilação
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Acidente vascular cerebral isquêmico | Biomarcador | DNA livre circulante | epilepsia do lobo temporal mesial | metilação | Neurologia

Resumo

O diagnóstico de pacientes com acidente vascular cerebral (AVC) e epilepsia, pode representar ainda hoje um grande desafio, uma vez que é baseado em conjunto de sinais e sintomas clínicos subjetivos. Portanto, a identificação de biomarcadores para o diagnóstico e para o estabelecimento de prognóstico torna-se essencial. DNAs circulantes livres de células (cfDNA) metilados tem surgido recentemente como candidatos à biomarcadores, já que podem ser facilmente analisados e quantificáveis de forma não invasiva. Além disso, os padrões de metilação do DNA específicos de uma doença podem sofrer mudanças em resposta ao tratamento, aumentando a possibilidade de que biomarcadores baseados em metilação de DNA sejam utilizados para o monitoramento de eficácia ao tratamento. Neste contexto, o objetivo principal deste projeto é investigar se cfDNA diferencialmente metilado pode ser utilizado para auxiliar no diagnóstico, no estabelecimento de prognóstico e na predição de resposta ao tratamento nas epilepsias e no AVC. Serão estudados 100 pacientes com epilepsia, 100 com AVC, e 100 indivíduos controle. Todos os pacientes incluídos no estudo são seguidos prospectivamente no HC-UNICAMP de acordo com um protocolo de pesquisa detalhado que inclui extensa avaliação clínica e de neuroimagem. Toda a informação fenotípica é incluída em banco de dados construído especialmente para os projetos de pesquisa. A determinação do padrão global de metilação do cfDNA será feita pelo sequenciamento completo do DNA livre do plasma tratado com bissulfito (WGBS). Posteriormente, os pacientes serão sub-divididos em grupos de acordo com a resposta ao tratamento e com o prognóstico. Se houver necessidade pacientes adicionais poderão ser incluídos em estudos confirmatórios, uma vez que nosso biobanco possui hoje amostras de mais de 700 pacientes com epilepsia e 300 pacientes com AVC. Estudos em epilepsia e no AVC são o foco principal de pesquisa do CEPID-BRAINN. Além disso, a comparação do padrão de metilação de cfDNA entre essas duas condições neurológicas é de interesse no estudo dos mecanismos de dano e plasticidade cerebral.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

D.C.F. BRUNO; A. DONATTI; M. MARTIN; V.S. ALMEIDA; J.C. GERALDIS; F.S. OLIVEIRA; D.B. DOGINI; I. LOPES-CENDES. Circulating nucleic acids in the plasma and serum as potential biomarkers in neurological disorders. Brazilian Journal of Medical and Biological Research, v. 53, n. 10, 2020-08-17. (16/26172-0, 13/07559-3, 17/26167-0, 15/19768-1, 17/23954-0, 15/25607-0)

BRUXEL, ESTELA M.; BRUNO, DANIELLE C. F.; DO CANTO, AMANDA M.; GERALDIS, JAQUELINE C.; GODOI, ALEXANDRE B.; MARTIN, MARIANA; LOPES-CENDES, ISCIA. Multi-omics in mesial temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis: Clues into the underlying mechanisms leading to disease. SEIZURE-EUROPEAN JOURNAL OF EPILEPSY, v. 90, n. SI, p. 34-50, AUG 2021. (20/06168-4, 19/25948-3, 18/03254-7, 19/20953-9, 19/00213-0, 17/26167-0)

BRUXEL, ESTELA M.; DO CANTO, AMANDA M.; BRUNO, DANIELLE C. F.; GERALDIS, JAQUELINE C.; LOPES-CENDES, ISCIA. Multi-omic strategies applied to the study of pharmacoresistance in mesial temporal lobe epilepsy. EPILEPSIA OPEN, OCT 2021. (19/25948-3, 20/06168-4, 13/07559-3, 18/03254-7, 17/26167-0)